[发明专利]一种微生物总基因组DNA的提取方法无效
申请号: | 201110405923.1 | 申请日: | 2011-12-08 |
公开(公告)号: | CN102409041A | 公开(公告)日: | 2012-04-11 |
发明(设计)人: | 王亭芳;常忠义;高红亮;赵云龙;金风杰 | 申请(专利权)人: | 华东师范大学 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 上海麦其知识产权代理事务所(普通合伙) 31257 | 代理人: | 董红曼 |
地址: | 200062 上*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 微生物 基因组 dna 提取 方法 | ||
1.一种微生物总基因组DNA的提取方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)将TENP洗液加入待提取样品中,再经过8000rpm,4℃,离心得到沉淀;
(2)向所述沉淀加入裂解液和溶菌酶溶液,于37℃进行水浴后,充分涡旋震荡;
(3)加入SDS溶液和蛋白酶K溶液,依次于55℃、70℃下进行水浴,于17000g,4℃,离心得上清;
(4)用等体积的酚/氯仿/异戊醇抽提液对所述步骤(3)得到的上清进行抽提,经离心得上清,重复用等体积的酚/氯仿/异戊醇抽提液抽提一次;
(5)用等体积的氯仿/异戊醇抽提液抽提,离心得上清;
(6)向所述步骤(5)得到的上清中加入异丙醇,室温下静置,离心得到DNA沉淀;
(7)用乙醇将所述DNA沉淀重悬,离心后弃上清,经干燥得到沉淀;
(8)用TE溶液将所述步骤(7)得到的沉淀溶解,得到所述微生物总基因组DNA,置于-20℃保存备用。
2.如权利要求1所述的微生物总基因组DNA的提取方法,其特征在于,当所述待提取样品是含有水分的,所述步骤(2)中进行水浴前还加入玻璃珠,并对待提取样品进行涡旋震荡。
3.如权利要求1所述的微生物总基因组DNA的提取方法,其特征在于,所述的步骤(1)中TENP洗液pH为8~10,添加量为1.5~3mL,优选添加量为2mL。
4.如权利要求2所述的微生物总基因组DNA的提取方法,其特征在于,所述TENP洗液成分为50 m mol/L Tris,20 m mol/L EDTA,l00 m mol/L NaCl,0.5%~2.5%w/v聚乙烯基吡咯烷酮;其中,聚乙烯基吡咯烷酮的优选添加量为1%w/v。
5.如权利要求1所述的微生物总基因组DNA的提取方法,其特征在于,所述的步骤(2)中,所述裂解液成分为1M Tris-HCl,0.5M EDTA,0.5M Na3PO4,1.5M NaCl,1% CTAB;所述溶菌酶溶液添加量为200~400μL,浓度为10-80mg/mL。
6.如权利要求1所述的微生物总基因组DNA的提取方法,其特征在于,所述的步骤(3)中,SDS溶液浓度为20%~25%w/v,添加量为100~200μL;蛋白酶K浓度为15-30mg/mL,添加量为50~100μL。
7.如权利要求1所述的微生物总基因组DNA的提取方法,其特征在于,所述的步骤(4)中酚/氯仿/异戊醇抽提液中酚、氯仿、异戊醇的体积比例为25:24:1。
8.如权利要求1所述的微生物总基因组DNA的提取方法,其特征在于,所述的步骤(5)中氯仿/异戊醇抽提液中氯仿、异戊醇的体积比例为24:1。
9.如权利要求1所述的微生物总基因组DNA的提取方法,其特征在于,所述的步骤(6)中所述异丙醇的加入体积是步骤(5)得到的上清体积的0.6倍。
10.如权利要求1所述的微生物总基因组DNA的提取方法,其特征在于,所述的步骤(7)中所述乙醇为预冷的70%乙醇,添加量为1~1.5mL。
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