[发明专利]热稳定性提高的脂肪酶突变体及其构建方法有效
申请号: | 201110406922.9 | 申请日: | 2011-12-08 |
公开(公告)号: | CN102660517A | 公开(公告)日: | 2012-09-12 |
发明(设计)人: | 冯雁;谢渊;杨广宇 | 申请(专利权)人: | 上海交通大学 |
主分类号: | C12N9/20 | 分类号: | C12N9/20;C12N15/55;C12N15/63;C12N1/21 |
代理公司: | 上海科盛知识产权代理有限公司 31225 | 代理人: | 杨元焱 |
地址: | 200240 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 热稳定性 提高 脂肪酶 突变体 及其 构建 方法 | ||
1.一种热稳定性提高的脂肪酶突变体,其特征在于:由南极假丝酵母脂肪酶B基因出发,运用多轮定点饱和突变而获得;所述南极假丝酵母脂肪酶B具有SEQ ID No:1所示的氨基酸残基序列;所述脂肪酶突变体具有SEQ ID No:2、SEQ ID No:3或SEQ ID No:4所示的氨基酸残基序列,SEQ ID No:2、SEQ ID No:3和SEQ ID No:4均由317个氨基酸组成。
2.根据权利要求1所述的热稳定性提高的脂肪酶突变体的构建方法,其特征在于:包括以下步骤:
A、南极假丝酵母脂肪酶B基因的克隆
对南极假丝酵母脂肪酶B基因通过上游引物和下游引物扩增目的基因;
上游引物:5’-AATACCATGGCTCTACCTTCCGGTTCG-3’,带下划线碱其为限制性内切酶NcoI识别位点;
下游引物:5’-TAACTCGAGGGGGGTGACGATGCCGGA-3’,带下划线碱基为限制性内切酶XhoI识别位点;
以Takara的PrimeSTAR为聚合酶,在上游引物和下游引物的参与下进行PCR反应,得到PCR扩增产物;DpnI消化模板,回收,纯化该目的片段,将其用限制性内切酶NcoI和XhoI进行双酶切后与经同样酶双酶切的质粒pET22b(Novagen)进行连接,将连接产物转化到大肠杆菌Rosetta(DE3)感受态细胞中,将转化细胞涂布于含有100ug/ml氨苄的LB平板上筛选阳性克隆,得到重组质粒,将该重组质粒命名为pET22b-CALB;
B、南极假丝酵母脂肪酶B的结构分析及热点确定
对南极假丝酵母脂肪酶B的晶体结构进行分析(ID:1TCA),脂肪酶的催化三联体为:自N端起第104位的丝氨酸、第187位的天冬氨酸和第224位的组氨酸,选取催化丝氨酸周围的氨基酸残基进行B因子的分析,确定下列B因子较高的残基作为饱和突变的热点:自N端起第278位亮氨酸,285位缬氨酸,277位亮氨酸,281位甘氨酸,223位天冬氨酸;
C、南极假丝酵母脂肪酶B突变体库的建立及突变体的筛选
C1、根据热点构建饱和突变体库并导入宿主细胞
以重组质粒pET22b-CALB作为模板,针对步骤B中确定的热点,分别在与第278位亮氨酸、第285位缬氨酸、第277位亮氨酸、第281位甘氨酸和第223位天冬氨酸相对应的核苷酸处利用NNK代替原有密码子,设计简并引物,并进行全质粒PCR反应,构建5个定点饱和突变PCR扩增产物,反应结束后,DpnI消化模板,回收,纯化后的PCR产物直接电击导入大肠杆菌Rosetta(DE3)中,将转化后的大肠杆菌直接涂布于含有100ug/ml氨苄和含有2%(v/v)乳化好的三丁酸甘油脂的LB抗性平板上,在37℃下培养16-24小时,得到针对5个热点的饱和突变体库;
C2、从饱和突变体库中筛选热稳定性提高的突变体
将步骤C 1中37℃培养后的LB抗性平板在4℃下放置1天,进行初步筛选,将产生透明圈的菌落,接种于含有100ug/ml氨苄LB培养基的96孔板中,于37℃过夜培养,得到分属5个突变体库的母板;
从培养好的母板中吸取20ul液体至新的含有100ug/ml氨苄LB培养基的96孔板中,37℃培养3h,4℃放置30min,再加入终浓度为1mM的IPTG,15℃培养24h;
利用冻融破碎的方法裂解菌体,得到粗酶液;将所得到的粗酶液在49℃下孵育15min,再于冰上放置10min,室温放置15min,测定每孔的残余活力;
将从5个突变体库中筛选到的阳性突变体接入5ml小试管中,至OD600为0.6-0.8时,加入IPTG至终浓度1mM,15℃诱导表达,超声破碎后测定粗酶液的T5015,确定热稳定性最高的突变体,进行测序,至此,完成了第一轮筛选,得到两个热点的优秀突变体,分别是D223G和L278M;
以L278M的基因作为模板,进行迭代饱和突变:针对285位缬氨酸、277位亮氨酸、281位甘氨酸和223位天冬氨酸位点设计饱和突变库,并参考上述步骤进行新一轮的筛选;
经过多轮的迭代饱和突变,获得了三株热稳定性明显提高的菌株,测定脂肪酶核苷酸序列得出三株突变体分别为:Asp223Gly、Leu278Met和Asp223Gly/Leu278Met。
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