[发明专利]在不同的宫颈病变中的HR-HPV的诊断转录物和剪接模式

权利要求书

1.一种用于在具有HR-HPV的受试者中区分(i) HR-HPV感染的严重形式和(ii) HR-HPV感染的轻度形式的方法，所述受试者不包含整合形式的HR-HPV基因组，所述方法包括下述步骤：

a)在所述受试者的样品中，测定E1C的基因产物的存在或缺失，和

b)区分(i) HR-HPV感染的严重形式和(ii) HR-HPV感染的轻度形式。

2.根据权利要求1所述的方法，其中所述E1C的基因产物是E1的剪接转录物。

3.根据权利要求2所述的方法，其中所述HR-HPV和对应的E1剪接转录物是

a) HPV18和包含929^2779连接点的剪接转录物，

b) HPV33和包含894^2702连接点的剪接转录物，

c) HPV35和包含883^2649连接点的剪接转录物，

d) HPV52和包含879^2696连接点的剪接转录物，或

e) HPV58和包含898^2706连接点的剪接转录物。

4.根据权利要求2所述的方法，其中所述转录物的存在或缺失的测定包括下述步骤：如果所述转录物存在，则用特异性地扩增所述转录物的寡核苷酸扩增所述转录物，并测定如此扩增的转录物的量。

5.根据权利要求1所述的方法，其中所述E1C的基因产物是细胞从E1的剪接转录物翻译出的多肽。

6.根据权利要求1所述的方法，其中所述E1C的基因产物是多肽。

7.根据权利要求1所述的方法，其中所述E1C的基因产物的存在指示HR-HPV感染的严重形式。

8.根据权利要求1所述的方法，其中所述E1C的基因产物的缺失指示HR-HPV感染的轻度形式。

9.根据权利要求1所述的方法，其中

a) HR-HPV是HPV18，且其中E1C的基因产物是包含929^2779连接点的转录物，

b) HR-HPV是HPV33，且其中E1C的基因产物是包含894^2702连接点的转录物，或

c) HR-HPV是HPV35，且其中E1C的基因产物是包含883^2649连接点的转录物。

10.根据权利要求2所述的方法，其中测定E1C的剪接转录物的存在或缺失包括：PCR扩增所述E1C的剪接转录物。

11.根据权利要求11所述的方法，其中PCR扩增使用引物的混合物。

12.根据权利要求2所述的方法，其中使用特异性地检测所述转录物的探针寡核苷酸，测定所述转录物的存在。

13.根据权利要求1所述的方法，所述方法包括下述额外步骤：评估在所述受试者的所述样品中的HR-HPV基因组的整合状态。

14.一种用于在具有HR-HPV的受试者中区分(i) HR-HPV感染的严重形式和(ii) HR-HPV感染的轻度形式的方法，所述方法包括下述步骤：

a)测定在所述受试者的样品中的第一种基因产物的量，所述第一种基因产物是E1C的基因产物，

b)测定所述样品中第二种基因产物的量，

c)计算在步骤a)中测得的所述第一种基因产物的量与在步骤b)中测得的所述第二种基因产物的量之比例，

d)将在步骤c)中计算出的比例与参照比例进行对比，和

e)区分(i) HR-HPV感染的严重形式和(ii) HR-HPV感染的轻度形式。

15.根据权利要求14所述的方法，其中所述第二种基因产物选自：E6*I的基因产物、E1^E4的基因产物、Apm1的基因产物、Ubc的基因产物、U1A的基因产物、E1的基因产物、E5的基因产物和L1的基因产物。

16.根据权利要求15所述的方法，其中所述第一种基因产物是E1C的剪接转录物，且其中所述第二种基因产物是选自下述的转录物：E6*I的转录物、E1^E4的转录物、Apm1的转录物、Ubc的转录物、U1A的转录物、E1的转录物、E5的转录物和L1的转录物。