[发明专利]与囊性纤维化关联的突变有效

专利信息
申请号: 201180022402.6 申请日: 2011-03-22
公开(公告)号: CN103025889A 公开(公告)日: 2013-04-03
发明(设计)人: N·纳甘;E·M·罗尔夫斯;D·A·西尔科-奥萨德萨;L·S·罗森布拉姆;Z·周;R·A·海姆 申请(专利权)人: 艾索特里克斯遗传实验室有限责任公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 中国国际贸易促进委员会专利商标事务所 11038 代理人: 罗菊华
地址: 美国北*** 国省代码: 美国;US
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摘要:
搜索关键词: 纤维化 关联 突变
【权利要求书】:

1.方法,其包括:

测试从受试者获得的样品以测定囊性纤维化跨膜传导调节物(CFTR)基因或蛋白中选自表1,2,3或4的一个或更多突变的存在,

其中一个或更多突变的存在指示受试者

具有囊性纤维化(CF)或CF相关的病症,

处于发展CF或CF相关的病症的风险,或

是CFTR突变的载体。

2.权利要求1的方法,其中一个或更多突变选自表1,2或3。

3.权利要求1的方法,其中一个或更多突变选自表1或2。

4.权利要求1的方法,其中一个或更多突变选自表1。

5.权利要求1的方法,其中一个或更多突变是CFTR突变盘的部分。

6.前述权利要求之任一项的方法,其中样品包含核酸。

7.权利要求5的方法,其中测试步骤包括核酸测序。

8.权利要求5的方法,其中测试步骤包括杂交。

9.权利要求7的方法,其中杂交使用特异于CFTR基因(SEQ IDNO:1)中对应于选自表1,2,3或4的一个或更多突变的区的一种或更多寡核苷酸探针,且在对于不许单核苷酸错配而言足够严格的条件下进行。

10.权利要求7或8的方法,其中杂交用微阵列进行。

11.权利要求5的方法,其中测试步骤包括限制酶消化。

12.权利要求5的方法,其中测试步骤包括PCR扩增。

13.权利要求11的方法,其中PCR扩增是数字PCR扩增或实时PCR。

14.权利要求5的方法,其中测试步骤包括引物延伸。

15.权利要求13的方法,其中引物延伸是单-碱基引物延伸。

16.权利要求5的方法,其中测试步骤包括进行多重等位基因-特异性引物延伸(ASPE)。

17.权利要求1的方法,其中样品包含蛋白。

18.权利要求16的方法,其中测试步骤包括氨基酸测序。

19.权利要求16的方法,其中测试步骤包括使用特异性识别对应于选自表1,2,3或4的一个或更多突变的一个或更多表位的一种或更多抗体进行免疫测定。

20.权利要求16的方法,其中测试步骤包括蛋白酶消化。

21.权利要求19的方法,其中蛋白酶消化是胰蛋白酶消化。

22.权利要求19的方法,其中测试步骤还包括进行2D-凝胶电泳。

23.权利要求1的方法,其中测试步骤包括使用质量光谱法测定一个或更多突变的存在。

24.权利要求22的方法,其中质量光谱测量形式选自:基质-辅助的激光解吸/电离,飞行时间(MALDI-TOF),电喷射(ES),IR-MALDI,离子回旋加速器共振(ICR),傅里叶变换和其组合。

25.权利要求1的方法,其中样品获自细胞,组织,全血,漱口水,血浆,血清,尿,粪便,唾液,脐带血,绒毛膜绒毛样品,绒毛膜绒毛样品培养物,羊水,羊水培养物,经子宫颈灌洗液,及其组合。

26.权利要求1的方法,其中方法与对于CFTR突变的另外的测试联用。

27.核酸探针,其与正常CFTR基因特异性结合、但不与含有选自表1,2,3或4的一个或更多突变的突变CFTR基因特异性结合。

28.阵列,其包含与正常CFTR基因特异性结合、但不与含有选自表1,2,3或4的一个或更多突变的突变CFTR基因特异性结合的一个或更多探针。

29.核酸探针,其与含有选自表1,2,3或4的一个或更多突变的突变CFTR基因特异性结合、但不与正常CFTR基因特异性结合。

30.阵列,其包含与含有选自表1,2,3或4的一个或更多突变的突变CFTR基因特异性结合、但不与正常CFTR基因特异性结合的一个或更多探针。

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