[发明专利]用于高通量筛选的组合序列条形码

权利要求书

1.至少两个核苷酸序列标识符的组合在制备用于高通量测序的样本DNA中的用途。

2.根据权利要求1的用途，其中在高通量测序中使用多个制备的样本DNA，其中样本DNA的各制备包括至少两个核苷酸序列标识符的独特组合，其中第一核苷酸序列标识符选自一组核苷酸序列标识符，且第二核苷酸序列标识符选自核苷酸序列标识符的组。

3.根据权利要求2的用途，其中除了第一和第二核苷酸序列标识符以外，还使用选自核苷酸序列标识符的组的其它核苷酸序列标识符。

4.根据权利要求1-3的用途，其中制备的样本DNA包括扩增子。

5.根据权利要求1-4的用途，其中制备的样本DNA包括接头连接的DNA片段。

6.根据权利要求1-5的用途，其中制备的样本DNA包括扩增的接头连接的片段和/或接头连接的扩增子。

7.根据权利要求1-6的用途，其中在高通量测序方法中使用制备的样本DNA的单一DNA模板。

8.根据权利要求7的用途，其中单一DNA模板包括两个测序引物结合位点，其中各测序引物结合位点位于不同核苷酸序列标识符的3’。

9.用于鉴定连接的和/或扩增的样本DNA的样本来源的方法，包括：

a）提供接头和/或扩增引物，其中至少第一接头或扩增引物包括选自核苷酸序列标识符的组的第一核苷酸序列标识符，提供第二接头或扩增引物，其包括选自核苷酸序列标识符的组的第二核苷酸序列标识符，其中任选地，提供其它接头或扩增引物，其包括选自核苷酸序列标识符的组的其它核苷酸序列标识符；

b）提供多个样本DNA；

c）使用接头和/或扩增引物在样本DNA上进行连接和/或扩增反应，以提供包括第一、第二和任选其它核苷酸序列标识符的连接的和/或扩增的样本DNA；

d）使用高通量测序确定至少第一、第二和任选其它核苷酸序列标识符的序列；

e）确定连接的和/或扩增的样本DNA的样本来源。

10.用于从多个样本DNA鉴定扩增子样本来源的方法，其包括步骤：

a）提供多个样本DNA；

b）提供一组核苷酸序列标识符；

c）提供第一扩增引物，各第一引物包括选自核苷酸序列标识符的组的第一核苷酸序列标识符；

d）提供第二扩增引物，各第二引物包括选自核苷酸序列标识符的组的第二核苷酸序列标识符；

e）用一对独特的第一和第二扩增引物扩增各样本DNA，得到扩增子；

f）任选地，合并至少部分扩增子；

g）使用高通量测序确定扩增子的第一标识符序列和第二标识符序列的序列；

h）确定扩增子的样本来源。

11.用于从多个样本DNA鉴定接头连接的DNA片段的样本来源的方法，其包括步骤：

a）提供多个样本DNA；

b）提供一组核苷酸序列标识符；

c）提供第一接头，各第一接头包括选自核苷酸序列标识符的组的第一核苷酸序列标识符；

d）提供第二接头，各第二接头包括选自核苷酸序列标识符的组的第二核苷酸序列标识符；

e）各样本DNA进行片段化；

f）将一对独特的第一和第二接头连接至各片段化的样本DNA，得到接头连接的DNA片段；

g）任选地，合并至少部分接头连接的DNA片段；

h）使用高通量测序确定接头连接的DNA片段的第一标识符序列和第二标识符序列的序列；

i）确定接头连接的DNA片段的样本来源。