[发明专利]核糖核酸内切酶组合物及其使用方法有效
申请号: | 201180033802.7 | 申请日: | 2011-05-09 |
公开(公告)号: | CN103038338B | 公开(公告)日: | 2017-03-08 |
发明(设计)人: | R·E·赫维兹;J·A·杜娜;B·维登赫夫特;M·伊内克 | 申请(专利权)人: | 加利福尼亚大学董事会 |
主分类号: | C12N9/22 | 分类号: | C12N9/22;C12N15/55;C12Q1/34;C12Q1/68;G01N33/573 |
代理公司: | 北京龙双利达知识产权代理有限公司11329 | 代理人: | 肖鹂,王君 |
地址: | 美国加利*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 核糖核酸 内切酶 组合 及其 使用方法 | ||
1.一种变体Csy4核糖核酸内切酶,其包含与图6所示的氨基酸序列具有至少约95%氨基酸序列同一性的氨基酸序列,其中所述核糖核酸内切酶包含在His-29处的氨基酸取代,其中在缺乏咪唑时,所述变体Csy4核糖核酸内切酶无酶活性,以及其中在咪唑存在下,所述变体Csy4核糖核酸内切酶可活化。
2.根据权利要求1所述的变体Csy4核糖核酸内切酶,其中所述氨基酸取代是His29至Ala29取代。
3.根据权利要求1所述的变体Csy4核糖核酸内切酶,其中所述变体Csy4核糖核酸内切酶包含提供可检测信号的部分。
4.根据权利要求1所述的变体Csy4核糖核酸内切酶,其中所述提供可检测信号的部分是荧光团、量子点、除所述核糖核酸内切酶之外的酶或者纳米粒子。
5.根据权利要求1所述的变体Csy4核糖核酸内切酶,其中所述核糖核酸内切酶被固定在不溶性支撑物上。
6.根据权利要求5所述的变体Csy4核糖核酸内切酶,其中所述不溶性支撑物是小珠。
7.根据权利要求1所述的变体Csy4核糖核酸内切酶,其中所述变体Csy4核糖核酸内切酶结合包含核苷酸序列5′-GUUCACUGCCGUAUAGGCAGCUAAGAAA-3′(SEQ ID NO:1)的RNA底物。
8.一种包含编码根据权利要求1所述的变体Csy4核糖核酸内切酶的核苷酸序列的核酸。
9.一种包含编码根据权利要求1所述的变体Csy4核糖核酸内切酶的核苷酸序列的重组表达载体。
10.根据权利要求9所述的重组表达载体,其中编码所述变体Csy4核糖核酸内切酶的所述核苷酸序列可操作连接至启动子。
11.根据权利要求10所述的重组表达载体,其中所述启动子是诱导型启动子。
12.一种包含根据权利要求9所述的重组表达载体的体外遗传修饰的宿主细胞。
13.一种用于纯化核酸的混合群中存在的靶RNA的试剂盒,所述试剂盒包含:
根据权利要求1所述的变体Csy4核糖核酸内切酶。
14.根据权利要求13所述的试剂盒,进一步包含重组表达载体,所述重组表达载体以5′至3′的顺序和可操作连接包含:
a)编码由根据权利要求1所述的变体Csy4核糖核酸内切酶特异性结合的RNA底物的核苷酸序列;
b)适合插入编码所述靶RNA的核酸的多克隆位点。
15.根据权利要求14所述的试剂盒,其中编码所述RNA底物的所述核苷酸序列可操作连接至启动子。
16.根据权利要求15所述的试剂盒,其中所述启动子是诱导型启动子。
17.根据权利要求14所述的试剂盒,其中所述RNA底物包含核苷酸序列5′-GUUCACUGCCGUAUAGGCAGCUAAGAAA-3′(SEQ ID NO:1)。
18.根据权利要求14所述的试剂盒,其中所述重组表达载体包含编码所述靶RNA的核苷酸序列,所述核苷酸序列插入所述多克隆位点。
19.根据权利要求13所述的试剂盒,进一步包含咪唑。
20.根据权利要求13所述的试剂盒,进一步包含一种或多种洗涤缓冲剂。
21.根据权利要求13所述的试剂盒,进一步包含阳性对照表达载体。
22.根据权利要求13所述的试剂盒,其中所述变体Csy4核糖核酸内切酶被固定在不溶性支撑物上。
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