[发明专利]用于登革热检测的探针和引物无效
申请号: | 201180036713.8 | 申请日: | 2011-07-15 |
公开(公告)号: | CN103025893A | 公开(公告)日: | 2013-04-03 |
发明(设计)人: | 曼尤拉·贾甘纳特;马诺杰·穆拉克卡普斯·纳拉亚南;钱德拉塞克哈尔·布哈斯卡拉恩·奈尔;皮拉里塞蒂·文卡塔·苏巴拉奥 | 申请(专利权)人: | 彼格泰格私人有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 北京康信知识产权代理有限责任公司 11240 | 代理人: | 李丙林;张英 |
地址: | 印度卡*** | 国省代码: | 印度;IN |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 登革热 检测 探针 引物 | ||
1.具有如SEQ ID No.1或SEQ ID No.2所示的核苷酸序列的探针,可选地与可检测标签结合。
2.根据权利要求1所述的探针,其中,所述探针用于检测登革热感染;并且其中,所述可检测标签是在5'端的荧光团和在3'端的猝灭剂。
3.根据权利要求2所述的探针,其中,所述荧光团选自包含以下的组中:荧光素,由6-羧基荧光素[FAM]、VIC、JOE、5-(2'-氨基乙基)氨基萘-1-磺酸、香豆素和香豆素衍生物、荧光黄、得克萨斯红、四甲基罗丹明、四氯-6-羧基荧光素、5-羧基罗丹明和花青染料组成的荧光素衍生物,优选6-羧基荧光素[FAM];并且所述猝灭剂选自包含以下的组中:四甲基罗丹明、4'-(4-二甲基氨基苯偶氮基)苯甲酸、4-二甲基氨基苯基偶氮苯基-4'-马来酰亚胺、四甲基罗丹明、羧基四甲基罗丹明和黑洞猝灭剂1[BHQ]染料,优选黑洞猝灭剂1(BHQ1)。
4.具有如SEQ ID No.3或SEQ ID No.4所示的核苷酸序列的引物。
5.根据权利要求4所述的引物,其中,具有SEQ ID No.3的所述引物是正义引物而具有SEQ ID No.4的所述引物是反义引物。
6.根据权利要求4所述的引物,其中,所述引物与具有SEQ ID No.1或SEQ ID No.2的探针相对应;并且其中,所述引物与任一具有SEQID No.1或SEQ ID No.2的所述探针组合使用。
7.一种用于检测登革热感染的PCR反应混合物,所述混合物包含核酸扩增试剂、具有选自包含SEQ ID No.1或SEQ ID No.2的组中的核苷酸序列的探针或其探针的组合;以及具有如SEQ ID No.3和SEQID No.4所示的核苷酸序列的引物。
8.根据权利要求7所述的反应混合物,其中,具有SEQ ID No.3的所述引物是正义引物而具有SEQ ID No.4的所述引物是反义引物;并且所述探针与在5'端具有荧光团和在3'端具有猝灭剂的可检测标签结合。
9.根据权利要求7所述的反应混合物,其中,所述引物与具有SEQ IDNo.1或SEQ ID No.2的探针相对应;并且其中所述引物与任一具有SEQ ID No.1或SEQ ID No.2的所述探针组合使用。
10.根据权利要求7所述的反应混合物,其中,所述登革热感染是从选自包含血液、血浆和血清或它们的任何组合的组中的样品中检出的;并且所述扩增试剂选自包含氯化镁、Taq聚合酶和缓冲液或它们的任何组合的组中。
11.一种检测和可选地量化登革热感染的方法,所述方法包括以下操作:
(a)获得包含核酸扩增试剂、选自包含SEQ ID No.1和SEQ IDNo.2的组中的探针、和具有如SEQ ID No.3和SEQ ID No.4所示的核苷酸序列的引物的PCR反应混合物;
(b)将检测样品引入至所述PCR反应混合物用于进行PCR扩增以获得目标序列的拷贝,接着检测产生的荧光信号以检测所述登革热感染;以及
(c)可选地,由所检测信号构建标准曲线用于定量所述登革热感染。
12.根据权利要求11所述的方法,其中,具有SEQ ID No.3的所述引物是正义引物而具有SEQ ID No.4的所述引物是反义引物。
13.根据权利要求11所述的方法,其中,所述引物与具有SEQ ID No.1或SEQ ID No.2的探针相对应;并且其中所述引物与任一具有SEQID No.1或SEQ ID No.2的所述探针组合使用。
14.根据权利要求11所述的方法,其中,所述检测样品选自包含血液、血浆和血清或它们的任何组合的组中;并且所述扩增试剂选自包含氯化镁、Taq聚合酶和缓冲液或它们的任何组合的组中。
15.根据权利要求11所述的方法,其中,所述探针与在5'端具有荧光团和在3'端具有猝灭剂的可检测标签结合;并且所述荧光信号由在5'端具有荧光团和在3'端具有猝灭剂的所述探针产生。
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