[发明专利]用于检测和/或定量人类DNA的方法在审
申请号: | 201180045929.0 | 申请日: | 2011-09-22 |
公开(公告)号: | CN103180460A | 公开(公告)日: | 2013-06-26 |
发明(设计)人: | 安迪·温德;弗兰切斯卡·迪帕斯奎尔;萨比恩·韦尔纳;萨沙·斯特劳布 | 申请(专利权)人: | 凯杰有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 中原信达知识产权代理有限责任公司 11219 | 代理人: | 张颖;谢丽娜 |
地址: | 德国*** | 国省代码: | 德国;DE |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 检测 定量 人类 dna 方法 | ||
1.用于定量和/或检测样品中基因组的一个或多个核酸和/或用于分析人类DNA的可能的降解状态和/或用于分析拷贝数变异(CNV)的方法,其中
a.对所述核酸进行扩增,并且被扩增的基因座是基因组中的多拷贝基因座,
b.所述多拷贝基因座在至少两个不同的染色体上具有拷贝,
c.并且对扩增产物进行检测和/或定量,并且
d.所述多拷贝基因座不是重复元件。
2.权利要求1的方法,其中所述基因座与SEQ ID NO.1或SEQ ID NO.52的序列在80个碱基对的区段上具有至少80%的序列同一性。
3.权利要求1或2的方法,其中所述多拷贝基因座的至少4个不同拷贝被扩增。
4.权利要求1至3的方法,其中扩增方法是非等温法或等温法。
5.权利要求4的方法,其中所述扩增方法选自定量实时PCR(rtPCR)、连接酶链反应(LCR)、链置换扩增(SDA)、多重置换扩增(MDA)、滚环扩增(RCA)、环介导的等温扩增(LAMP)、转录介导的扩增(TMA)、解链酶依赖性扩增(HDA)、SMART扩增法(SMAP)、单引物等温扩增(SPIA)、切口酶扩增反应(NEAR)、指数扩增反应(EXPAR)、重组酶聚合酶扩增(RPA)和基于核酸序列的扩增(NASBA)。
6.权利要求5的方法,其中所述扩增方法是解链酶依赖性扩增(HDA)或实时PCR(rtPCR)。
7.前述权利要求任一项的方法,其中所述扩增产物的长度在60个碱基对和200个碱基对之间。
8.前述权利要求任一项的方法,其中用于扩增的引物具有在18个核苷酸的区段上与SEQ ID NO.2、3、5、6、8、9、10、11和/或12的差异不超过5个核苷酸的核苷酸序列。
9.基因组中的多拷贝基因座用于检测和/或定量所述基因组的核酸、用于分析人类DNA的可能的降解状态或作为参比基因用于拷贝数变异(CNV)分析的用途,其中所述多拷贝基因座在至少两个不同的染色体上具有拷贝。
10.权利要求9的用途,其中所述基因座与SEQ ID NO.1或SEQ ID NO.52的序列在80个碱基对的区段上具有至少80%的序列同一性。
11.用于检测和/或定量人类核酸的试剂盒,其中所述试剂盒包含引物,所述引物在严紧的条件下与在80个碱基对的区段上与SEQ ID NO.1或SEQ ID NO.52的序列具有至少80%的序列同一性的序列结合。
12.权利要求11的试剂盒,其中所述试剂盒中至少一个引物具有在18个核苷酸的区段上与SEQ ID NO.2、3、5、6、8、9、10、11和/或12的差异不超过5个核苷酸的核苷酸序列。
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