[发明专利]用于多重连接扩增技术的探针制备方法有效
申请号: | 201210008247.9 | 申请日: | 2012-01-12 |
公开(公告)号: | CN102534004A | 公开(公告)日: | 2012-07-04 |
发明(设计)人: | 黄劭 | 申请(专利权)人: | 武汉缉熙生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11;C12N15/10 |
代理公司: | 江苏英特东华律师事务所 32229 | 代理人: | 邵鋆 |
地址: | 430000 湖北*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 多重 连接 扩增 技术 探针 制备 方法 | ||
1.用于多重连接扩增技术的探针制备方法,包括以下步骤:
1)设计一对与待测靶片段及长探针核苷酸序列无关的检测引物,分别为GP1(5’端带荧光基团修饰)和GP2,用于最后的PCR扩增检测,同时合成5’端带磷酸化修饰的右探针RPO-N,由目的右探针序列与GP2的反向互补序列组成;
2)确定一段与探针及通用引物无关的核苷酸序列S,并用于设计一对扩增左端长探针的引物,分别为GPL和LPO-N’,其中GPL是由GP1的序列与S序列的前18bp左右的序列组成,LPO-N’由目的左探针序列的反向互补序列与S序列中的18bp左右反向互补的序列组成,并且其5’端要带上磷酸化修饰;
3)用GPL和LPN以所述的一段与探针及通用引物无关的核酸序列为模板进行PCR扩增,获得互补链5’端磷酸化修饰的双链核苷酸序列;
4)纯化回收PCR产物;
5)采用核酸Lamda外切酶对以上双链核苷酸序列进行消化,去除5’磷酸化标记的那条单链DNA;
6)采用ssDNA纯化回收试剂盒对消化产物进行回收,便得到左端长探针。
2.根据权利要求 1 所述的用于多重连接扩增技术的探针制备方法,其特征在于,步骤2)所述的用于扩增左端探针的引物由两段核苷酸序列组成,一段根据探针检测目标的核苷酸序列设计,另一段根据与待检测靶片段无关的模版核苷酸序列设计。
3.根据权利要求 1 所述的用于多重连接扩增技术的探针制备方法,其特征在于,步骤3)所述PCR扩增得到的5’端磷酸化修饰的双链核苷酸序列需先经过纯化再进行Lambda外切酶消化。
4.根据权利要求 1 所述的用于多重连接扩增技术的探针制备方法,其特征在于,步骤5)所述的Lambda外切酶消化过程中,1μg双链DNA用1个单位Lambda外切酶消化。
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