[发明专利]CARD9基因突变体及其应用

说明书

技术领域

本发明涉及CARD9基因突变体及其应用。具体地，本发明涉及一种分离的编码CARD9突变体的核酸、一种分离的多肽、一种筛选易感暗色真菌的生物样品的方法、一种筛选易感暗色真菌的生物样品的系统、一种用于筛选易感暗色真菌的生物样品的试剂盒、一种筛选治疗或预防暗色丝孢霉病的药物的方法。

背景技术

暗色丝孢霉病(phaeohyphomycosis)是一组暗色真菌引起的以组织中有暗色菌丝为特征的皮肤、皮下组织或系统性感染。1974年Ajello提出此命名。暗色丝孢霉病在世界各地都有散在病例报道，但多见于热带。我国山东、东北和湛江等地有散发病例报道。致病途径主要是外源性感染和条件致病性感染。感染途径可能是病原菌经皮肤破损处植入或吸入真菌孢子。临床表现为浅溃疡、瘀斑、褐黑色斑或疣状增生，自觉微痒或轻度胀痛，有的可无自觉症状。靠真菌学检查和组织病理检查诊断。大多对抗真菌药物不敏感，疗效欠佳。多数表现为自幼发病，反复发生机会致病菌感染，抗真菌治疗有效但停药后很快复发。

因此，目前对于暗色丝孢霉病的研究仍有待深入和改进。

发明内容

本发明旨在至少解决现有技术中存在的技术问题之一。为此，本发明的一个目的在于提出一种能够有效筛选易感暗色真菌的生物样品的方法。

本发明是基于发明人的下列工作而完成的：发明人通过外显子组测序的方法确定了暗色丝孢霉病的致病基因上的新突变。

根据本发明的第一方面，本发明提出了一种分离的编码CARD9突变体的核酸。根据本发明的实施例，与SEQ ID NO：1相比，该核酸具有选自下列的至少一种突变：c.G241A、c.G104A、c.C472T、c.191insTGCT以及c.818insG。根据本发明的实施例，发明人确定了多个CARD9基因的新突变体，这些新突变体与暗色丝孢霉病的发病密切相关，从而通过检测这些新突变体在生物样品中是否存在，可以有效地检测生物样品是否易感暗色真菌。

根据本发明的第二方面，本发明提出了一种分离的多肽。根据本发明的实施例，与SEQID NO：2相比，该分离的多肽具有选自下列的至少一种突变：p.E81K、p.R35Q、p.Q158X、p.L64fsX59以及p.D274fsX60。根据本发明的一些具体示例，该多肽是由前述分离的编码CARD9突变体的核酸编码的。通过检测生物样品中是否表达该多肽，可以有效地检测生物样品是否易感暗色真菌。

根据本发明的第三方面，本发明提出了一种筛选易感暗色真菌的生物样品的方法。根据本发明的实施例，该筛选易感暗色真菌的生物样品的方法包括以下步骤：从生物样品提取核酸样本；确定核酸样本的核酸序列；该核酸样本的核酸序列与SEQ ID NO：1相比，具有选自c.G241A、c.G104A、c.C472T、c.191insTGCT以及c.818insG的至少一种突变是生物样品易感暗色真菌的指示。通过根据本发明实施例的筛选易感暗色真菌的生物样品的方法，可以有效地筛选易感暗色真菌的生物样品。

根据本发明的第四方面，本发明提出了一种筛选易感暗色真菌的生物样品的系统。根据本发明的实施例，该筛选易感暗色真菌的生物样品的系统包括：核酸提取装置，该核酸提取装置用于从生物样品提取核酸样本；核酸序列确定装置，该核酸序列确定装置与核酸提取装置相连，用于对核酸样本进行分析，以便确定核酸样本的核酸序列；判断装置，该判断装置与核酸序列确定装置相连，以便基于核酸样本的核酸序列与SEQ ID NO：1相比，是否具有选自c.G241A、c.G104A、c.C472T、c.191insTGCT以及c.818insG的至少一种突变，判断生物样品是否易感暗色真菌。利用该系统，能够有效地实施前述筛选易感暗色真菌的生物样品的方法，从而可以有效地筛选易感暗色真菌的生物样品。

根据本发明的第五方面，本发明提出了一种用于筛选易感暗色真菌的生物样品的试剂盒。根据本发明的实施例，该用于筛选易感暗色真菌的生物样品的试剂盒包括：适于检测CARD9基因突变体的试剂，其中与SEQ ID NO：1相比，CARD9基因突变体具有选自c.G241A、c.G104A、c.C472T、c.191insTGCT以及c.818insG的至少一种突变。利用根据本发明的实施例的试剂盒，能够有效地筛选易感暗色真菌的生物样品。