[发明专利]甘蔗条螟蜕皮调节转录因子cDNA及其克隆方法与重组应用无效

专利信息
申请号: 201210059617.1 申请日: 2012-03-08
公开(公告)号: CN102586259A 公开(公告)日: 2012-07-18
发明(设计)人: 刘志昕;张雨良;张树珍;王健华;熊国如;余乃通;王俊刚 申请(专利权)人: 中国热带农业科学院热带生物技术研究所
主分类号: C12N15/12 分类号: C12N15/12;C12N15/10;C07K14/435;A23K1/16;A01H5/00
代理公司: 郑州联科专利事务所(普通合伙) 41104 代理人: 刘建芳
地址: 571101 *** 国省代码: 海南;66
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摘要:
搜索关键词: 甘蔗 蜕皮 调节 转录 因子 cdna 及其 克隆 方法 重组 应用
【权利要求书】:

1.一种甘蔗条螟蜕皮调节转录因子CsHR3的cDNA,其特征在于,其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所述。

2.权利要求1所述甘蔗条螟蜕皮调节转录因子CsHR3,其氨基酸序列如SEQ ID NO.2所述。

3.权利要求1所述甘蔗条螟蜕皮调节转录因子cDNA的克隆方法,包括以下步骤:

(1)从甘蔗条螟预蛹期幼虫提取总RNA,然后反转录合成cDNA;

(2)根据不同鳞翅目昆虫蜕皮调节转录因子的保守序列设计简并引物:

CsHR3-middle fragment-P1:5'-ACAGWGGTGAACTACCAGTG -3' 

CsHR3-middle fragment-P2:5'-GACCATGRAATTGGTCGCT-3'

(3)以cDNA为模板,PCR扩增甘蔗条螟CsHR3基因的中间片段;

(4)纯化步骤(3)所得PCR产物,琼脂糖凝胶回收目的片段,取纯化产物连接到pMD19-T simple 载体上,然后转化大肠杆菌感受态细胞Top10,37℃平板培养,蓝白斑筛选含CsHR3中间片段的阳性克隆子;

(5)根据CsHR3中间片段的测序结果,设计3’RACE特异性引物,以甘蔗条螟cDNA为模板,PCR扩增CsHR3基因的3’片段序列;

CsHR3-3' RACE-GSP1:5' - CGGGTCAACAGGAATAGATGTCA -3'

CsHR3-3' RACE-GSP2:5'- CAGCGCCTGACTCAGTGTATGAC-3'

(6)纯化步骤(5)所得PCR产物,琼脂糖凝胶回收目的片段,取纯化产物连接到pMD19-T载体上,然后转化大肠杆菌感受态细胞Top10,37℃平板培养,蓝白斑筛选获得CsHR3基因3’端的阳性克隆子;

(7)将步骤(4)和(6)所得的阳性克隆子进行序列测定,然后将测定所得序列通过生物信息学软件DNAman拼接,得到CsHR3基因1266 bp序列。

4.如权利要求3所述甘蔗条螟蜕皮调节转录因子cDNA的克隆方法,其特征在于,所述步骤(1)中反转录合成cDNA具体为:取总RNA 5微升、Random引物1微升、底物dNTPs 2微升,用RNase-free H2O加至10微升,混匀,65℃保温5min,迅速放至冰上冷却3min;然后在上述混合物中加入5×Primer Script Buffer 4微升、RNA酶抑制剂0.5微升、AMV反转录酶0.5微升,并用RNase-free H2O加至20微升,42℃反应60min,70℃灭火15min,4℃冷却,-20℃保存备用。

5.如权利要求3所述甘蔗条螟蜕皮调节转录因子cDNA的克隆方法,其特征在于,步骤(3)和(5)中PCR扩增所用的反应试剂组成及反应条件如下:首先将下述试剂混合在一起,

模板cDNA                1μl

脱氧核苷酸底物dNTP      4μl

Ex-Taq DNA聚合酶        0.5μl

10×Taq DNA 聚合酶缓冲液  5μl

正向引物(10μM)         2μl

反向引物(10μM)         2μl

ddH2O                   35.5μl

总体积                   50μl

反应条件为:首先94℃预变性3分钟;然后进行如下循环:94℃30秒,50℃30秒,72℃2分钟,共进行32循环;最后72℃延伸10分钟。

6.权利要求1所述甘蔗条螟蜕皮调节转录因子cDNA的重组应用,采用细菌介导RNAi技术在RNaseIII缺陷型大肠杆菌HT115中表达dsRNA,获得具有生物活性的dsRNA,通过饲喂甘蔗条螟幼虫,来沉默甘蔗条螟蜕皮调节转录因子CsHR3基因,使甘蔗条螟不能蜕皮或破坏其正常生长发育过程,从而用于甘蔗条螟害虫的生物防治;或者通过基因工程方法将甘蔗条螟蜕皮调节转录因子转入作物,获得具有抗虫能力的作物。

7.一种细菌介导RNAi防治甘蔗条螟的方法,其特征在于,选择甘蔗条螟蜕皮调节转录因子CsHR3基因作为靶标,选定其CsHR3基因上含有非LBD功能结构域和LBD功能结构域的两个dsRNA干扰片段,构建细菌介导的RNAi重组载体L4440-CsHR3-I1、L4440-CsHR3-I2,同时选用绿色荧光蛋白基因EGFP作为阴性对照,清水作为负对照;通过热激法将上述载体导入Ecoli. HT115(RNaseⅢ缺陷型大肠杆菌)中,加入0.8mM IPTG进行诱导表达,提取细菌表达dsRNA进行甘蔗条螟幼虫的饲喂试验,记录3龄和5龄甘蔗条螟饲喂7天后表型变化及体内CsHR3基因mRNA降低水平。

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