[发明专利]烟粉虱中甘薯褪绿矮化病毒的检测方法及其应用有效
申请号: | 201210061149.1 | 申请日: | 2012-03-09 |
公开(公告)号: | CN102586484A | 公开(公告)日: | 2012-07-18 |
发明(设计)人: | 张振臣;张盼;乔奇;秦艳红;张德胜;田雨婷;王爽;王永江 | 申请(专利权)人: | 河南省农业科学院 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68 |
代理公司: | 郑州大通专利商标代理有限公司 41111 | 代理人: | 张爱军 |
地址: | 450002 *** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 烟粉虱中 甘薯 矮化 病毒 检测 方法 及其 应用 | ||
1.一种烟粉虱中甘薯褪绿矮化病毒SPCSV的检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)分别设计合成SPCSV 病毒的3条引物:
CSV70P1: 5′-GACGGKGGTACKATGAARGTCC-3′,
CSV70P2: 5′-GGCTCACAAACHGAYTTCATAAACAT-3′,
CSV70P3: 5′-TCAACCCCAACCCATCGTTTTAG-3′,
其中K为 G 或 T,R为 A 或 G,Y为C或 T,H为A、T或C;
(2)用解剖针挑取烟粉虱,放入加有预冷RNA提取液的离心管中,提取烟粉虱的总RNA作为PCR模板,进行反转录;
(3)以反转录产物作为模板,利用引物CSV70P1和CSV70P2进行半巢式RT-PCR的第一轮扩增,预期扩增片段大小为431bp;利用引物CSV70P1和CSV70P3进行半巢式RT-PCR的第二轮扩增,预期扩增片段大小为170bp;
(4)用琼脂糖凝胶电泳检测扩增产物。
2.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述反转录的反应体系为10μl,包括:4 μL RNA 模板,2μl 5×RT buffer,0.5μL浓度为10 μmol/L的CSV70P2,1 μL浓度为10 mmol/L 的dNTPs,0.25 μL浓度为40U/μl的RNase抑制剂和0.5 μL浓度为5U/μl的AMV反转录酶,余量为DEPC-H2O。
3.根据权利要求2所述的检测方法,其特征在于,所述反转录的反应程序为:42℃反转录40min,99℃反应5min,5℃反应5min,反应后得到反转录产物。
4.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述半巢式RT-PCR的第一轮扩增的反应体系为25μl,包括:2.5μL10×PCR buffer,1μL浓度为2.5mmol/L的dNTPs,浓度为10 μmol/L 的CSV70P1和CSV70P2各0.5 μL,0.2μL浓度为5U/μL的Taq酶,2.5μl反转录产物作模板,余量为ddH2O。
5.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述半巢式RT-PCR的第一轮扩增的反应程序为:94℃预变性2min,94℃变性30s,54℃退火30s,72℃延伸45s,完成35个循环,最后72℃延伸10min。
6.根据权利要求1所述的检测方法,其特征在于,所述半巢式RT-PCR的第二轮扩增是将第一轮RT-PCR的扩增产物稀释20倍,取1μL稀释产物作为第二轮PCR扩增的模板,第二轮PCR扩增反应体系为25μl,包括:2.5 μL10×PCR buffer,1μL浓度为2.5 mmol/L的dNTPs,浓度为10 μmol/L的CSV70P1和CSV70P3各0.5 μL,0.2μL浓度为5U/μL的Taq酶,用ddH2O补足至25 μL。
7.根据权利要求1-6任一项所述的检测方法,其特征在于,所述半巢式RT-PCR的第二轮扩增的反应程序为:94℃预变性2min,94℃变性30s,56℃退火30s,72℃延伸30s,完成32个循环,最后72℃延伸10min。
8.权利要求7所述的方法在检测单头或多头烟粉虱中甘薯褪绿矮化病毒的应用。
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