[发明专利]非对称发夹探针及其应用有效
申请号: | 201210076645.4 | 申请日: | 2012-03-21 |
公开(公告)号: | CN102864214A | 公开(公告)日: | 2013-01-09 |
发明(设计)人: | 夏涵;梁盼盼;黄庆;府伟灵 | 申请(专利权)人: | 中国人民解放军第三军医大学第一附属医院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11;C12R1/445;C12R1/385;C12R1/22 |
代理公司: | 北京海虹嘉诚知识产权代理有限公司 11129 | 代理人: | 谢殿武 |
地址: | 400038 重*** | 国省代码: | 重庆;85 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 对称 发夹 探针 及其 应用 | ||
1.非对称发夹探针1,其特征在于:包括回文序列、两条茎臂和连接于一条茎臂上的粘性末端,所述两条茎臂连接于回文序列的两端且具有互补的核酸序列,所述回文序列为无关序列,所述茎臂与其连接的粘性末端具有靶序列的互补核酸序列。
2.根据权利要求1所述的非对称发夹探针1,所述粘性末端位于非对称发夹探针1的5’端。
3.非对称发夹探针2,其特征在于:包括回文序列、两条茎臂和连接于一条茎臂上的粘性末端,所述两条茎臂连接于回文序列的两端且具有互补的核酸序列,所述回文序列与其相连的一条茎臂具有靶序列,所述另一茎臂上相连的粘性末端具有和权利要求1中所述的无关序列的互补核酸序列。
4.根据权利要求3所述的非对称发夹探针2,所述粘性末端位于非对称发夹探针2的3’端。
5.根据权利要求1-4所述的非对称发夹探针1或2,所述粘性末端为6-8个碱基。
6.非对称发夹探针1或2在快速检测待测靶序列中的应用。
7.根据权利要求6所述的应用,为液相杂交链反应体系,所述反应体系中同时加入有非对称发夹探针1和非对称发夹探针2以及待测靶序列,其中所述非对称发夹探针1的粘性末端位于非对称发夹探针1的5’端,所述非对称发夹探针2的粘性末端位于非对称发夹探针1的3’端;或者所述非对称发夹探针1的粘性末端位于非对称发夹探针1的3’端,所述非对称发夹探针2的粘性末端位于非对称发夹探针1的5’端。
8.根据权利要求7所述应用,所述待测靶序列为细菌的16S rDNA序列。
9.根据权利要求8所述应用,所述细菌为金黄色葡萄球菌,所述非对称发夹探针1、非对称发夹探针2和待测靶序列分别为:
SA-H1:TTCTCTGATGTTAGCGGCGGACGGCAAAGTCCGTCCGCCGCTAACATC,
SA-H2:CCGTCCGCCGCTAACATCAGAGAAGATGTTAGCGGCGGACGGACTTTG,
Tsa:CCGTCCGCCGCTAACATCAGAGAA。
10.根据权利要求8所述应用,所述细菌为铜绿假单胞菌,所述非对称发夹探针1、非对称发夹探针2和待测靶序列分别为:
PA-H 1:CGTCCTGAGGGAGAAAGTGGGGGTCAAAGTACCCCCACTTTCTCCCTC,
PA-H2:ACCCCCACTTTCTCCCTCAGGACGGAGGGAGAAAGTGGGGGT,
Tp a:ACCCCCACTTTCTCCCTCAGGACG。
11.根据权利要求8所述应用,所述细菌为肺炎克雷伯菌,所述非对称发夹探针1、非对称发夹探针2和待测靶序列分别为:
KP-H1:
GGTGACGAGTGGCGGACGGGTGAGTTCAAAGTCTAACTCACCCGTCCGCCAC,
KP-H2:
AACTCACCCGTCCGCCACTCGTCACCGTGGCGGACGGGTGAGTTAGACTTTG,
Tkp:
AACTCACCCGTCCGCCACTCGTCACC。
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