[发明专利]一种鉴别螺旋藻生产性状优良品系的方法无效
申请号: | 201210083209.X | 申请日: | 2012-03-27 |
公开(公告)号: | CN102634576A | 公开(公告)日: | 2012-08-15 |
发明(设计)人: | 汪志平;邵斌;刘新颖;于金鑫;蓝瑾瑾;王景梅;陈子元 | 申请(专利权)人: | 浙江大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04 |
代理公司: | 杭州中成专利事务所有限公司 33212 | 代理人: | 金祺 |
地址: | 310027 浙*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 鉴别 螺旋藻 生产 性状 优良 品系 方法 | ||
1.一种鉴别螺旋藻生产性状优良品系的方法,其特征在于,是将候选品系的基因组DNA经特定引物HIPS-TC扩增,并在电泳分析后采用NTSYSpc2.1软件构建藻株间的聚类图;若候选品系具有1130bp、620bp、580bp和540bp的特异DNA电泳条带,且能与已知生产性状好的品系聚到一起,则候选品系生产性状好,适用于大规模培植生产;若候选品系具有1190bp、780bp、700bp、570bp、520bp和470bp的特异DNA电泳条带,且与已知生产性状差的品系聚到一起,则生产性状差,不适用于大规模培植生产;
所述特定引物HIPS-TC的序列为5’-GCGATCGCTC-3’;
所述生产性状好的品系是:ZJU0103、ZJU0104、ZJU0105、ZJU0107、ZJU0108、ZJU0115和ZJU0116;所述生产性状差的品系是:ZJU0101、ZJU0102、ZJU0106、ZJU0109/RH、ZJU0110、ZJU0113和ZJU0114。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,具体包括下述步骤:
(1)选用14种螺旋藻品系作为对比样本,即ZJU0101、ZJU0102、ZJU0103、ZJU0104、ZJU0105、ZJU0106、ZJU0107、ZJU0108、ZJU0109/RH、ZJU0110、ZJU0113、ZJU0114、ZJU0115和ZJU0116;
(2)试剂和仪器
TaqDNA聚合酶和琼脂糖为上海生工生物工程公司产品;dNTP、DNA限制性内切酶、RNase A均为日本TaKaRa公司产品;其它试剂均为分析纯;序列扩增用美国Hybaid公司的Thermal Cycler PCR仪;
(3)PCR扩增
将候选品系及14种对比样本的基因组DNA经特定引物HIPS-TC扩增;
在25μL PCR反应体系中,含10倍的PCR缓冲液2.5μL,4种dNTP各1μmol/L,特定引物HIPS-TC:5’-GCGATCGCTC-3’0.5μmol/L,1.25U的Taq DNA聚合酶,100ng基因组DNA,PCR反应程序为94℃ 5min;94℃ 30s,30℃ 50s,72℃ 45s,30个循环;最后72℃延伸10min;
(4)电泳分析和观察
将扩增产物在5%的非变性聚丙烯酰胺凝胶上电泳,电压8.5V/cm;电泳结束后用银染方法染色,再在凝胶成像系统Bio-Rad观察并照相,经过观察比对被筛选的螺旋藻品系用引物HIPS-TC扩增出条带的分子量;
(5)聚类图的构建
对上述候选品系及14种对比样本的电泳结果采用NTSYSpc2.1软件以非加权平均法进行分析和构建藻株间的聚类图,并根据聚类情况进行判断。
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