[发明专利]一种PEB致病基因新突变及其应用

说明书

技术领域

本发明涉及生物医学领域，具体地，本方面涉及一种PEB致病基因新突变及其应用。

背景技术

胫前型大疱性表皮松懈症(Pretibial Epidermolysis Bullosa，PEB)是一种显性营养不良性大疱性表皮松懈症(Dominant Dystrophic Epidermolysis Bullosa，DDEB)，其主要临床特征是在双下肢胫前区瘙痒，出现红色丘疹、水疱，水疱愈合后形成萎缩性伤疤，指趾甲营养不良或融合，部分患者双上肢和腹部也可见丘疹样病变。PEB发病年龄是从出生到60岁，而这个家系的患者发病都在5岁以后，平均为10岁。家系外正常对照年龄是20-40岁，平均年龄30岁。

经研究发现，PEB疾病可能涉及到一种由编码VII型胶原蛋白的COL7A1基因突变，从而导致锚纤维异常。但是目前PEB疾病的COL7A1基因突变谱尚未完全发现，基因型和表现型的关系也不明确。

因此本领域对胫前型大疱性表皮松懈症病症的研究尚不清晰，对造成该疾病的原因更不明了，因此本领域迫切需要对胫前型大疱性表皮松懈症的致病机理进行研究。

发明内容

本发明的目的就是提供一种PEB致病基因新突变。

本发明的另一目的是提供所述突变的应用。

在本发明的第一方面，提供了一种突变的COL7A1蛋白，所述突变的COL7A1蛋白的第2034位氨基酸由甘氨酸(Gly)突变为缬氨酸(Val)。

在另一优选例中，所述突变的COL7A1蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO.：1所示。

在另一优选例中，所述突变的COL7A1蛋白除第2034位之外，其他部分与野生型COL7A1蛋白相同。

在另一优选例中，所述野生型COL7A1蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO.：2所示。

在本发明的第二方面，提供了一种编码本发明第一方面所述突变的COL7A1蛋白的核苷酸序列。

在另一优选例中，所述的核苷酸序列除6101位外，其他部分与编码野生型COL7A1蛋白的核苷酸序列相同。

在另一优选例中，所述的核苷酸序列如SEQ ID NO.：3所示。

在另一优选例中，与编码野生型COL7A1蛋白的核苷酸序列相比，编码所述突变的COL7A1蛋白的核苷酸序列的第6101位核苷酸由G突变为T。

在另一优选例中，所述的编码野生型COL7A1蛋白的核苷酸序列如SEQ ID NO.：4所示。

在另一优选例中，本发明第一方面所述的突变的COL7A1蛋白或本发明第二方面所述的核苷酸序列来源于人或非人哺乳动物，较佳地来源于人。

在本发明的第三方面，提供了第一方面所述的COL7A1蛋白或第二方面所述核苷酸序列的用途，它们被用于制备检测胫前型大疱性表皮松懈症的试剂或试剂盒。

在另一优选例中，所述的试剂包括：引物或引物对、探针、抗体、或核酸芯片；

在另一优选例中，所述引物对可以特异性扩增出含6101位G的扩增产物，较佳地，扩增产物的长度为100-1000bp。

在另一优选例中，所述的探针可以特异性结合于含6101位突变的G的核酸片段。

在另一优选例中，所述的抗体可以特异性结合于含2034位突变的缬氨酸的多肽。

在本发明的第四方面，提供了一种检测胫前型大疱性表皮松懈症的试剂盒，所述的试剂盒包括：

(a)检测COL7A1基因第6101位核苷酸位点的试剂；或检测COL7A1蛋白第2034位氨基酸位点的试剂；

(b)说明书。

在另一优选例中，所述检测COL7A1基因第6101位核苷酸位点的试剂，所述试剂选自下组：引物对、探针、核酸芯片。

在另一优选例中，检测COL7A1蛋白第2034位氨基酸位点的试剂的试剂为抗体。

在另一优选例中，所述的引物对为：核苷酸序列如SEQ ID NO.：5的引物和核苷酸序列如SEQ ID NO.：6所示的引物组成的引物对。

在本发明的第五方面，提供了一种检测样本中COL7A1是否存在单核苷酸多态性(SNP)的方法，包括步骤：