[发明专利]先天性心脏病相关基因DLC1及其应用有效
申请号: | 201210129603.2 | 申请日: | 2012-04-27 |
公开(公告)号: | CN103374625A | 公开(公告)日: | 2013-10-30 |
发明(设计)人: | 孔祥银;黄昀;林彬;胡兰靛;朱于非 | 申请(专利权)人: | 中国科学院上海生命科学研究院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/12;C07K14/47 |
代理公司: | 上海一平知识产权代理有限公司 31266 | 代理人: | 祝莲君;雷芳 |
地址: | 200031 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 先天性 心脏病 相关 基因 dlc1 及其 应用 | ||
1.一种DLC1基因或其单核苷酸变异在制备检测先天性心脏病的试剂或试剂盒中的用途,其中所述的单核苷酸变异SNV是:
第797位G→A;
第1048位G→A;
第1079位T→A;
第1237位T→A;
第1252位G→A;
第1298位C→A;
第1661位A→T;
第1662位T→C;
第2854位C→G;
第4111位G→C;
第1349位G→C;
其中,核苷酸位置编号基于SEQ ID NO:1。
2.如权利要求1所述的用途,其特征在于,所述的试剂包括引物、探针、芯片、或抗体。
3.如权利要求1所述的用途,其特征在于,所述的试剂盒含有一种或多种选自下组的试剂:
(a)DLC1基因的特异性引物;
(b)用于检测一种或多种所述SNV位点的特异性探针;
(c)用于检测一种或多种所述SNV位点的芯片;
(d)用于检测一种或多种所述SNV位点所对应的氨基酸突变的特异性抗体。
4.如权利要求2或3所述的用途,其特征在于,所述的特异性引物具有SEQID NO.:3-44中所示的序列,较佳地SEQ ID NO:13和14所示的序列。
5.一种检测先天性心脏病的试剂盒,其特征在于,它包括特异性扩增DLC1基因或转录本的引物,并且所述的引物扩增出的扩增产物的长度为100-2000bp且含有一个或多个选自下组的单核苷酸变异:
第797位G→A;
第1048位G→A;
第1079位T→A;
第1237位T→A;
第1252位G→A;
第1298位C→A;
第1661位A→T;
第1662位T→C;
第2854位C→G;
第4111位G→C;
第1349位G→C;
其中,核苷酸位置编号基于SEQ ID NO:1。
6.如权利要求5所述的试剂盒,其特征在于,它还含有选自下组的试剂:
(a)与所述SNV位点的结合的探针;
(b)识别所述SNV位点的限制性内切酶。
7.一种试剂在制备检测检测先天性心脏病的试剂盒的用途,其中所述试剂选自下组:
(a)DLC1基因的特异性引物;
(b)用于检测一种或多种所述SNV位点的特异性探针;
(c)用于检测一种或多种所述SNV位点的芯片;或
(d)用于检测一种或多种所述SNV位点所对应的氨基酸突变的特异性抗体。
8.一种人DLC1基因的用途,其特征在于,用于制备检测先天性心脏病的试剂盒。
9.一种分离的DLC1核苷酸序列,其特征在于,所述的核苷酸序列如SEQ IDNO.:1所示,并且具有一个或多个选自下组的突变:
第797位G→A;
第1048位G→A;
第1079位T→A;
第1237位T→A;
第1252位G→A;
第1298位C→A;
第1661位A→T;
第1662位T→C;
第2854位C→G;
第4111位G→C;
第1349位G→C;
其中,核苷酸位置编号基于SEQ ID NO:1。
10.一种分离的DLC1氨基酸序列,其特征在于,所述的氨基酸序列如SEQID NO.:2所示,并且具有一个或多个选自下组的突变:
Gly266Glu、Ala350Thr、Met360Lys、Leu413Met、Glu418Lys、Thr433Asn、Asp554Val、Leu952Val、Val1371Leu;
其中,氨基酸位置编号基于SEQ ID NO:2。
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