[发明专利]多态性检测用探针、多态性检测方法、药效评价方法、疾病预测方法以及多态性检测用试剂盒有效
申请号: | 201210132011.6 | 申请日: | 2012-04-27 |
公开(公告)号: | CN102766681A | 公开(公告)日: | 2012-11-07 |
发明(设计)人: | 井口亚希;黑瀬熏 | 申请(专利权)人: | 爱科来株式会社 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11;G01N21/64 |
代理公司: | 北京东方亿思知识产权代理有限责任公司 11258 | 代理人: | 肖善强 |
地址: | 日本*** | 国省代码: | 日本;JP |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 多态性 检测 探针 方法 药效 评价 疾病 预测 以及 试剂盒 | ||
1.一种ABCG2基因的多态性检测用探针,含有从包括下述P1、P1’、P2、P2’、P3和P3’的组中选择的至少一种荧光标记寡核苷酸:
(P1)寡核苷酸,其为与含有在序列编号1所示的碱基序列中的第301位~第311位碱基的碱基长为11~50的碱基序列互补的序列,该序列相对于除了与第311位碱基对应的碱基为鸟嘌呤之外与序列编号1互补的序列具有至少80%以上的同一性,并且与第311位碱基对应的碱基用荧光染料标记;
(P1’)寡核苷酸,其为与含有在序列编号1所示的碱基序列中的第301位~第311位碱基的碱基长为11~50的碱基序列互补的序列,该序列与除了与第311位碱基对应的碱基为鸟嘌呤之外具有与序列编号1相同的碱基的序列在严谨条件下杂交,并且与第311位碱基对应的碱基用荧光染料标记;
(P2)寡核苷酸,其为与含有序列编号2所示的碱基序列中的第234位~第251位碱基的碱基长为18~50的碱基序列互补的序列,该序列相对于除了与第251位碱基对应的碱基为鸟嘌呤之外与序列编号2互补的序列具有至少80%以上的同一性,并且与第251位碱基对应的碱基用荧光染料标记;
(P2’)寡核苷酸,其为与含有序列编号2所示的碱基序列中的第234位~第251位碱基的碱基长为18~50的碱基序列互补的序列,该序列与除了与第251位碱基对应的碱基为鸟嘌呤之外具有与序列编号2相同的碱基的序列在严谨条件下杂交,并且与第251位碱基对应的碱基用荧光染料标记;
(P3)寡核苷酸,其为与含有序列编号3所示的碱基序列中的第152位~第161位碱基的碱基长为10~50的碱基序列互补的序列,该序列相对于除了与第152位碱基对应的碱基为鸟嘌呤之外与序列编号3互补的序列具有至少80%以上的同一性,并且与第152位碱基对应的碱基用荧光染料标记;以及
(P3’)寡核苷酸,其为与含有序列编号3所示的碱基序列中的第152位~第161位碱基的碱基长为10~50的碱基序列互补的序列,该序列与除了与第152位碱基对应的碱基为鸟嘌呤之外具有与序列编号3相同的碱基的序列在严谨条件下杂交,并且与第152位碱基对应的碱基用荧光染料标记。
2.根据权利要求1所述的多态性检测用探针,其中,
所述P1或P1’荧光标记寡核苷酸的被荧光染料标记的第311位碱基位于从5’末端起数第1位~第3位的任何位置,
所述P2或P2’荧光标记寡核苷酸的被荧光染料标记的第251位碱基位于从5’末端起数第1位~第3位的任何位置,
所述P3或P3’荧光标记寡核苷酸的被荧光染料标记的第152位碱基位于从3’末端起数第1位~第3位的任何位置。
3.根据权利要求1或2所述的ABCG2基因的多态性检测用探针,其中,
所述P1或P1’荧光标记寡核苷酸的被荧光染料标记的第311位碱基位于5’末端,
所述P2或P2’荧光标记寡核苷酸的被荧光染料标记的第251位碱基位于5’末端,
所述P3或P3’荧光标记寡核苷酸的被荧光染料标记的第152位碱基位于3’末端。
4.根据权利要求1至3中任一项所述的多态性检测用探针,其中,所述荧光标记寡核苷酸与靶标序列杂交时的荧光强度比未与靶标序列杂交时的荧光强度减少或增加。
5.根据权利要求1至4中任一项所述的多态性检测用探针,其中,所述荧光标记寡核苷酸与靶标序列杂交时的荧光强度比未与靶标序列杂交时的荧光强度减少。
6.根据权利要求1至5中任一项所述的多态性检测用探针,其中,所述P1或P1’荧光标记寡核苷酸的碱基长为11~40,所述P2或P2’荧光标记寡核苷酸的碱基长为18~40,所述P3或P3’荧光标记寡核苷酸的碱基长为10~40。
7.根据权利要求1至6中任一项所述的多态性检测用探针,其中,所述P1或P1’荧光标记寡核苷酸的碱基长为11~28,所述P2或P2’荧光标记寡核苷酸的碱基长为20~30,所述P3或P3’荧光标记寡核苷酸的碱基长为15~30。
8.根据权利要求1至7中任一项所述的多态性检测用探针,其中,所述P1或P1’荧光标记寡核苷酸的碱基长为14~18,所述P2或P2’荧光标记寡核苷酸的碱基长为22~26,所述P3或P3’荧光标记寡核苷酸的碱基长为18~22。
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