[发明专利]多态性检测用探针、多态性检测方法、药效评价方法、疾病预测方法以及多态性检测用试剂盒

说明书

技术领域

本发明涉及多态性检测用探针、多态性检测方法、药效评价方法、疾病预测方法以及多态性检测用试剂盒。 

背景技术

一直以来，作为高尿酸血症的治疗靶标分子，已知作为尿酸重吸收转运子的Urate转运子(URAT1/SLC22A12)、葡萄糖转运子9(GLIT9/SLC22A12)。 

近年来，明确了由也被称为BCRP(breast cancer resistance protein)的ABCG2(ATP-binding cassette sub-family G member 2)基因编码高容量性的排尿转运子。 

另外，受到ABCG2基因的多态性的存在与痛风的发病风险的增加有关的启发，明确了ABCG2基因是痛风的主要致病基因(例如，参见实验医学2010年，第28卷，第8号，p.1285-1289)。 

另外，还受到ABCG2基因的多态性的存在与胎盘中的蛋白质表达异常有关联(例如，参见Drug.Metab.Dispos.，2005年，第33卷，第1号，p.94-101)的启示启发，人们期待短时间、低成本并且简便地测定ABCG2基因的多态性的方法。 

作为测定基因的多态性的方法，已知有使用被设计为扩增含有想要测定的碱基的部分的引物进行PCR，用能够以该特定碱基中有无突变来区分是否切断的限制性内切酶来切断，之后用电泳检测是否切断了的方法(PCR-RFLP法)(例如，参见Genet.Mol.Res.，2010年，第9卷，第1号，p.34-40)。 

另外，还已知有在用PCR法扩增了含有突变的区域之后，使用荧光染 料标记的核酸探针进行熔解曲线分析，并基于熔解曲线分析的结果来分析碱基序列的突变的方法(例如，参见日本专利文献特开2002-119291号公报)。 

但是，在PCR-RFLP法中，在PCR反应之后需要提取扩增产物来进行限制性内切酶处理。因此，扩增产物有可能混入下一反应体系，由此有可能获得假阳性、假阴性的结果。另外，由于在PCR结束后用限制性内切酶进行处理，之后进行电泳，因此有时到检测为止需要的时间非常长。而且，由于操作复杂，难以自动化。 

因此，期望进一步开发用于ABCG2基因多态性检测的技术。 

发明内容

发明要解决的问题 

本发明要解决的问题在于提供能够高灵敏度且简便地检测ABCG2基因的多态性的多态性检测用探针、使用该探针的多态性检测方法。另外，本发明要解决的问题在于提供使用了该检测方法的药效评价方法和疾病预测方法。此外，本发明要解决的问题还在于提供使用了该检测用探针的多态性检测用试剂盒。 

用于解决问题的手段 

用于解决上述问题的具体手段如下。 

<1>一种ABCG2基因的多态性检测用探针，含有从包括下述P1、P1’、P2、P2’、P3和P3’的组中选择的至少一种荧光标记寡核苷酸： 

(P1)寡核苷酸，其为与含有在序列编号1所示的碱基序列中的第301位～第311位碱基的碱基长为11～50的碱基序列互补的序列，该序列相对于除了与第311位碱基对应的碱基为鸟嘌呤之外与序列编号1互补的序列具有至少80％以上的同一性，并且与第311位碱基对应的碱基用荧光染料标记； 

(P1’)寡核苷酸，其为与含有在序列编号1所示的碱基序列中的第301位～第311位碱基的碱基长为11～50的碱基序列互补的序列，该序列与除了与第311位碱基对应的碱基为鸟嘌呤之外具有与序列编号1相同的 碱基的序列在严谨条件下杂交，并且与第311位碱基对应的碱基用荧光染料标记； 

(P2)寡核苷酸，其为与含有序列编号2所示的碱基序列中的第234位～第251位碱基的碱基长为18～50的碱基序列互补的序列，该序列相对于除了与第251位碱基对应的碱基为鸟嘌呤之外与序列编号2互补的序列具有至少80％以上的同一性，并且与第251位碱基对应的碱基用荧光染料标记； 

(P2’)寡核苷酸，其为与含有序列编号2所示的碱基序列中的第234位～第251位碱基的碱基长为18～50的碱基序列互补的序列，该序列与除了与第251位碱基对应的碱基为鸟嘌呤之外具有与序列编号2相同的碱基的序列在严谨条件下杂交，并且与第251位碱基对应的碱基用荧光染料标记；