[发明专利]NPM1基因的exon12突变检测用探针及其应用无效
申请号: | 201210136861.3 | 申请日: | 2012-04-28 |
公开(公告)号: | CN102758007A | 公开(公告)日: | 2012-10-31 |
发明(设计)人: | 细见敏也 | 申请(专利权)人: | 爱科来株式会社 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11;G01N21/64 |
代理公司: | 北京东方亿思知识产权代理有限责任公司 11258 | 代理人: | 肖善强 |
地址: | 日本*** | 国省代码: | 日本;JP |
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摘要: | |||
搜索关键词: | npm1 基因 exon12 突变 检测 探针 及其 应用 | ||
1.多态性检测用探针,其为用于检测NPM1基因的exon12突变的探针,其特征在于,所述探针为由选自下述的P5、P5’、P6、P6’、P7、P7’、P1、P1’、P2和P2’中的至少一种荧光标记寡核苷酸构成,
(P5)寡核苷酸:具有与序列编号2所示的碱基序列中的、含有编号145~156的碱基的12~50碱基长的碱基序列互补的序列或者与其同源的序列,并且与编号145的碱基对应的碱基为胞嘧啶并用荧光染料标记;
(P5’)寡核苷酸:具有与序列编号2所示的碱基序列中的、含有编号145~156的碱基的12~50碱基长的碱基序列在严谨条件下杂交的碱基序列,并且与编号145的碱基对应的碱基为胞嘧啶并用荧光染料标记;
(P6)寡核苷酸:具有与序列编号2所示的碱基序列中的、含有编号145~156的碱基的12~50碱基长的碱基序列互补的序列或者与其同源的序列,与编号第153位的碱基对应的碱基为鸟嘌呤,与编号145的碱基对应的碱基为胞嘧啶并用荧光染料标记;
(P6’)寡核苷酸:具有与序列编号2所示的碱基序列中的、含有编号145~156的碱基的12~50碱基长的碱基序列在严谨条件下杂交的碱基序列,与编号第153位的碱基对应的碱基为鸟嘌呤,与编号第145位的碱基对应的碱基为胞嘧啶并用荧光染料标记;
(P7)寡核苷酸:具有与序列编号2所示的碱基序列中的、含有编号145~156的碱基的12~50碱基长的碱基序列互补的序列或者与其同源的序列,与编号第153位的碱基对应的碱基为鸟嘌呤,与编号第154位的碱基对应的碱基为胸腺嘧啶,与编号145的碱基对应的碱基为胞嘧啶并用荧光染料标记;
(P7’)寡核苷酸:具有与序列编号2所示的碱基序列中的、含有编号145~156的碱基的12~50碱基长的碱基序列在严谨条件下杂交的碱基序列,与编号第153位的碱基对应的碱基为鸟嘌呤、与编号第154位的碱基对应的碱基为胸腺嘧啶,与编号145的碱基对应的碱基为胞嘧啶并用荧光染料标记:
(P1)寡核苷酸:具有与序列编号1所示的碱基序列中的、含有编号135~150的碱基的16~50碱基长的碱基序列互补的序列或者与其同源的序列,与编号第135位的碱基对应的碱基为胞嘧啶并用荧光染料标记;
(P1’)寡核苷酸:具有与序列编号1所示的碱基序列中的、含有编号135~150的碱基的16~50碱基长的碱基序列在严谨条件下杂交的碱基序列,与编号第135位的碱基对应的碱基为胞嘧啶并用荧光染料标记;
(P2)寡核苷酸:具有与序列编号1所示的碱基序列中的、含有编号164~182位的碱基的19~50碱基长的碱基序列互补的序列或者与其同源的序列,与编号182的碱基对应的碱基为胞嘧啶并用荧光染料标记;以及
(P2’)寡核苷酸:具有与序列编号1所示的碱基序列中的、含有编号164~182的碱基的19~50碱基长的碱基序列在严谨条件下杂交的碱基序列,与编号182的碱基对应的碱基为胞嘧啶并用荧光染料标记。
2.如权利要求1记载的多态性检测用探针,其中,
P5、P5’、P6、P6’、P7和P7’寡核苷酸在3’末端起数第1~3位的位置具有用荧光染料标记的、与编号145的碱基对应的碱基,
P1以及P1’寡核苷酸在3’末端起数第1~3位的位置具有用荧光染料标记的、与编号135的碱基对应的碱基,
P2以及P2’寡核苷酸在5’末端起数第1~3位的位置具有用荧光染料标记的、与编号182的碱基对应的碱基。
3.如权利要求1记载的多态性检测用探针,其中,P5、P5’、P6、P6’、P7和P7’寡核苷酸在3’末端具有用荧光染料标记的、与编号145的碱基对应的碱基,
P1和P1’寡核苷酸在3’末端具有用荧光染料标记的与编号135的碱基对应的碱基,
P2和P2’寡核苷酸在5’末端具有用荧光染料标记的、与编号182的碱基对应的碱基。
4.如权利要求1记载的多态性检测用探针,其中,P1和P1’寡核苷酸以与编号153~156的碱基中的任意碱基对应的碱基为5’末端,并且荧光染料标记的与编号135的碱基对应的碱基位于3’末端;
P2和P2’寡核苷酸以与编号153~156的碱基中的任意碱基对应碱基为3’末端,以荧光染料标记的与编号182的碱基对应的碱基为5’末端。
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