[发明专利]筛查五彩苏类病毒属类病毒的芯片及其应用有效
申请号: | 201210193802.X | 申请日: | 2012-06-12 |
公开(公告)号: | CN102719563A | 公开(公告)日: | 2012-10-10 |
发明(设计)人: | 张永江;辛言言;朱水芳;李世访;李桂芬 | 申请(专利权)人: | 中国检验检疫科学研究院 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11;C40B40/06 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 关畅 |
地址: | 100121 北京市朝*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 五彩 类病毒 芯片 及其 应用 | ||
1.一种鉴定或辅助鉴定五彩苏类病毒属类病毒的探针组,由探针1-探针6共6条探针组成,所述探针1-探针6的核苷酸序列依次分别为序列表中的序列1-6。
2.根据权利要求1所述的探针组,其特征在于:所述五彩苏类病毒属类病毒为CbVd-1、CbVd-2、CbVd-3、CbVd-4、CbVd-5或CbVd-6。
3.一种筛查五彩苏类病毒属类病毒的基因芯片,为将权利要求1或2所述的探针组固定在片基表面得到的基因芯片。
4.根据权利要求3所述的基因芯片,其特征在于:所述片基为醛基化玻璃片基;所述五彩苏类病毒属类病毒为CbVd-1、CbVd-2、CbVd-3、CbVd-4、CbVd-5或CbVd-6。
5.一种筛查五彩苏类病毒属类病毒的试剂盒,包括权利要求3或4所述的基因芯片。
6.根据权利要求5所述的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒还包括用于扩增所述五彩苏类病毒属类病毒的cDNA的引物对,所述引物对具体由序列表中序列7和序列表中序列8所示的DNA分子组成;
所述五彩苏类病毒属类病毒为CbVd-1。
7.权利要求1或2所述探针组、权利要求3或4所述的基因芯片、权利要求5或6所述的试剂盒在如下1)-4)中的应用:
1)鉴定或辅助鉴定五彩苏类病毒属类病毒;
2)制备鉴定或辅助鉴定五彩苏类病毒属类病毒产品;
3)鉴定或辅助鉴定待测植物感染五彩苏类病毒属类病毒;
4)制备鉴定或辅助鉴定待测植物感染五彩苏类病毒属类病毒产品。
8.根据权利要求7所述的应用,其特征在于:所述待测植物为锦紫苏;所述五彩苏类病毒属类病毒为CbVd-1。
9.一种筛查或辅助筛查待测植物感染五彩苏类病毒属类病毒的方法,包括如下步骤:
1)将待测植物的组织的cDNA进行标记,得到标记后产物;
2)将步骤1)得到的标记后产物与权利要求3或4所述的基因芯片进行杂交,得到杂交后芯片;
3)将步骤2)得到的杂交后芯片扫描,
若所述基因芯片上的至少一条所述探针的信号绝对值不小于600且信噪比不小于3.0,则待测植物感染或候选感染五彩苏类病毒属类病毒。
10.根据权利要求9所述的方法,其特征在于:
步骤1)中,所述标记为以所述cDNA为模板,以权利要求6所述的试剂盒中的所述引物对进行PCR扩增,得到PCR产物,再将所述PCR产物进行Klenow酶标记,得到标记后产物;
步骤2)中,所述杂交的温度为42℃,所述杂交的时间为12h;
在所述步骤2)后和步骤3)前还包括将所述杂交后芯片进行洗涤的步骤;
所述至少一条所述探针为所述探针组中的任意一条;
所述组织为叶片;所述待测植物为锦紫苏;
所述五彩苏类病毒属类病毒为CbVd-1。
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