[发明专利]筛查五彩苏类病毒属类病毒的芯片及其应用有效

专利信息
申请号: 201210193802.X 申请日: 2012-06-12
公开(公告)号: CN102719563A 公开(公告)日: 2012-10-10
发明(设计)人: 张永江;辛言言;朱水芳;李世访;李桂芬 申请(专利权)人: 中国检验检疫科学研究院
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11;C40B40/06
代理公司: 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 代理人: 关畅
地址: 100121 北京市朝*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 五彩 类病毒 芯片 及其 应用
【权利要求书】:

1.一种鉴定或辅助鉴定五彩苏类病毒属类病毒的探针组,由探针1-探针6共6条探针组成,所述探针1-探针6的核苷酸序列依次分别为序列表中的序列1-6。

2.根据权利要求1所述的探针组,其特征在于:所述五彩苏类病毒属类病毒为CbVd-1、CbVd-2、CbVd-3、CbVd-4、CbVd-5或CbVd-6。

3.一种筛查五彩苏类病毒属类病毒的基因芯片,为将权利要求1或2所述的探针组固定在片基表面得到的基因芯片。

4.根据权利要求3所述的基因芯片,其特征在于:所述片基为醛基化玻璃片基;所述五彩苏类病毒属类病毒为CbVd-1、CbVd-2、CbVd-3、CbVd-4、CbVd-5或CbVd-6。

5.一种筛查五彩苏类病毒属类病毒的试剂盒,包括权利要求3或4所述的基因芯片。

6.根据权利要求5所述的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒还包括用于扩增所述五彩苏类病毒属类病毒的cDNA的引物对,所述引物对具体由序列表中序列7和序列表中序列8所示的DNA分子组成;

所述五彩苏类病毒属类病毒为CbVd-1。

7.权利要求1或2所述探针组、权利要求3或4所述的基因芯片、权利要求5或6所述的试剂盒在如下1)-4)中的应用:

1)鉴定或辅助鉴定五彩苏类病毒属类病毒;

2)制备鉴定或辅助鉴定五彩苏类病毒属类病毒产品;

3)鉴定或辅助鉴定待测植物感染五彩苏类病毒属类病毒;

4)制备鉴定或辅助鉴定待测植物感染五彩苏类病毒属类病毒产品。

8.根据权利要求7所述的应用,其特征在于:所述待测植物为锦紫苏;所述五彩苏类病毒属类病毒为CbVd-1。

9.一种筛查或辅助筛查待测植物感染五彩苏类病毒属类病毒的方法,包括如下步骤:

1)将待测植物的组织的cDNA进行标记,得到标记后产物;

2)将步骤1)得到的标记后产物与权利要求3或4所述的基因芯片进行杂交,得到杂交后芯片;

3)将步骤2)得到的杂交后芯片扫描,

若所述基因芯片上的至少一条所述探针的信号绝对值不小于600且信噪比不小于3.0,则待测植物感染或候选感染五彩苏类病毒属类病毒。

10.根据权利要求9所述的方法,其特征在于:

步骤1)中,所述标记为以所述cDNA为模板,以权利要求6所述的试剂盒中的所述引物对进行PCR扩增,得到PCR产物,再将所述PCR产物进行Klenow酶标记,得到标记后产物;

步骤2)中,所述杂交的温度为42℃,所述杂交的时间为12h;

在所述步骤2)后和步骤3)前还包括将所述杂交后芯片进行洗涤的步骤;

所述至少一条所述探针为所述探针组中的任意一条;

所述组织为叶片;所述待测植物为锦紫苏;

所述五彩苏类病毒属类病毒为CbVd-1。

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