[发明专利]奶牛白细胞黏附缺陷症焦磷酸测序检测方法无效
申请号: | 201210206052.5 | 申请日: | 2012-06-18 |
公开(公告)号: | CN102732625A | 公开(公告)日: | 2012-10-17 |
发明(设计)人: | 贾广乐;周莉;廖娟红;林祥梅 | 申请(专利权)人: | 中国检验检疫科学研究院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 北京品源专利代理有限公司 11332 | 代理人: | 梁晓霏 |
地址: | 100123 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 奶牛 白细胞 黏附 缺陷 磷酸 检测 方法 | ||
1.用于奶牛白细胞黏附缺陷症焦磷酸测序检测方法的引物,其特征在于,包括针对SNP位点的特异性PCR引物和测序引物,所述特异性PCR引物的序列为:
上游引物CD18F1:5‘-GTTGCGTTCAATGTGACCTTC-3’,
下游引物CD18R2:5‘-GGTCATCCACCATGGAGTAGG-3’,且5’端用生物素标记,
测序引物S2:5‘-TCCGGAGGGCCAAGG-3’。
2.奶牛白细胞黏附缺陷症焦磷酸测序检测方法,其特征在于,利用根据权利要求1所述的引物。
3.根据权利要求2所述的奶牛白细胞黏附缺陷症焦磷酸测序检测方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)用试剂盒方法提取奶牛血液样本基因组DNA;
(2)以步骤(1)获得的基因组DNA为模板,以权利要求1所述的特异性PCR引物为引物,配置PCR Mix反应体系;
(3)按照标准操作对步骤(2)获得的PCR产物进行单链的分离纯化和焦磷酸测序。
4.根据权利要求2或3所述的奶牛白细胞黏附缺陷症焦磷酸测序检测方法,其特征在于,所述步骤(1)的具体步骤为:
①吸取300μL新鲜血液,加入3倍体积红细胞裂解液,颠倒混匀,放置5min,放置期间颠倒混匀几次,10000r/min离心1min,吸去上清,留下白细胞沉淀,加200μL缓冲液GA,振荡至彻底混匀;
②加入20μL蛋白酶K溶液,混匀;
③加入200μL缓冲液GB,剧烈颠倒混匀,70℃放置10min,溶液变清亮,简短离心;
④加入200μL无水乙醇,充分振荡混匀15s,此时可能会出现絮状沉淀,简短离心;
⑤将上一步所得溶液和絮状沉淀都加入一个吸附柱CB3中(吸附柱放入收集管中),12000r/min离心30s,倒掉废液,将吸附柱CB3放入收集管中;
⑥向吸附柱CB3中加入500μL缓冲液GD,12000r/min离心30s,倒掉废液,将吸附柱CB3放入收集管中;
⑦向吸附柱CB3中加入700μL漂洗液PW,12000r/min离心30s,倒掉废液,将吸附柱CB3放入收集管中;
⑧向吸附柱CB3中加入500μL漂洗液PW,12000r/min离心30s,倒掉废液;
⑨将吸附柱CB3放回收集管中,12000r/min离心2min,倒掉废液,将吸附柱CB3置于室温放置数分钟,以彻底晾干吸附材料中残余的漂洗液;
⑩将吸附柱CB3转入干净的离心管中,向吸附膜的中间部位悬空滴加100μL洗脱液TE,室温放置5min,12000r/min离心2min,将溶液收集到离心管中,管中为提取的牛血液基因组DNA,置于-20℃保存。
5.根据权利要求2-4之一所述的奶牛白细胞黏附缺陷症焦磷酸测序检测方法,其特征在于,步骤(2)所述的PCR Mix反应体系为:25μL 2×PCR TaqMix、1μL上游引物CD18F1、1μL下游引物CD18R2、2μL牛血液基因组DNA、21μLddH2O;PCR反应程序为95℃预变性5min,95℃变性15s、62℃退火30s、72℃延伸30s,45-50个循环,72℃5min。
6.根据权利要求2-5之一所述的奶牛白细胞黏附缺陷症焦磷酸测序检测方法,其特征在于,所述PCR反应程序为50个循环。
7.根据权利要求2-6之一所述的奶牛白细胞黏附缺陷症焦磷酸测序检测方法,其特征在于,所述上游引物和下游引物的量在50μL的PCR反应体系中为5-10pmol。
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