[发明专利]奶牛白细胞黏附缺陷症焦磷酸测序检测方法无效

专利信息
申请号: 201210206052.5 申请日: 2012-06-18
公开(公告)号: CN102732625A 公开(公告)日: 2012-10-17
发明(设计)人: 贾广乐;周莉;廖娟红;林祥梅 申请(专利权)人: 中国检验检疫科学研究院
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 北京品源专利代理有限公司 11332 代理人: 梁晓霏
地址: 100123 *** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 奶牛 白细胞 黏附 缺陷 磷酸 检测 方法
【权利要求书】:

1.用于奶牛白细胞黏附缺陷症焦磷酸测序检测方法的引物,其特征在于,包括针对SNP位点的特异性PCR引物和测序引物,所述特异性PCR引物的序列为:

上游引物CD18F1:5‘-GTTGCGTTCAATGTGACCTTC-3’,

下游引物CD18R2:5‘-GGTCATCCACCATGGAGTAGG-3’,且5’端用生物素标记,

测序引物S2:5‘-TCCGGAGGGCCAAGG-3’。

2.奶牛白细胞黏附缺陷症焦磷酸测序检测方法,其特征在于,利用根据权利要求1所述的引物。

3.根据权利要求2所述的奶牛白细胞黏附缺陷症焦磷酸测序检测方法,其特征在于,包括如下步骤:

(1)用试剂盒方法提取奶牛血液样本基因组DNA;

(2)以步骤(1)获得的基因组DNA为模板,以权利要求1所述的特异性PCR引物为引物,配置PCR Mix反应体系;

(3)按照标准操作对步骤(2)获得的PCR产物进行单链的分离纯化和焦磷酸测序。

4.根据权利要求2或3所述的奶牛白细胞黏附缺陷症焦磷酸测序检测方法,其特征在于,所述步骤(1)的具体步骤为:

①吸取300μL新鲜血液,加入3倍体积红细胞裂解液,颠倒混匀,放置5min,放置期间颠倒混匀几次,10000r/min离心1min,吸去上清,留下白细胞沉淀,加200μL缓冲液GA,振荡至彻底混匀;

②加入20μL蛋白酶K溶液,混匀;

③加入200μL缓冲液GB,剧烈颠倒混匀,70℃放置10min,溶液变清亮,简短离心;

④加入200μL无水乙醇,充分振荡混匀15s,此时可能会出现絮状沉淀,简短离心;

⑤将上一步所得溶液和絮状沉淀都加入一个吸附柱CB3中(吸附柱放入收集管中),12000r/min离心30s,倒掉废液,将吸附柱CB3放入收集管中;

⑥向吸附柱CB3中加入500μL缓冲液GD,12000r/min离心30s,倒掉废液,将吸附柱CB3放入收集管中;

⑦向吸附柱CB3中加入700μL漂洗液PW,12000r/min离心30s,倒掉废液,将吸附柱CB3放入收集管中;

⑧向吸附柱CB3中加入500μL漂洗液PW,12000r/min离心30s,倒掉废液;

⑨将吸附柱CB3放回收集管中,12000r/min离心2min,倒掉废液,将吸附柱CB3置于室温放置数分钟,以彻底晾干吸附材料中残余的漂洗液;

⑩将吸附柱CB3转入干净的离心管中,向吸附膜的中间部位悬空滴加100μL洗脱液TE,室温放置5min,12000r/min离心2min,将溶液收集到离心管中,管中为提取的牛血液基因组DNA,置于-20℃保存。

5.根据权利要求2-4之一所述的奶牛白细胞黏附缺陷症焦磷酸测序检测方法,其特征在于,步骤(2)所述的PCR Mix反应体系为:25μL 2×PCR TaqMix、1μL上游引物CD18F1、1μL下游引物CD18R2、2μL牛血液基因组DNA、21μLddH2O;PCR反应程序为95℃预变性5min,95℃变性15s、62℃退火30s、72℃延伸30s,45-50个循环,72℃5min。

6.根据权利要求2-5之一所述的奶牛白细胞黏附缺陷症焦磷酸测序检测方法,其特征在于,所述PCR反应程序为50个循环。

7.根据权利要求2-6之一所述的奶牛白细胞黏附缺陷症焦磷酸测序检测方法,其特征在于,所述上游引物和下游引物的量在50μL的PCR反应体系中为5-10pmol。

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