[发明专利]一种鉴定水稻低植酸突变体zju-lpa2杂交后代基因型的引物及方法有效
申请号: | 201210297521.9 | 申请日: | 2012-08-21 |
公开(公告)号: | CN102808029A | 公开(公告)日: | 2012-12-05 |
发明(设计)人: | 舒庆尧;赵海军;徐秀红 | 申请(专利权)人: | 浙江大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 杭州天勤知识产权代理有限公司 33224 | 代理人: | 胡红娟 |
地址: | 310027 浙*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 鉴定 水稻 低植酸 突变体 zju lpa2 杂交 后代 基因型 引物 方法 | ||
1.一种引物,其特征在于,为引物ZHJ1、引物ZHJ2或它们的组合;其中,引物ZHJ1的碱基序列为:
正向引物序列:5’-TCCTTTAGTCTAGGACCGTTGG-3’;
反向引物序列:5’-AGCCGCTTCTTGGAGTGAT-3’
和5’-ACCAGGGATGCCGTTGAG-3’;
引物ZHJ2的碱基序列为:
正向引物序列:5’-AGCCGCTTCTTGGAGTGAT-3’
和5’-ACCAGGGATGCCGTTGAG-3’;
反向引物序列:5’-AGCCGCTTCTTGGAGTGAT-3’。
2.一种鉴定水稻低植酸突变体zju-lpa2杂交后代基因型的方法,包括:
(1)提取水稻样品苗期叶片总DNA;
(2)以所述总DNA为模板,利用权利要求1所述的引物进行PCR扩增,扩增产物经凝胶电泳分离,染色后拍照成像;
(3)根据成像结果,判断水稻样品的基因型;
当利用引物ZHJ1进行PCR扩增,如果只出现350bp特征带,则该水稻样品为含低植酸基因ZJU-LPA2的纯合型材料,如果只出现498bp特征带,则该水稻样品为不含低植酸基因ZJU-LPA2的纯合型材料,如果同时出现350bp和498bp特征带,则该水稻样品为含低植酸基因ZJU-LPA2的杂合型材料;
当利用引物ZHJ2进行PCR扩增,如果只出现754bp特征带,则该水稻样品为含低植酸基因ZJU-LPA2的纯合型材料,如果只出现498bp特征带,则该水稻样品为不含低植酸基因ZJU-LPA2的纯合型材料,如果同时出现754bp和498bp特征带,则该水稻样品为含低植酸基因ZJU-LPA2的杂合型材料;
当利用引物ZHJ1和引物ZHJ2进行PCR扩增,如果只出现350bp和754bp特征带,则该水稻样品为含低植酸基因ZJU-LPA2的纯合型材料,如果只出现498bp特征带,则该水稻样品为不含低植酸基因ZJU-LPA2的纯合型材料,如果同时出现350bp、754bp和498bp特征带,则该水稻样品为含低植酸基因ZJU-LPA2的杂合型材料;
所述的低植酸基因ZJU-LPA2的碱基序列如SEQ ID NO.1所示。
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,采用CTAB法提取总DNA。
4.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述PCR扩增的反应体系为20μL,其中,2×PCR Master Mix缓冲液10μL、10μM正反向引物各0.4μL、总DNA1μL、无菌水补足至20μL。
5.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述PCR扩增的反应程序为:94℃预变性4min;94℃变性30s,57℃退火45s,72℃延伸1min,35个循环;最后72℃延伸7min。
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