[发明专利]一种定性检测松材线虫的试剂盒及其检测方法有效
申请号: | 201210303532.3 | 申请日: | 2012-08-24 |
公开(公告)号: | CN102827933A | 公开(公告)日: | 2012-12-19 |
发明(设计)人: | 叶建仁;胡林;陈凤毛;侯建华;吴小芹;孙波;黄麟;詹国辉;徐高连;贺君丽;范椰;吴芳 | 申请(专利权)人: | 南京林业大学;杭州优思达生物技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 南京苏高专利商标事务所(普通合伙) 32204 | 代理人: | 邱兴天 |
地址: | 210037 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 定性 检测 松材线虫 试剂盒 及其 方法 | ||
1.一种定性检测松材线虫的试剂盒,其特征在于,试剂包括:DNA提取液,松材线虫核酸恒温扩增反应液,阳性对照和阴性对照;其中,阳性对照为含有松材线虫BxS1基因DNA片段的质粒,阴性对照为无菌双蒸水;
所述的松材线虫核酸恒温扩增反应液的组成为:0.1~0.2μmol正向外围引物,0.1~0.2μmol反向外围引物,0.1~0.5μmol正向交叉引物,0.1~0.5μmol反向交叉引物,0.1~0.5μmol正向探针,0.1~0.5μmol反向探针,1~6mmol MgSO4,0.2~0.4mmol dNTPs溶液,6~10U Gst DNA聚合酶,2μL 10×Thermol buffer,无菌双蒸水补足到16μL;
所述的正向外围引物序列为5’-TCCTCACCTGGCTCTT-3’;反向外围引物序列为’-CTAAACTCCCCATCTC-3’;两条探针的序列分别为:正向5’端Biotin标记探针5-biotin- TCTTTTCGGCCACACC-3’,正向3’端异硫氰酸荧光素(FitC)标记探针5- AGGCGTTCACCAGT- FITC;扩增交叉引物分别为:反向交叉引物5’- GTCTTTTCGGCCACACCACTGTGGTCGAGAACC -3’,正向交叉引物5’-GACGTCGCATGTAGC-3’。
2.根据权利要求1所述的定性检测松材线虫的试剂盒,其特征在于:所述的10×Thermol buffer的组分为:20mM Tris-HCl、10mM KCl、10mM (NH4)2SO4、2mM MgSO4、质量浓度为0.1%的Triton X-100,pH8.8。
3.根据权利要求1所述的定性检测松材线虫的试剂盒,其特征在于:所述的含有松材线虫BxS1基因的DNA片段为长193bp的基因序列,具体序列如下SEQ ID NO:7所示。
4.根据权利要求1或3所述的松材线虫检测试剂盒,其特征在于:所述的含有松材线虫BxS1基因DNA片段的质粒,由以下方法制备:
(1)利用正向外围引物和反向外围引物,以松材线虫的基因组DNA为模板,进行PCR扩增获得目的基因的PCR扩增产物;
(2)纯化PCR扩增产物;
(3)将纯化后的扩增产物通过质粒转染试剂盒构建质粒;
(4)抽提质粒,定量并稀释至105拷贝,-20℃保存。
5.权利要求1所述的试剂盒定性检测松材线虫的方法,其特征在于,包括以下步骤:
a)用DNA提取液从待检测的标本中提取DNA;
b)以提取得到的DNA作为模板,加入到装有恒温扩增反应液的PCR管中,对照PCR管中分别加入标准阳性模板和标准阴性模板,在60~65℃下扩增反应60~65min;
c)将反应后的PCR管放置到核酸防污染检测装置中进行检测,15min以后判读结果。
6.根据权利要求5所述的试剂盒定性检测松材线虫的方法,其特征在于:步骤b)中,63℃下扩增反应60min。
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