[发明专利]检测炭疽杆菌的引物、双重LAMP检测炭疽杆菌的试剂盒及快速可视化检测方法无效
申请号: | 201210306985.1 | 申请日: | 2012-08-24 |
公开(公告)号: | CN102816849A | 公开(公告)日: | 2012-12-12 |
发明(设计)人: | 张锦海;王长军;谭维国;吕恒;曹勇平 | 申请(专利权)人: | 中国人民解放军南京军区军事医学研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12N15/11 |
代理公司: | 南京苏科专利代理有限责任公司 32102 | 代理人: | 何朝旭 |
地址: | 210002 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 炭疽 杆菌 引物 双重 lamp 试剂盒 快速 可视化 方法 | ||
1.一种用于LAMP检测炭疽杆菌的引物,其特征是,包括lef引物序列集和gyrB引物序列集;其中,
lef引物序列集包括外引物对LF-F3和LF-B3,以及内引物对LF-FIP和LF-BIP;LF-F3的序列如SEQ ID NO:1所示,LF-B3的序列如SEQ ID NO:2所示,LF-FIP的序列如SEQ ID NO:3所示,LF-BIP的序列如SEQ ID NO:4所示;
gyrB引物序列集包括外引物对gy-F3和gy-B3,内引物对gy-FIP和gy-BIP,以及环引物对gy-LF和gy-LB;gy-F3的序列如SEQ ID NO:5所示,gy-B3的序列如SEQ ID NO:6所示,gy-FIP的序列如SEQ ID NO:7所示,gy-BIP的序列如SEQ ID NO:8所示,gy-LF的序列如SEQ ID NO:9所示,gy-LB的序列如SEQ ID NO:10所示。
2.一种双重LAMP检测炭疽杆菌的试剂盒,其特征是,包括权利要求1所述用于LAMP检测炭疽杆菌的引物。
3.根据权利要求2所述双重LAMP检测炭疽杆菌的试剂盒,其特征是,还包括2×反应缓冲液,所述反应缓冲液含有30-60mmol/L pH8.8的Tris-HCl,16-30mmol/L的KCl,10-30mmol/L的(NH4)2SO4,质量浓度为0.1-0.3%的TritonX-100,由浓度均为2.0-3.6mmol/L的dATP、dTTP、dCTP、dGTP组成的dNTPs,0.1-2.0mmol/L的甜菜碱C5H11NO2,以及14-18mmol/L的MgCl2。
4.根据权利要求3所述双重LAMP检测炭疽杆菌的试剂盒,其特征是,还包括浓度为6-12U/μl的BstDNA聚合酶,以及浓度为2-20mmol/L的金属离子指示剂HNB储存液。
5.根据权利要求4所述双重LAMP检测炭疽杆菌的试剂盒,其特征是,还包括阳性对照品:浓度为20-100mg/L的含有炭疽杆菌lef基因片段及gyrB基因片段的质粒PGEM-lef-gyrb。
6.一种双重LAMP检测炭疽杆菌的快速可视化检测方法,其特征是,采用权利要求5所述双重LAMP检测炭疽杆菌的试剂盒,该方法包括以下步骤:
第一步、向透明反应管A、B中分别加入体积相同的试剂盒2×反应缓冲液、I管或Ⅱ管的引物混合液、BstDNA聚合酶、显色液、超纯水,然后混合,得到体积相同的反应液A、B;其中反应管A中加入I管的引物混合液,反应管B中加入Ⅱ管的引物混合液;试剂盒2×反应缓冲液、I管或Ⅱ管的引物混合液、BstDNA聚合酶、显色液、超纯水的体积比为(8-12):(1.5-3.5):(0.5-1.5):(0.3-0.9):(3.1-4.7);
第二步、向反应管A、B中分别加入体积相同的待测核酸样品,盖好反应管A、B后混匀;
第三步、将反应管A、B先分别在60℃-64℃恒温条件下放置45-80min进行LAMP扩增,再置于80℃-95℃5-10min灭活BstDNA聚合酶;
第四步、观察反应液A、B的颜色,若两者颜色均为天蓝色,则待测核酸样品的来源含有炭疽杆菌强毒株或弱毒株;若两者颜色均为紫罗兰色,则待测核酸样品的来源不含炭疽杆菌;若反应液A颜色为紫罗兰色,且反应液B颜色为天蓝色,则待测核酸样品的来源含有炭疽杆菌弱毒株或无毒株;若反应液A颜色为天蓝色,且反应液B颜色为紫罗兰色,则待测核酸样品的来源含有具有毒性质粒pX01的蜡样芽胞杆菌。
7.一种针对权利要求5所述双重LAMP检测炭疽杆菌的试剂盒的检验方法,其特征是,包括以下步骤:
第一步、制备两套含反应液A的反应管A、含反应液B的反应管B:向透明反应管A、B中分别加入体积相同的试剂盒2×反应缓冲液、I管或Ⅱ管的引物混合液、BstDNA聚合酶、显色液、超纯水,然后混合,得到体积相同的反应液A、B;其中反应管A中加入I管的引物混合液,反应管B中加入Ⅱ管的引物混合液;试剂盒2×反应缓冲液、I管或Ⅱ管的引物混合液、BstDNA聚合酶、显色液、超纯水的体积比为(8-12):(1.5-3.5):(0.5-1.5):(0.3-0.9):(3.1-4.7);
第二步、向第一套反应管A、B中分别加入体积相同的蒸馏水,盖好反应管A、B后混匀,作为阴性对照;向第二套反应管A、B中分别加入体积相同的阳性对照品,盖好反应管A、B后混匀,作为阳性对照;蒸馏水、阳性对照品的加入体积相同;
第三步、将反应管A、B先分别在60℃-64℃恒温条件下放置45-80min进行LAMP扩增,再置于80℃-95℃5-10min灭活BstDNA聚合酶;
第四步、观察阴性对照反应液A、B和阳性对照反应液A、B的颜色,若阴性对照反应液A、B颜色均为紫罗兰色,且阳性对照反应液A、B颜色均为天蓝色,则第一步所用试剂盒是正常的;若各反应液颜色与前述情况不完全相符或完全不相符,则第一步所用试剂盒不正常。
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