[发明专利]QC-PCR检测禽坦布苏病毒竞争模板的扩增引物、制备方法和禽坦布苏病毒检测试剂盒无效

专利信息
申请号: 201210368141.X 申请日: 2012-09-27
公开(公告)号: CN102839226A 公开(公告)日: 2012-12-26
发明(设计)人: 张琳;袁朋;张秀美;胡北侠;许传田;杨少华;徐敏丽 申请(专利权)人: 山东省农业科学院畜牧兽医研究所
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11;C12N15/10;C12R1/93
代理公司: 济南泉城专利商标事务所 37218 代理人: 李桂存
地址: 250100 *** 国省代码: 山东;37
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摘要:
搜索关键词: qc pcr 检测 禽坦布苏 病毒 竞争 模板 扩增 引物 制备 方法 试剂盒
【说明书】:

技术领域    

发明涉及病毒检测技术领域,特别涉及QC-PCR检测禽坦布苏病毒的竞争模板的引物,还涉及此竞争模板的制备方法,还涉及禽坦布苏病毒检测试剂盒。

背景技术   

2010年4月以来,在我国山东、江苏、 浙江、广西等养禽集中区域爆发了一种疾病,以种禽产蛋严重下降、肉禽出现神经症状为特点,后证实是由坦布苏病毒(Tembusu virus)所引起, 目前研究人员已先后在鸭、鹅、鸡、麻雀等体内分离到该病毒,同时也已证实该病毒在养禽区域定植。禽坦布苏病毒属于黄病毒科黄病毒属蚊媒病毒类恩塔亚病毒群,是一种新发黄病毒,给中国的养禽业带来了极大的经济损失。

禽坦布苏病毒病毒活力较低,滴度下降快,造成病毒滴度不稳定,所以给病毒的定量带来了一定的困难。目前对禽类病毒定量的方法主要是荧光定量PCR和半数鸡胚感染量(EID50)的测定,但前者存在仪器昂贵、使用成本高和易污染等方面的缺点;而后者则需要将病毒接种SPF鸡胚或者鸭胚,统计不同病毒稀释度对胚体的感染量,一般需要5-6天时间,耗时长、工作量大,加之禽坦布苏病毒活力低,所以更不适合使用EID50进行含量的测定。此外,一般的PCR检测方法只能进行定性的检测,而不能定量,不能满足部分实验的要求。

发明内容   

为了解决以上禽坦布苏病毒检测中存在的仪器昂贵、使用成本高、易污染、耗时长、工作量大、禽坦布苏病毒活力低的问题,本发明提供了QC-PCR检测禽坦布苏病毒的竞争模板的扩增引物。

本发明还提供了上述QC-PCR检测禽坦布苏病毒的竞争模板的制备方法。

本发明的另一个目的是提供禽坦布苏病毒检测试剂盒。

本发明是通过以下步骤实现的:

一种QC-PCR检测禽坦布苏病毒的竞争模板的扩增引物,核苷酸序列如下:

引物1:5’-ATGACTGACACNACTCCNTTTG-3’,

引物2:5’-CCNARCCACATRWACCATTYTCHCTYTTBCCCATCATGTT-3’。

一种QC-PCR检测禽坦布苏病毒的竞争模板的制备方法,包括以下步骤:

(1)提取禽坦布苏病毒RNA,进行反转录得到禽坦布苏病毒的cDNA一链;

(2)进行PCR扩增,扩增体系中含有步骤(1)得到的cDNA一链、引物1和引物2,胶回收得到QC-PCR检测禽坦布苏病毒的竞争模板;

引物1核苷酸序列:5’-ATGACTGACACNACTCCNTTTG-3’,

引物2核苷酸序列:5’-CCNARCCACATRWACCATTYTCHCTYTTBCCCATCATGTT-3’。

所述PCR扩增体系组成:10×Ex Taqbuffer 2.5μL,2.5mM的dNTP2μL,引物1和引物2各0.5μL,Ex Taq 酶0.5μL,cDNA一链0.5μL, ddH2O补足25μL;

引物1和引物2的浓度各为100pmol/μL;

cDNA一链浓度为2.5ng/μL;

Taq 酶浓度为5U/μL。

所述PCR扩增反应条件:98℃预变性5min;94℃变性30s,47℃退火30s,72℃延伸40s, 30个循环;再72℃延伸10min,4℃终止反应。

一种禽坦布苏病毒检测试剂盒,含有8个子PCR扩增体系,每个PCR扩增体系组成为:10×Ex Taqbuffer 2.5μL,2.5mM 的dNTP 2μL,引物1和引物3各0.5μL,Ex Taq 酶0.5μL,竞争模板0.5μL,ddH2O补足24.5μL;

引物1核苷酸序列:5’-ATGACTGACACNACTCCNTTTG-3’,

引物3核苷酸序列:5’-CCNARCCACATRWACCA-3’; 

引物1和引物3的浓度各为100pmol/μL;

8个子PCR扩增体系竞争模板的浓度,自4×109-4×102竞争模板/扩增体系以10倍的浓度梯度设置;

Taq 酶浓度为5U/μL。

所述的禽坦布苏病毒检测试剂盒,其特征是使用时向PCR扩增体系中加入待检样品病毒cDNA 0.5μL。

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