[发明专利]QC-PCR检测禽坦布苏病毒竞争模板的扩增引物、制备方法和禽坦布苏病毒检测试剂盒无效
申请号: | 201210368141.X | 申请日: | 2012-09-27 |
公开(公告)号: | CN102839226A | 公开(公告)日: | 2012-12-26 |
发明(设计)人: | 张琳;袁朋;张秀美;胡北侠;许传田;杨少华;徐敏丽 | 申请(专利权)人: | 山东省农业科学院畜牧兽医研究所 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11;C12N15/10;C12R1/93 |
代理公司: | 济南泉城专利商标事务所 37218 | 代理人: | 李桂存 |
地址: | 250100 *** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | qc pcr 检测 禽坦布苏 病毒 竞争 模板 扩增 引物 制备 方法 试剂盒 | ||
技术领域
本发明涉及病毒检测技术领域,特别涉及QC-PCR检测禽坦布苏病毒的竞争模板的引物,还涉及此竞争模板的制备方法,还涉及禽坦布苏病毒检测试剂盒。
背景技术
2010年4月以来,在我国山东、江苏、 浙江、广西等养禽集中区域爆发了一种疾病,以种禽产蛋严重下降、肉禽出现神经症状为特点,后证实是由坦布苏病毒(Tembusu virus)所引起, 目前研究人员已先后在鸭、鹅、鸡、麻雀等体内分离到该病毒,同时也已证实该病毒在养禽区域定植。禽坦布苏病毒属于黄病毒科黄病毒属蚊媒病毒类恩塔亚病毒群,是一种新发黄病毒,给中国的养禽业带来了极大的经济损失。
禽坦布苏病毒病毒活力较低,滴度下降快,造成病毒滴度不稳定,所以给病毒的定量带来了一定的困难。目前对禽类病毒定量的方法主要是荧光定量PCR和半数鸡胚感染量(EID50)的测定,但前者存在仪器昂贵、使用成本高和易污染等方面的缺点;而后者则需要将病毒接种SPF鸡胚或者鸭胚,统计不同病毒稀释度对胚体的感染量,一般需要5-6天时间,耗时长、工作量大,加之禽坦布苏病毒活力低,所以更不适合使用EID50进行含量的测定。此外,一般的PCR检测方法只能进行定性的检测,而不能定量,不能满足部分实验的要求。
发明内容
为了解决以上禽坦布苏病毒检测中存在的仪器昂贵、使用成本高、易污染、耗时长、工作量大、禽坦布苏病毒活力低的问题,本发明提供了QC-PCR检测禽坦布苏病毒的竞争模板的扩增引物。
本发明还提供了上述QC-PCR检测禽坦布苏病毒的竞争模板的制备方法。
本发明的另一个目的是提供禽坦布苏病毒检测试剂盒。
本发明是通过以下步骤实现的:
一种QC-PCR检测禽坦布苏病毒的竞争模板的扩增引物,核苷酸序列如下:
引物1:5’-ATGACTGACACNACTCCNTTTG-3’,
引物2:5’-CCNARCCACATRWACCATTYTCHCTYTTBCCCATCATGTT-3’。
一种QC-PCR检测禽坦布苏病毒的竞争模板的制备方法,包括以下步骤:
(1)提取禽坦布苏病毒RNA,进行反转录得到禽坦布苏病毒的cDNA一链;
(2)进行PCR扩增,扩增体系中含有步骤(1)得到的cDNA一链、引物1和引物2,胶回收得到QC-PCR检测禽坦布苏病毒的竞争模板;
引物1核苷酸序列:5’-ATGACTGACACNACTCCNTTTG-3’,
引物2核苷酸序列:5’-CCNARCCACATRWACCATTYTCHCTYTTBCCCATCATGTT-3’。
所述PCR扩增体系组成:10×Ex Taqbuffer 2.5μL,2.5mM的dNTP2μL,引物1和引物2各0.5μL,Ex Taq 酶0.5μL,cDNA一链0.5μL, ddH2O补足25μL;
引物1和引物2的浓度各为100pmol/μL;
cDNA一链浓度为2.5ng/μL;
Taq 酶浓度为5U/μL。
所述PCR扩增反应条件:98℃预变性5min;94℃变性30s,47℃退火30s,72℃延伸40s, 30个循环;再72℃延伸10min,4℃终止反应。
一种禽坦布苏病毒检测试剂盒,含有8个子PCR扩增体系,每个PCR扩增体系组成为:10×Ex Taqbuffer 2.5μL,2.5mM 的dNTP 2μL,引物1和引物3各0.5μL,Ex Taq 酶0.5μL,竞争模板0.5μL,ddH2O补足24.5μL;
引物1核苷酸序列:5’-ATGACTGACACNACTCCNTTTG-3’,
引物3核苷酸序列:5’-CCNARCCACATRWACCA-3’;
引物1和引物3的浓度各为100pmol/μL;
8个子PCR扩增体系竞争模板的浓度,自4×109-4×102竞争模板/扩增体系以10倍的浓度梯度设置;
Taq 酶浓度为5U/μL。
所述的禽坦布苏病毒检测试剂盒,其特征是使用时向PCR扩增体系中加入待检样品病毒cDNA 0.5μL。
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