[发明专利]一种基于DNA折纸的生物分子亲和常数测定方法无效
申请号: | 201210391472.5 | 申请日: | 2012-10-15 |
公开(公告)号: | CN102955047A | 公开(公告)日: | 2013-03-06 |
发明(设计)人: | 樊友杰;李宾;吴娜;胡钧 | 申请(专利权)人: | 中国科学院上海应用物理研究所 |
主分类号: | G01Q60/34 | 分类号: | G01Q60/34 |
代理公司: | 上海智信专利代理有限公司 31002 | 代理人: | 钟华;沈利 |
地址: | 201800 上*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 dna 折纸 生物 分子 亲和 常数 测定 方法 | ||
1.一种基于DNA折纸的生物分子的亲和常数测定方法,其特征在于,所述生物分子包括能够彼此结合与解离的反应物Ⅰ和反应物Ⅱ,该测定方法包括以下步骤:
(1)将反应物Ⅰ连接于DNA折纸订书钉链末端,然后和脚手架链自组装形成DNA折纸;
(2)加入反应物Ⅱ,反应达到平衡后利用原子力显微镜扫描成像收集数据,计算出反应物I和反应物Ⅱ复合物的浓度[AbAg],游离的反应物Ⅰ的浓度[Ag]以及游离的反应物Ⅱ的浓度[Ab];
(3)将步骤(2)所得数值代入如下公式,K=[AbAg]/[Ag][Ab],计算得到所述反应物Ⅰ和反应物Ⅱ的亲和常数K。
2.如权利要求1所述的测定方法,其特征在于,所述反应物Ⅰ和反应物Ⅱ包括:抗原和抗体,生物素和亲和素,核酸适配体及其靶分子以及配体和受体中的一组或几组。
3.如权利要求2所述的测定方法,其特征在于,所述反应物Ⅰ和反应物Ⅱ是地高辛和地高辛抗体。
4.如权利要求1所述的测定方法,其特征在于,步骤(1)所述订书钉链和脚手架链自组装形成DNA折纸包括:将脚手架链与订书钉链混合后置于1×TAE/Mg2+缓冲液体系,其中所述订书钉链的末端连接有反应物Ⅰ,所述脚手架链与订书钉链的摩尔比为1:10~1:5,再置于PCR仪上从95℃退火至20℃,退火速度为0.1℃/10秒,即形成所述DNA折纸。
5.如权利要求4所述的测定方法,其特征在于,所述订书钉链和脚手架链自组装形成的DNA折纸是二维DNA折纸。
6.如权利要求5所述的测定方法,其特征在于,所述二维DNA折纸为100nm×70nm的矩形DNA折纸。
7.如权利要求1所述的测定方法,其特征在于,步骤(2)所述原子力显微镜成像法包括以下步骤:将反应达到平衡的溶液滴加于云母片上进行吸附,将吸附完毕的云母片放置于注有缓冲液的液体槽中,置于原子力显微镜下,于液相轻敲模式进行扫描成像操作。
8.如权利要求7所述的测定方法,其特征在于,所述云母片是新解离的云母片,所述吸附的时间是2~5分钟。
9.如权利要求7所述的测定方法,其特征在于,所述缓冲液为1×TAE/Mg2+缓冲液,所述缓冲液的用量为30μL~50μL,所述的液体槽为配有细口径导管的两孔的液体槽。
10.如权利要求7所述的测定方法,其特征在于,所述原子力显微镜成像法为:使用小力成像;所述扫描的速率为1~3Hz,所述扫描的线数为256~512。
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