[发明专利]RET融合基因检测的PCR引物、试剂盒和液相芯片

权利要求书

1.一种检测RET融合基因的PCR引物，其特征是，所述PCR引物为：针对K15;R12的SEQID NO.1和SEQ ID NO.4、针对K16;R12的SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.5、针对K22;R12和K23;R12的SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.6、针对K24;R8的SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.7、针对K24;R11的SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.7、和/或针对C1;R12的SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.8。

2.一种检测RET融合基因的PCR试剂盒，其特征是，包括有权利要求1所述的PCR引物。

3.根据权利要求2所述的PCR试剂盒，其特征是，所述试剂盒还包括有阳性对照品，所述阳性对照品为：针对K15;R12的含有SEQ ID NO.1和与SEQ ID NO.4反向互补配对的序列的核酸片段、针对K16;R12的含有SEQ ID NO.1和与SEQ ID NO.5反向互补配对的序列的核酸片段、针对K22;R12和K23;R12的含有SEQ ID NO.1和与SEQ ID NO.6反向互补配对的序列的核酸片段、针对K24;R8的含有SEQ ID NO.2和与SEQ ID NO.7反向互补配对的序列的核酸序列、针对K24;R11的含有SEQ ID NO.3和与SEQ ID NO.7反向互补配对的序列的核酸片段、和/或针对C1;R12的含有SEQ ID NO.1和与SEQ ID NO.8反向互补配对的序列的核酸片段。

4.根据权利要求3所述的PCR试剂盒，其特征是，所述阳性对照品为：针对K15;R12的SEQ ID NO.9、针对K16;R12的SEQ ID NO.10、针对K22;R12的SEQ ID NO.11、针对K23;R12的SEQ ID NO.12、针对K24;R8的SEQ ID NO.13、针对K24;R11的SEQ ID NO.14、和/或针对C1;R12的SEQ ID NO.15。

5.一种RET融合基因检测的液相芯片，其特征是，包括有：

（A）权利要求1所述的PCR引物；

（B）针对RET融合基因不同融合类型分别设计的ASPE引物：每条ASPE引物由5’端的tag序列和3’端针对目的融合类型的特异性引物序列组成，所述特异性引物序列为：针对K15;R12的SEQ ID NO.23、针对K16;R12的SEQ ID NO.24、针对K22;R12的SEQ ID NO.25、针对K23;R12的SEQ ID NO.26、针对K24;R8的SEQ ID NO.27、针对K24;R11的SEQ ID NO.28、和/或针对C1;R12的SEQ ID NO.29；所述tag序列选自SEQ ID NO.16～SEQ ID NO.22；

（C）有anti-tag序列包被的、具有不同颜色编码的微球，所述anti-tag序列与微球连接中间还设有间隔臂序列；所述anti-tag序列选自SEQ ID NO.30～SEQ ID NO.36，且所述anti-tag序列能相应地与（B）中所选的tag序列互补配对。

6.根据权利要求5所述的所述液相芯片，其特征是，所述ASPE引物为：针对K15;R12的由SEQ ID NO.16和SEQ ID NO.23组成的序列、针对K16;R12的由SEQ ID NO.17和SEQ IDNO.24组成的序列、针对K22;R12的由SEQ ID NO.18和SEQ ID NO.25组成的序列、针对K23;R12的由SEQ ID NO.19和SEQ ID NO.26组成的序列、针对K24;R8的由SEQ ID NO.20和SEQ ID NO.27组成的序列、针对K24;R11的由SEQ ID NO.21和SEQ ID NO.28组成的序列、和/或针对C1;R12的由SEQ ID NO.22和SEQ ID NO.29组成的序列。

7.根据权利要求5或6所述的液相芯片，其特征是，所述间隔臂为5－10个T。

8.一种用于检测RET融合基因的特异性引物，其特征是，所述特异性引物为：针对K15;R12的SEQ ID NO.23、针对K16;R12的SEQ ID NO.24、针对K22;R12的SEQ ID NO.25、针对K23;R12的SEQ ID NO.26、针对K24;R8的SEQ ID NO.27、针对K24;R11的SEQ ID NO.28、和/或针对C1;R12的SEQ ID NO.29。