[发明专利]重型血友病A致病基因突变检测试剂盒有效
申请号: | 201210494686.5 | 申请日: | 2012-11-28 |
公开(公告)号: | CN102943114A | 公开(公告)日: | 2013-02-27 |
发明(设计)人: | 刘晶晶;王小薇;朱玉华;任维 | 申请(专利权)人: | 亚能生物技术(深圳)有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 深圳市博锐专利事务所 44275 | 代理人: | 张明 |
地址: | 518000 广东省深圳*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 重型 血友病 致病 基因突变 检测 试剂盒 | ||
技术领域
本发明属于生物技术与生物医药领域,具体涉及检测重型血友病A致病基因内含子22和内含子1倒位突变的试剂盒。
背景技术
血友病A(hemophilia A,HA)又称甲型血友病,是最为常见的X连锁隐性遗传性出血性疾病,其主要病因是由于凝血因子VIII(FVIII)基因突变而引起的FVIII含量不足或功能缺陷。HA患者常自发性或外伤性出血不止,出血可发生在任何部位,但以关节出血最为多见。反复多次关节出血可导致患者致残,甚至危及生命。临床上根据患者血浆FVIII促凝活性及症状严重程度将HA分为重型、中型和轻型,其中50%为重型。
我国HA的发病率在男性人群中约为1/5000。血友病根据所缺乏凝血因子的不同分为血友病A和血友病B(hemophilia B,HB),HA约占全部血友病的80%-85%,HB则约占15%-20%且在临床上通常为中型和轻型。HA的人群患病率无种族和地区差异,可能与较高的基因自发突变率相关。由于是X连锁隐性遗传,女性HA患者及其罕见。
FVIII基因全长186kb,位于X染色体长臂远端(Xq28),含有26个外显子和25个内含子,编码2351个氨基酸。随着人们对HA分子基础的认识不断深入,该病基因诊断的技术也得到了很大发展。截止2012年已经报道基因突变1400多种,主要是点突变、插入、缺失和倒位,其中内含子22倒位(Inversion 22,Inv22)突变约占全部重型血友病A的45%。1996年,Brinke等在一对同卵双生的重型HA双胞胎患者中第一次发现了FVIII基因第1号内含子倒位(Inversion1,Inv1)突变,在大样本重型HA患者中进行了该倒位的筛查,发现第1号内含子倒位是重型HA中仅次于第22号内含子倒位的突变热点。约50%的重型HA患者是由于内含子22倒位和内含子1倒位突变造成,这是近年来HA发病机制中重要的进展。
目前血友病规范化诊断已建立了包括临床诊断、家系调查、实验检测等系列技术平台。实验检测分为基因诊断和非基因间接诊断。目前市场上所有的血友病诊断产品均采用非基因间接诊断,包括活化部分凝血活酶时间(APTT)、血浆凝血酶原时间(PT)、血浆FVIII:C以及FVIII抗原检测等。这些产品可以对HA进行确诊,但无法确定HA患者的基因突变类型更无法检出携带者。因此,开发可以方便、准确诊断HA的基因分型产品,有效应用于产前诊断,对避免重型血友病胎儿出生,减低HA发病率具有重要意义。
Single tube PCR assay for detection of chromosomal mutations:application tothe inversion hotspot in the factor VIII gene including optional use of subcyclingPCR,该专利由Qiang Liu和Steven S Sommer发明,于2002年公开,专利号为US6355422B1。提出利用长距离PCR(Long Distance PCR,LD-PCR)法检测血友病A内含子22倒位突变。优势:一管PCR法,直接分型检测血友病A患者、携带者和野生型;缺限:成本高昂、耗时长、仅能检测内含子22倒位,检测系统不稳定,试剂需现用现配,无法作为临床检测产品应用。
由上海佰真生物技术有限公司申请,2011年公开,专利公开号为CN102230002A的中国发明:“血友病致病基因检测试剂盒及应用”公开的技术方案主要针对FVIII和FIX因子外显子区设计PCR和测序引物。优势:同时检测血友病A与血友病B致病基因,覆盖全长序列;缺陷:测序反应耗时长、成本高昂,70%-80%血友病A的FVIII基因突变呈高度异质性,突变形式复杂,测序结果难以分析。
目前,血友病A基因检测方法主要有:
LD-PCR法:长距离PCR,一般指扩增片断超过5kb的PCR方法,但反应体系无法满足稳定性和低成本要求。
Southern blot技术检测HA内含子22倒位,将待测的基因组DNA经限制性核酸内切酶消化后,琼脂糖凝胶电泳分离DNA片段,凝胶经碱处理使DNA变性,再将其从凝胶中印迹到硝酸纤维素滤膜或尼龙膜上,以放射性或非放射性标记的DNA探针与固相支持体上的DNA杂交,根据探针的标记特性用相应方法显示杂交条带,对待测DNA进行分析。操作复杂、灵敏度低,已很少使用。
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