[发明专利]一种rs6311的检测试剂盒有效
申请号: | 201210523154.X | 申请日: | 2012-12-09 |
公开(公告)号: | CN103122376A | 公开(公告)日: | 2013-05-29 |
发明(设计)人: | 孔庆梅;张晓静;邵宏;赵振国;刘叔平;鄂文;田新霞 | 申请(专利权)人: | 鄂文 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 北京鑫浩联德专利代理事务所(普通合伙) 11380 | 代理人: | 高翔 |
地址: | 100191 北京市*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 rs6311 检测 试剂盒 | ||
1.一种rs6311的检测试剂盒,该试剂盒包括探针,引物,MIX反应液,
其中所述探针,序列如下:rs6311T-fam :CTGTGAGTGTCTGGC
rs6311C-vic: CTGTGAGTGTCCGGC
其中所述引物,序列如下:
rs6311-F :AGAGAGAACATAAATAAGGCTAGAAAACAGTA
rs6311-R :CACTGTTGGCTTTGGATGGA。
2.根据权利要求1所述的试剂盒,其中,试剂盒中装有:荧光反应管,去离子三蒸水,MIX反应液;
其中荧光反应管中装有以下探针和引物:
其中所述探针,序列如下:rs6311T-fam :CTGTGAGTGTCTGGC
rs6311C-vic: CTGTGAGTGTCCGGC
其中所述引物,序列如下:
rs6311-F :AGAGAGAACATAAATAAGGCTAGAAAACAGTA
rs6311-R :CACTGTTGGCTTTGGATGGA。
3.根据权利要求1所述的试剂盒,其中,探针配制成:25μM,引物配制成:20μM。
4.根据权利要求1所述的试剂盒,其中,各试剂的比例如下:
每条探针0.1微升,每条引物0.8微升,去离子三蒸水,用1.5毫升小瓶盛装,MIX用1.5毫升小瓶盛装。
5.根据权利要求1所述的试剂盒,其中还包括石蜡油。
6.权利要求1所述试剂盒的使用方法,包括以下步骤:
患者全血基因组DNA提取,提取方法如下:
在1.5毫升离心管中加入10微升蛋白酶K和100微升待检样品(EDTA抗凝全血),并混匀,2000rpm离心10秒,加入200微升缓冲液B,颠倒混匀,56℃放置10分钟,期间颠倒混匀2-3次,加入200微升无水乙醇,颠倒混匀,并加入吸附柱中,12000rpm离心30秒,倒掉非也,将吸附柱放回收集管,向吸附柱中加入500微升缓冲液C,12000rpm理性30秒,倒掉废液,将吸附柱放回收集管,向吸附柱中加入700微升漂洗液W2,12000rpm离心30秒,倒掉废液,将吸附柱放回收集管,向吸附柱中加入500微升漂洗液W2,12000rpm离心30秒,倒掉废液,将吸附柱放回收集管,然后12000rpm离心2分钟,将吸附柱置于一个新的1.5毫升离心管中,室温放置数分钟,以彻底晾干吸附材料中残余的漂洗液,向吸附膜中间部位悬空滴加100微升洗脱缓冲液TE,室温放置2-5分钟,12000rpm离心2分钟,收集管中即为基因组DNA,
PCR扩增:方法如下:
使用GeneCopoeia公司所提供的2*Probe AllinOne Q-PCR Mix按照合适的比例加入MIX,探针,引物以及上一步提取出来的基因组DNA,最后加入石蜡油,在荧光PCR仪上按照以下程序进行扩增:95℃10分钟---40次循环(95℃10秒-60℃30秒),
按照扩增曲线进行单链多态性分析待检样品的基因型,方法如下:
使用单链多态性分析仪器,如使用BIO-RAD iQ5仪,通过Taq-man荧光PCR检测候检位点待检样品的基因型,不同的基因型显示的结果是不相同的,如正常代谢组(CC型)显示的结果为:VIC标记探针扩增,
缓慢代谢组(CT型和TT型)显示的结果为:FAM标记探针和VIC标记探针同时扩增,或者FAM标记探针扩增。
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