[发明专利]轮状病毒的环介导等温扩增检测引物组和检测方法无效
申请号: | 201210553672.6 | 申请日: | 2012-12-18 |
公开(公告)号: | CN103014178A | 公开(公告)日: | 2013-04-03 |
发明(设计)人: | 寇晓霞;吴清平;薛亮;张菊梅 | 申请(专利权)人: | 广东省微生物研究所;广东环凯微生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 广州科粤专利商标代理有限公司 44001 | 代理人: | 刘明星 |
地址: | 510070 *** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 轮状病毒 环介导 等温 扩增 检测 引物 方法 | ||
1.一种应用环介导等温扩增检测轮状病毒(rotavirus)的检测引物组,其特征在于,由下列引物组成:
上游外引物F3:5’-ACCACTCCTTAATGCACAA-3’;
下游外引物B3:5’-GCCATCCTTTGATTAAAAATAGCT-3’;
上游内引物FIP:5’-CCTCTCGCGTTGAGTTCGTAT-GGAATAAATCTTCCGATTACTGG-3’;
下游内引物BIP:5’-ATGTTTGTATTACCCAACTGAAGCA-AGAAAGTGTATCCTTCCATGAA-3’。
2.一种非疾病的诊断和治疗目的的轮状病毒的检测方法,其特征在于,对样品进行病毒RNA提取,再反转录成cDNA,然后通过环介导等温扩增的方法用权利要求1所述的检测引物组对cDNA进行选择性扩增,确认是否存在有扩增产物。
3.根据权利要求2所述的检测方法,其特征在于,所述的样品为医院的腹泻样品、水或食品。
4.根据权利要求2所述的检测方法,其特征在于,所述的通过环介导等温扩增的方法用权利要求1所述的检测引物组对cDNA进行选择性扩增具体为:环介导等温扩增体系为体系总体积25μL,包括2.5μL 10×Thermopol反应缓冲液、0.4μL 10mmol/LdNTPs、0.5μL10μmol/L上游外引物F3、0.5μL 10μmol/L下游外引物B3、1μL 40μmol/L上游内引物FIP、1μL 40μmol/L下游内引物BIP、0.6μL100mmol/L MgSO4、12.5μL 2mol/L甜菜碱、4μL灭菌双蒸水ddH2O,1μL 8U/μL Bst DNA聚合酶和1μL cDNA,反应条件为在温度为65℃孵育60min。
5.根据权利要求2或3或4所述的检测方法,其特征在于,所述的确认是否存在有扩增产物是用荧光显色检测,具体是在终止反应的反应管中加入1μL 10% SYBR Green Ⅰ显色剂,10min后观察结果,如果颜色为黄色,则样品轮状病毒阴性,无轮状病毒,如果颜色为绿色,则样品轮状病毒阳性,含有轮状病毒。
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