[发明专利]一种同时检测引起番茄黄化曲叶病4种病毒的方法及试剂盒有效
申请号: | 201210554759.5 | 申请日: | 2012-12-19 |
公开(公告)号: | CN103014179A | 公开(公告)日: | 2013-04-03 |
发明(设计)人: | 何自福;杜振国;汤亚飞;佘小漫 | 申请(专利权)人: | 广东省农业科学院植物保护研究所 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68 |
代理公司: | 广州市华学知识产权代理有限公司 44245 | 代理人: | 裘晖;苏运贞 |
地址: | 510640 *** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 同时 检测 引起 番茄 黄化 曲叶病 病毒 方法 试剂盒 | ||
1.一种同时检测引起番茄黄化曲叶病4种病毒的方法,所述病毒分别为番茄黄化曲叶病毒、台湾番茄曲叶病毒、广东番茄黄化曲叶病毒和广东番茄曲叶病毒,其特征在于:包括如下步骤:
(1)设计检测上述病毒的引物
检测番茄黄化曲叶病毒的引物为TYF和TYR,PCR扩增产物大小为321bp;
TYF:5’-GACCTGGCCCACATTGTTTTGCCT-3’;
TYR:5’-TCAGCAATCTGCCAACGACGCA-3’;
检测台湾番茄曲叶病毒的引物为TWF和TWR,PCR扩增产物大小为209bp;
TWF:5’-TGTCGTTACGTCGTGGTTCCGT-3’;
TWR:5’-AATTCGCAGGCGGAGGGTTGAT-3’;
检测广东番茄黄化曲叶病毒的引物为TYGF和TYGR,PCR扩增产物大小为118bp;
TYGF:5’-TGCGAACTGGTCTCTTCTTCGC-3’;
TYGR:5’-ACGCAGCACTCAAAAACTGGGCA-3’;
检测广东番茄曲叶病毒的引物为TGF和TGR,PCR扩增产物大小为81bp;
TGF:5’-TTGGTGAGAGAGCACTGTGGGT-3’;
TGR:5’-TTCCAAAATGCCTCGTGCGGGA-3’;
(2)采用CTAB方法提取待检病样品的总DNA;
(3)PCR反应
以步骤(2)中提取的DNA为模板,步骤(1)中的4对引物为引物在同一体系中进行PCR反应;
(4)结果鉴别
将PCR产物进行琼脂糖凝胶电泳,在凝胶成像系统中观察,如有321bp大小的特异性条带,即确认病样品是由番茄黄化曲叶病毒侵染引起的;如有209bp大小的特异性条带,即确认病样品是由台湾番茄曲叶病毒侵染引起的;如有118bp大小的特异性条带,即确认病样品是由广东番茄黄化曲叶病毒侵染引起的;如有81bp大小的特异性条带,即确认病样品是由广东番茄曲叶病毒侵染引起的;如产生上述2条、3条或4条特异带,则表明病样品分别是由相应的2种、3种或4种病毒混合侵染引起的;如无上述任何特异条带,则该病样品不是4种病毒中任何1种侵染引起的。
2.根据权利要求1所述的同时检测引起番茄黄化曲叶病4种病毒的方法,其特征在于:
步骤(3)中所述的PCR反应体系为50μL反应体系包括2μL待检病样品的总DNA、0.25μL浓度为5U/μL的Taq DNA聚合酶、5μL 10×Taq DNA聚合酶缓冲液、1μL浓度10mM的dNTPs、浓度为3μM的上述引物各1.5μL、灭菌双蒸水29.75μL。
3.根据权利要求1所述的同时检测引起番茄黄化曲叶病4种病毒的方法,其特征在于:
步骤(3)中所述的PCR反应的条件为:94℃预变性8min;94℃变性30sec、60℃退火45sec、72℃延伸45sec,32个循环;72℃最终延伸10min。
4.根据权利要求1所述的同时检测引起番茄黄化曲叶病4种病毒的方法,其特征在于:
步骤(4)中所述的琼脂糖凝胶电泳为在质量体积百分比为1.5~2.0%的琼脂糖凝胶上电泳,100~125V恒压电泳35~50min。
5.实现权利要求1~4任一项所述的同时检测引起番茄黄化曲叶病4种病毒的方法的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒包括Taq DNA聚合酶、Taq DNA聚合酶缓冲液和引物;
所述引物分别为:
TYF:5’-GACCTGGCCCACATTGTTTTGCCT-3’;
TYR:5’-TCAGCAATCTGCCAACGACGCA-3’;
TWF:5’-TGTCGTTACGTCGTGGTTCCGT-3’;
TWR:5’-AATTCGCAGGCGGAGGGTTGAT-3’;
TYGF:5’-TGCGAACTGGTCTCTTCTTCGC-3’;
TYGR:5’-ACGCAGCACTCAAAAACTGGGCA-3’;
TGF:5’-TTGGTGAGAGAGCACTGTGGGT-3’;
TGR:5’-TTCCAAAATGCCTCGTGCGGGA-3’。
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