[发明专利]一种用于检测宫颈癌致癌基因的引物探针、试剂盒及用于非检测疾病目的的检测方法有效

专利信息
申请号: 201210560628.8 申请日: 2012-12-20
公开(公告)号: CN103114132A 公开(公告)日: 2013-05-22
发明(设计)人: 张鹭鹭;张爱国;刘桐宇 申请(专利权)人: 张鹭鹭;张爱国;刘桐宇
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 北京集佳知识产权代理有限公司 11227 代理人: 赵青朵;冯琼
地址: 美国加利福尼亚州*** 国省代码: 美国;US
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摘要:
搜索关键词: 一种 用于 检测 宫颈癌 致癌 基因 引物 探针 试剂盒 疾病 目的 方法
【说明书】:

技术领域

发明涉及生物技术领域,特别涉及一种用于检测宫颈癌致癌基因的引物探针、试剂盒及用于非检测疾病目的的检测方法。

背景技术

宫颈癌是全球妇女中仅次于乳腺癌和结直肠癌的第3个常见的恶性肿瘤,在发展中国家是仅次于乳腺癌居第2位常见的恶性肿瘤,是最常见的女性生殖道恶性肿瘤。2008年全球估计新发宫颈癌病例52.98万,死亡病例25.51万人,其中85%新发病例在发展中国家(Jemal,2011)。随着宫颈癌筛查的开展,发达国家宫颈癌的发病率及死亡率明显下降。

宫颈癌是目前唯一一个病因明确的妇科恶性肿瘤,与高危型人乳头瘤病毒(human papillomaviruses,HPV)的持续感染相关。HPV病毒是一种双链DNA病毒,具有球形外壳,直径55nm,主要感染皮肤粘膜上皮,导致不同病变。目前已经鉴定的HPV病毒超过200种,至少30种与生殖道粘膜感染相关。HPV妇女一生中80%可感染HPV,通常在8-10个月内被自然清除,只有少数(5%)妇女呈持续感染状态。根据HPV病毒与宫颈癌的关系分为高危型和低危型,高危型与宫颈癌相关,常见的亚型有:16、18、26、31、33、35、39、45、51、52、56、58、59、66、67、68、73、82,宫颈鳞状细胞癌中HPV16型最多见,其次是18、45、31和33型;宫颈腺癌中HPV18和45亚型较常见。低危型与生殖道疣相关,常见的亚型有:6、11、40、42、43、44、53、54、57、61、62、70、72、81、83、CP6108、MM4、MM7、MM9、MM9等。

在癌变初期,准确、快速、便捷地对其进行检测,是控制和治疗的关键。目前,多采取子宫颈刮片细胞学、宫颈管活体组织、阴道镜等检查方法对宫颈癌进行筛查。但是上述几种方法操作繁琐、准确率较低,对实验条件要求高,不适于宫颈癌的早期诊断。

核酸检测技术操作简便,反应快速,尤其是近年来发展的实时荧光定量PCR(real-timePCR)灵敏度高,且能够监控整个反应进程,但一直存在DNA污染造成的假阳性率高的问题,且由于其临界值不明显,因此检测结果灰区较宽,无法标准化,而且由于仪器要求高,投入大,对操作人员要求高,需要进行专业技能培训,还限制了多重检测的应用。同时该方法对于宫颈癌含量极低的样本仍然无法检测,准确率较低。

branch-DNA(bDNA)支链DNA技术利用探针捕获待测目标,经过杂交、信号放大、酶促化学发光,实现对待测核酸的定量检测,可以对mRNA做精确的定量检测及动态水平研究。它克服了传统的real-time PCR技术中的种种缺陷与不确定因素,无需抽提纯化RNA,无需反转录,无需PCR扩增,只要将样本用特定裂解液裂解后,经探针杂交与信号放大即可迅速得到更加精确的实验结果。除各种普通样本外,该技术对qPCR很难分析的血液样本与保存多年后mRNA高度降解的FFPE样本同样具有极高的准确度与重现性。

目前还未见利用bDNA技术对宫颈癌致癌基因的检测的相关报道,设计、特异性强的探针具有重要的现实意义。

发明内容

有鉴于此,本发明提供一种用于检测宫颈癌致癌基因的探针、试剂盒及用于非检测疾病目的的检测方法。该探针特异性好,降低了假阳性率。该方法经过杂交、信号放大、酶促化学发光,实现对待测核酸的定量检测,不经过呈指数增长的扩增过程,放大倍数确定,重复性,稳定性高。

为了实现上述发明目的,本发明提供以下技术方案:

本发明提供了一种用于检测宫颈癌致癌基因的探针,包括捕获延伸探针、标记延伸探针和预放大探针;

其中,标记延伸探针的序列如SEQ ID No.1、2、7、8、13、14、19、20、25、26、31、32、37、38、43、44、49、50、55、56、61、62、67、68、73、74中任一序列所示;

捕获延伸探针的序列如SEQ ID No.3、4、9、10、15、16、21、22、27、28、33、34、39、40、45、46、51、52、57、58、63、64、69、70、75、76中任一序列所示;

预放大探针的序列SEQ ID No.5、6、11、12、17、18、23、24、29、30、35、36、41、42、47、48、53、54、59、60、65、66、71、72、77、78中任一序列所示。

本发明的探针设计是针对E6/E7mRNA的靶向性设计,特异性捕获Hela细胞中的E6/E7mRNA片段。

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