[发明专利]一种用于研究醋糟基质中微生物群落结构的总DNA提取方法有效
申请号: | 201210571281.7 | 申请日: | 2012-12-26 |
公开(公告)号: | CN103045585A | 公开(公告)日: | 2013-04-17 |
发明(设计)人: | 李萍萍;林英;赵青松;杜道林;王纪章 | 申请(专利权)人: | 江苏大学 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10;C12Q1/68;C12Q1/04 |
代理公司: | 南京知识律师事务所 32207 | 代理人: | 汪旭东 |
地址: | 212013 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 研究 基质 微生物 群落 结构 dna 提取 方法 | ||
1.一种用于研究醋糟基质中微生物群落结构的总DNA提取方法,其特征在于按照下述步骤进行:
(1)先在醋糟基质中加入DNA提取缓冲液,并加入蛋白酶K,振摇,使醋糟基质中的微生物充分悬浮在DNA提取缓冲液中;
(2)将步骤(1)制得的悬浮液用十二烷基磺酸钠裂解醋糟基质中的微生物,离心后取上清;
(3) 加入与步骤(2)取得的上清液等体积的氯仿-异戊醇混合液抽提蛋白,其中氯仿:异戊醇体积比为24: 1,离心后取上清;
(4) 加入与步骤(3)取得的上清液等体积的聚乙烯吡咯烷酮水溶液,去除腐殖酸和酚类物质,离心后取上清;
(5) 将装有步骤(4)中取得的上清液的离心管上下轻微的摇动,直至离心管中可见絮状物质,将离心管置于-20 ℃沉淀 20 min;
(6) 用体积分数为75% 的乙醇沉淀DNA后,用去离子无菌水溶解DNA,并用RNA酶去除DNA中的RNA。
2. 根据权利要求1所述的提取方法, 其特征在于所述DNA提取缓冲液的配方为:10 mM Tris-Hcl (pH 8.0),100 mM Sodium EDTA(pH 8.0),100 mM Sodium phosphate (pH 8.0),1.5 M Nacl, 1% CTAB,0.5% β-巯基乙醇和0.5% PVP。
3.根据权利要求1所述的提取方法, 其特征在于所述蛋白酶K的浓度为20 mg/ ml,加入量为12.5 μl。
4.根据权利要求1所述的提取方,其特征在于所述十二烷基磺酸钠的质量分数为20%。
5.根据权利要求1所述的提取方法,其特征在于所述聚乙烯聚吡咯烷酮的质量分数为2%。
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