[发明专利]使用内部对照定量人类DNA的方法有效

专利信息
申请号: 201280009884.6 申请日: 2012-02-20
公开(公告)号: CN103534356A 公开(公告)日: 2014-01-22
发明(设计)人: 弗兰切斯卡·迪帕斯奎尔;霍尔格·恩盖尔;萨沙·斯特劳布;尼古拉·乔·瑟尔维尔 申请(专利权)人: 凯杰有限公司;凯杰曼彻斯特有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 中原信达知识产权代理有限责任公司 11219 代理人: 张颖;谢丽娜
地址: 德国*** 国省代码: 德国;DE
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摘要:
搜索关键词: 使用 内部 对照 定量 人类 dna 方法
【权利要求书】:

1.用于定量和/或检测样品中基因组的一种或多种核酸的方法,其中在扩增反应中,

a.对第一核酸进行扩增,被扩增的基因座是基因组中的多拷贝基因座(MCL),其中所述基因座在80个碱基对的区段内与SEQ ID NO.1的序列具有至少80%的序列同一性,并且其中所述多拷贝基因座在至少两个不同染色体上具有拷贝,

b.还对作为内部对照(IC)添加的第二核酸进行扩增,

c.测定来自于所述第一核酸的扩增的扩增产物的量。

2.权利要求1的方法,其中另外对第三核酸进行扩增,所述基因座是人类Y染色体上的多拷贝基因座(MCL-Y),其中所述基因座在80个碱基对的区段内与SEQ ID NO.15的序列具有至少80%的序列同一性,

a.对作为内部对照添加的所述第三核酸进行扩增,以及

b.测定来自于所述第一核酸和第三核酸的扩增的扩增产物的量。

3.权利要求1或2的方法,其中还测定所述第二核酸的扩增产物的量。

4.权利要求1至3的方法,其中扩增方法是聚合酶链反应或实时PCR反应,并且所测定的核酸的量,在扩增过程期间测定或在扩增反应结束时作为终点测量值测定。

5.前述权利要求任一项的方法,其中所述第一核酸(MCL)和/或第三核酸(MCL-Y)的扩增产物的长度在60个碱基对至200个碱基对之间。

6.前述权利要求任一项的方法,其中所述第二核酸(IC)的扩增产物在60至400个碱基对之间。

7.权利要求6的方法,其中所述第二核酸(IC)的扩增产物在100至400个碱基对之间。

8.前述权利要求任一项的方法,其中所述第二核酸(IC)的扩增产物长于所述第一核酸(MCL)的扩增产物。

9.权利要求1至7的方法,其中所述扩增反应包含:

a.pH在8至8.8之间的Tris-HCl,和/或,

b.选自氯化钾和硫酸钾的钾盐,和/或,

c.铵盐,优选为氯化铵或硫酸铵,和/或

d.氯化镁,和/或

e.热启动聚合酶。

10.前述权利要求任一项的方法,其中所述扩增反应包含所述第二核酸(IC)的100至5000个之间的拷贝。

11.用于扩增第一核酸(MCL)的引物,其选自

a.5′-CCGGGAAGCAGAAGGTGG-3′(SEQ ID NO.12/4N-S1C Pr)

b.5′-Fam-CGAGCTCAGTTGTGCCTGTAGAGCTCG-dabcyl-C18-ACCTCTTCCTCTTGGCTGGG-3′(SEQ ID NO.11/4N-S1C)。

12.用于扩增第三核酸(Y-MCL)的引物,其选自

a.5′-TGGCTGAGTTCCTCCACCTG-3′(SEQ ID NO.37/MCL-Y Pr)

b.5′-Quasar670-cgaccgtgaagcatgcgtttcggtcg-BHQ2-C18-agtgggagagctgggaa-3′(SEQ ID NO.38/MCL-Y Scorp)。

13.用于扩增第一核酸(MCL)的引物对,其由权利要求11的引物构成。

14.用于扩增第三核酸(Y-MCL)的引物对,其由权利要求12的引物构成。

15.用于扩增第二核酸(IC)的引物,其选自

a.5′-GCTATCCAGTGTGCCTAGGCAA-3(SEQ ID NO.13/AT-IC_Rev.)

b.5′-YAK-TGGCGTAGTCGTTCAACGCCA/Dabcyl/HEG/CCACGAGCGTACTTCGACTGAA-3(SEQ ID NO.14/AT-IC_Yak)。

16.用于扩增第二核酸(IC)的引物对,其由权利要求15的引物构成。

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