[发明专利]使用内部对照定量人类DNA的方法有效
申请号: | 201280009884.6 | 申请日: | 2012-02-20 |
公开(公告)号: | CN103534356A | 公开(公告)日: | 2014-01-22 |
发明(设计)人: | 弗兰切斯卡·迪帕斯奎尔;霍尔格·恩盖尔;萨沙·斯特劳布;尼古拉·乔·瑟尔维尔 | 申请(专利权)人: | 凯杰有限公司;凯杰曼彻斯特有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 中原信达知识产权代理有限责任公司 11219 | 代理人: | 张颖;谢丽娜 |
地址: | 德国*** | 国省代码: | 德国;DE |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 使用 内部 对照 定量 人类 dna 方法 | ||
1.用于定量和/或检测样品中基因组的一种或多种核酸的方法,其中在扩增反应中,
a.对第一核酸进行扩增,被扩增的基因座是基因组中的多拷贝基因座(MCL),其中所述基因座在80个碱基对的区段内与SEQ ID NO.1的序列具有至少80%的序列同一性,并且其中所述多拷贝基因座在至少两个不同染色体上具有拷贝,
b.还对作为内部对照(IC)添加的第二核酸进行扩增,
c.测定来自于所述第一核酸的扩增的扩增产物的量。
2.权利要求1的方法,其中另外对第三核酸进行扩增,所述基因座是人类Y染色体上的多拷贝基因座(MCL-Y),其中所述基因座在80个碱基对的区段内与SEQ ID NO.15的序列具有至少80%的序列同一性,
a.对作为内部对照添加的所述第三核酸进行扩增,以及
b.测定来自于所述第一核酸和第三核酸的扩增的扩增产物的量。
3.权利要求1或2的方法,其中还测定所述第二核酸的扩增产物的量。
4.权利要求1至3的方法,其中扩增方法是聚合酶链反应或实时PCR反应,并且所测定的核酸的量,在扩增过程期间测定或在扩增反应结束时作为终点测量值测定。
5.前述权利要求任一项的方法,其中所述第一核酸(MCL)和/或第三核酸(MCL-Y)的扩增产物的长度在60个碱基对至200个碱基对之间。
6.前述权利要求任一项的方法,其中所述第二核酸(IC)的扩增产物在60至400个碱基对之间。
7.权利要求6的方法,其中所述第二核酸(IC)的扩增产物在100至400个碱基对之间。
8.前述权利要求任一项的方法,其中所述第二核酸(IC)的扩增产物长于所述第一核酸(MCL)的扩增产物。
9.权利要求1至7的方法,其中所述扩增反应包含:
a.pH在8至8.8之间的Tris-HCl,和/或,
b.选自氯化钾和硫酸钾的钾盐,和/或,
c.铵盐,优选为氯化铵或硫酸铵,和/或
d.氯化镁,和/或
e.热启动聚合酶。
10.前述权利要求任一项的方法,其中所述扩增反应包含所述第二核酸(IC)的100至5000个之间的拷贝。
11.用于扩增第一核酸(MCL)的引物,其选自
a.5′-CCGGGAAGCAGAAGGTGG-3′(SEQ ID NO.12/4N-S1C Pr)
b.5′-Fam-CGAGCTCAGTTGTGCCTGTAGAGCTCG-dabcyl-C18-ACCTCTTCCTCTTGGCTGGG-3′(SEQ ID NO.11/4N-S1C)。
12.用于扩增第三核酸(Y-MCL)的引物,其选自
a.5′-TGGCTGAGTTCCTCCACCTG-3′(SEQ ID NO.37/MCL-Y Pr)
b.5′-Quasar670-cgaccgtgaagcatgcgtttcggtcg-BHQ2-C18-agtgggagagctgggaa-3′(SEQ ID NO.38/MCL-Y Scorp)。
13.用于扩增第一核酸(MCL)的引物对,其由权利要求11的引物构成。
14.用于扩增第三核酸(Y-MCL)的引物对,其由权利要求12的引物构成。
15.用于扩增第二核酸(IC)的引物,其选自
a.5′-GCTATCCAGTGTGCCTAGGCAA-3(SEQ ID NO.13/AT-IC_Rev.)
b.5′-YAK-TGGCGTAGTCGTTCAACGCCA/Dabcyl/HEG/CCACGAGCGTACTTCGACTGAA-3(SEQ ID NO.14/AT-IC_Yak)。
16.用于扩增第二核酸(IC)的引物对,其由权利要求15的引物构成。
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