[发明专利]用于β地中海贫血性状的新型相关标记

说明书

发明领域

本发明涉及SEQ ID NO:1-SEQ ID NO:14的分离的核酸分子，其在位置501处表现出单一多态性改变，其中野生型核苷酸分别被指示核苷酸代替。本发明还涉及所提到的核酸分子，其中一组1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13或14个包含所提到的指示核苷酸的多态的改变的序列构成β地中海贫血，特别是轻度β地中海贫血的标记。进一步设想包含SEQ ID NO:1；或者SEQ ID NO1和2；或者SEQ ID NO:1、2和3，或者SEQ ID NO:1、2、3和4；或者SEQ ID NO:1-5；或者SEQ ID NO:1-6；或者SEQ ID NO:1-7；或者SEQ ID NO:1-14；或者SEQ ID NO:8和14；或者SEQ ID NO:8和9；或者SEQ ID NO:2、4和13的具体组。本发明还涉及一种检测或诊断对象的β地中海贫血，优选轻度β地中海贫血的方法，所述方法包括以下步骤：(a)从对象的样品分离核酸，(b)确定在一个或多个所提到的多态位点存在的核苷酸序列和/或分子结构，其中指示核苷酸的存在指示β地中海贫血的存在。还设想了用于检测或诊断β地中海贫血的相应的组合物，所提到的核酸分子在检测或诊断β地中海贫血或者筛选存在β地中海贫血的群体中的用途，以及相应的试剂盒。本发明的方法、组合物、用途和试剂盒还涉及评价对象和/或对象的后代中发展β地中海贫血的风险。

背景技术

地中海贫血是遗传性的，即常染色体隐性遗传的血液病症。遗传缺陷(可以是突变或缺失)通常导致血红蛋白的珠蛋白链之一的的合成率减少，或者不合成这些链。结果，形成异常的血红蛋白分子，这导致贫血，即所有地中海贫血形式的特征性症状。在典型的情况下，因此地中海贫血涉及合成的珠蛋白数量减少的定量问题，通常通过调控基因或调控区中的突变或修饰，而另一主要贫血病症镰形细胞贫血是由mal-功能珠蛋白的合成的定性问题所引起的。根据受影响的血红蛋白基因的链，地中海贫血分为两种主要形式，α地中海贫血和β地中海贫血：在α地中海贫血中，α珠蛋白链的产生受到影响，而在β地中海贫血中，β珠蛋白链的产生受到影响。

在α地中海贫血的病因中，涉及基因HBA1(编码血红蛋白亚基α1；位于染色体16p13.3上)和HBA2(编码血红蛋白亚基α2；位于染色体16p13.3上)的至少4个等位基因，以及染色体16p的缺失。这导致α-珠蛋白产生的减少，并且伴随着成人中β-珠蛋白链的过量，其形成不稳定的β珠蛋白四聚体，也称为血红蛋白H，表现出异常的氧解离曲线。与之相反，以2个α和2个β亚基的异四聚体的形式提供正常的血红蛋白，也称为血红蛋白A。

在β地中海贫血的病因中，原则上涉及HBB基因(编码血红蛋白亚基β；位于染色体11p15.5上)或相关区域的突变。到目前为止，在HGMD和其他数据库中已记录超过470个与HBB基因相关的突变，其可以导致或有助于β地中海贫血。这些突变包括β珠蛋白基因座内的小的点突变或读框移位，以及所述区域中的一些较大的缺失。例如，突变可以影响主要β珠蛋白转录物的正确剪接，并且导致异常的剪接模式。不同类型的突变可以在β-珠蛋白基因之前的启动子区中出现。在所有情况下，β链的绝对或相对缺少导致α链过量，但是，α链不形成四聚体，而是结合至红细胞膜，产生膜损伤甚至可以形成有毒聚集。

疾病的严重程度显然取决于突变的性质。在重型β地中海贫血或库利氏贫血中，任何β链的形成均受到阻止。具体地，如果两个等位基因均具有地中海贫血突变，则疾病可能发生。这通常导致严重的小细胞、低色素性贫血。如果不治疗，其会引起贫血、脾肿大和严重的骨骼畸形。其通常在20岁之前发展到死亡。治疗通常由定期输血、脾切除术(如果存在脾肿大)和治疗输血引起的铁超负荷组成。遗传情况或导致它的突变通常描述为β⁺/β⁰、β⁰/β⁰或β⁺/β⁺，其中“β”描述没有减少β血红蛋白的功能的突变的等位基因，“β⁺”描述包含允许一些β链形成发生的突变的等位基因，而“β⁰”描述包含完全阻止β链的产生的突变的等位基因。

在中间型β地中海贫血中，发生一些β链的产生。受影响的对象通常可以进行正常生活，但是可能需要偶尔输血，例如在疾病或妊娠时，这取决于他们贫血的严重程度。遗传情况或导致它的突变通常描述为β⁺/β⁺或β⁺/β⁰。