[发明专利]用于鉴定培养物中微生物的光谱手段和方法

权利要求书

1.一种用于光谱检测和鉴定培养物中微生物的方法，其中所述方法包括：

获得怀疑含有所述微生物的至少一个经培养样品；

将所述经培养样品转移至样品池；

将所述样品与从光源获得的光相互作用；

在所述相互作用的步骤之后，测量至少一部分剩余的所述光；

由经测量的所述光构建至少一个数据集；

如果所述数据集为光谱：

则通过进行至少一个选自以下的步骤预处理所述数据集：(a)针对因所述经培养样品中水的存在产生的信号，对所述数据集进行校正，(b)移除基线，(c)降噪，以及(d)提取目的光谱区，从而产生经校正的数据集；

通过使用选自主成分分析(PCA)和线性预测编码的方法从所述经校正的数据集提取目的光谱特征，从而产生一组经提取的光谱特征；

通过使用整合了学习算法的方法将所述经提取的光谱特征分类，从而确定所述微生物是否存在于所述经培养样品中；且

通过使用特征选择方法发现最优的一组特征；

如果所述数据集为干涉图样：

则从所述干涉图样估计所述微生物的细胞壁厚度；且

将所述细胞壁厚度分类，从而确定所述微生物是否存在于所述经培养样品中；

如果所述数据集为散射图样：

则从所述散射图样估计所述微生物的细胞壁粗糙度；且

将所述细胞壁粗糙度分类，从而确定所述微生物是否存在于所述经培养样品中，

其中所述获得怀疑含有所述微生物的至少一个经培养样品的步骤包括获得多个经培养样品；所述将所述经培养样品转移至样品池的步骤包括将所述多个经培养样品的每个转移至样品池，所述样品池被布置在多室分析仪之分开的室中；且所述构建至少一个数据集的步骤包括对所述多个样品的每个分别构建数据集，

其中所述多室分析仪的每个室包含：

入射孔；

与所述入射孔对齐的出射孔；

池；以及

可在第一位置和第二位置之间活动之可活动的回转镜，在所述第一位置中通过所述入射孔进入所述室的光从所述镜反射入所述池，在所述第二位置中通过所述入射孔进入所述室的光传到所述出射孔而不进入所述池。

2.根据权利要求1所述的方法，其中所述获得怀疑含有所述微生物的至少一个经培养样品的步骤包括：

获得生物样品；

培养所述生物样品，从而产生经培养样品；以及

将菌落涂抹在表面上。

3.根据权利要求2所述的方法，其中所述生物样品为选自于固体形式和液体形式的形式。

4.根据权利要求2所述的方法，其中所述生物样品选自喷嚏、唾液、胆汁、尿、阴道分泌物、中耳抽出物、脓、胸腔积液、滑液、腔拭子、血清、血液和脊液。

5.根据权利要求2所述的方法，其中所述生物样品选自粘液和脓肿。

6.根据权利要求2所述的方法，其中培养所述生物样品的步骤包括将包含在样品中的所述生物样品在血琼脂板中培养12至24小时。

7.根据权利要求2所述的方法，其中所述涂抹的步骤包括在表面上涂抹以覆盖2.5cm直径的区域。

8.根据权利要求2所述的方法，其中所述涂抹的步骤包括在镜子的反射表面上涂抹。

9.根据权利要求8所述的方法，其中所述反射表面为金。

10.根据权利要求2所述的方法，其中所述培养的步骤之后进行选择多个菌落的步骤。

11.根据权利要求1所述的方法，其中所述将所述经培养样品转移至样品池的步骤包括将所述经培养样品转移至多次传递池。

12.根据权利要求1所述的方法，其中所述池为多次传递池。