[发明专利]一种应用于第二代测序的简捷廉价的基因组样品破碎方法有效
申请号: | 201310024007.2 | 申请日: | 2013-01-23 |
公开(公告)号: | CN103290104A | 公开(公告)日: | 2013-09-11 |
发明(设计)人: | 蒋智;刘少卿;彭献军;王大伟;刘运超;吴静;王秋梅 | 申请(专利权)人: | 蒋智 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C40B40/06;C40B50/00 |
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地址: | 100083 北京市海*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 应用于 第二代 简捷 廉价 基因组 样品 破碎 方法 | ||
1.一种核酸样品破碎并建库应用于高通量测序的方法,其特征在于,运用超声清洗器进行样品破碎,并构建DNA文库。
2.根据权利要求1所述的一种核酸样品破碎并建库应用于高通量测序的方法,其特征在于,所述的DNA,其来源是植物、动物或者微生物或者非生物来源的DNA样品。
3.根据权利要求1所述的一种核酸样品破碎并建库应用于高通量测序的方法,其特征在于,所述的样品包括DNA样品,但是不仅限于DNA样品,也可以是RNA样品或其他任何核酸样品。
4.根据权利要求1所述的一种核酸样品破碎并建库应用于高通量测序的方法,其特征在于,所述的核酸的样品破碎主要包括以下步骤:
1)打开该超声破碎仪的盖子;
2)添加冰水混合物至水深为4.5cm;
3)在1.5ml离心管中加入需要破碎的样品;
4)加入的样品的体积范围为20~200ul;
5)加入样品的质量范围为10~10000ng;
6)将含有待破碎样本的离心管使用一个浮漂将其置于超声波清洗器的中央位置;
7)打开仪器开关,根据所需要样品破碎的大小,将时间设定为90s,或120s或360s;
8)将温度设定调至0;
9)盖上盖子运行超声清洗器;
10)运行结束,取出离心管,直接进行下一步建库的操作,不需要进行样品的纯化。
5.根据权利要求1所述的一种核酸样品破碎并建库应用于高通量测序的方法,其特征在于,所述的核酸样品破碎并建库应用于高通量测序的方法包括以下步骤:
1)将所待测样品基因组DNA超声波清洗器进行破碎;
2)对步骤1)得到的破碎产物进行末端补平,加dATP,并进行接头的连接;
3)对步骤2)得到的连接产物进行纯化并定量后进行PCR扩增,并将扩增产物纯化后,在Illumina公司的Hiseq2000测序平台进行测序;
4)对获得的数据进行信息分析。
6.根据权利要求1所述的一种核酸样品破碎并建库应用于高通量测序的方法,其特征在于,测序平台为illumina Hiseq2000测序平台。
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