[发明专利]生防绿木霉的SCAR标记及其应用和定量检测方法无效
申请号: | 201310065637.4 | 申请日: | 2013-03-01 |
公开(公告)号: | CN103290000A | 公开(公告)日: | 2013-09-11 |
发明(设计)人: | 刘连盟;黄世文;王玲 | 申请(专利权)人: | 中国水稻研究所 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/68;C12Q1/06;C12R1/885 |
代理公司: | 杭州浙科专利事务所(普通合伙) 33213 | 代理人: | 吴秉中 |
地址: | 310006 浙江省*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 生防绿木霉 scar 标记 及其 应用 定量 检测 方法 | ||
1.一种生防绿木霉SS161的SCAR标记,其特征在于该标记的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。
2.如权利要求1所述的一种生防绿木霉SS161的SCAR标记在鉴定及跟踪检测生防绿木霉SS161中的应用。
3.一种用于扩增如权利要求1所述的一种生防绿木霉SS161的SCAR标记的引物对,其特征在于该引物对的上游引物TV163F序列如SEQ ID NO:2所示,下游引物TV163R序列如SEQ ID NO:3所示。
4.一种利用生防绿木霉SS161的SCAR标记进行绿木霉SS161定量检测方法,其特征在于包括以下步骤:
1)荧光定量PCR引物和TaqMan探针
根据生防绿木霉SS161的SCAR标记序列,设计荧光定量PCR引物和TaqMan探针,所述的生防绿木霉SS161的SCAR标记序列如SEQ ID NO:1所示,所述的荧光定量PCR引物上游引物Qtv163F序列如SEQ ID NO:4所示,所述的荧光定量PCR引物下游引物Qtv163R序列如SEQ ID NO:5所示,所述的TaqMan探针序列如SEQ ID NO:6所示;
2)PCR反应体系和程序
PCR反应总体系为25μL,其中RealMasterMix Probe系统10μL,荧光定量PCR上下游引物终浓度为200~600nM, TaqMan探针浓度为100~300nM,Probe Enhancer solution 1.25μL, 待测DNA模板0.5~5μL,超纯水补足25μL;
PCR反应程序:95℃ 5min;然后,95℃15S, 60℃30S 共40个循环;
3)结果分析
根据实时定量PCR结果计算采集样品中木霉SCAR标记的拷贝数,木霉SCAR标记的拷贝数反映木霉菌的数量,其拷贝数的变化反映样品中木霉菌数量的变化,根据木霉SCAR标记的拷贝数计算出样品中木霉菌的相对含量,通过监测样品中SCAR标记拷贝数的变化,监测样品中木霉菌的动态变化。
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