[发明专利]慢性牙周炎相关单核苷酸多态性检测用探针和引物、及其试剂盒有效
申请号: | 201310079019.5 | 申请日: | 2013-03-12 |
公开(公告)号: | CN103131788A | 公开(公告)日: | 2013-06-05 |
发明(设计)人: | 陈栋;汪黎明;张洁;冯坤 | 申请(专利权)人: | 上海市口腔病防治院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 上海光华专利事务所 31219 | 代理人: | 许亦琳;余明伟 |
地址: | 200001 *** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 慢性 牙周炎 相关 核苷酸 多态性 检测 探针 引物 及其 试剂盒 | ||
1.慢性牙周炎相关单核苷酸多态性检测用探针与引物,包括单核苷酸多态性位点rs2891168的特异性扩增引物对、单核苷酸多态性位点rs1800796的特异性扩增引物对、单核苷酸多态性位点rs2891168的检测探针,以及单核苷酸多态性位点rs1800796的检测探针。
2.如权利要求1所述慢性牙周炎相关单核苷酸多态性检测用探针与引物,其特征在于,
所述rs2891168的特异性扩增引物对包括核苷酸序列为SEQ ID NO:1的上游引物和核苷酸序列为SEQ ID NO:2的下游引物;
所述rs1800796的特异性扩增引物对包括核苷酸序列为SEQ ID NO:3的上游引物和核苷酸序列为SEQ ID NO:4的下游引物;
所述rs2891168的检测探针包括核苷酸序列为SEQ ID NO:5的5’端野生型探针、核苷酸序列为SEQ ID NO:6的5’端突变型探针以及核苷酸序列为SEQ ID NO:7的3’端common探针;
所述rs1800796的检测探针包括核苷酸序列为SEQ ID NO:8的5’端野生型探针、核苷酸序列为SEQ ID NO:9的5’端突变型探针以及核苷酸序列为SEQ ID NO:10的3’端common探针。
3.如权利要求2所述慢性牙周炎相关单核苷酸多态性检测用探针与引物,其特征在于,所述rs2891168的3’端common探针及rs1800796的3’端common探针的5’端携带荧光基团。
4.如权利要求3所述慢性牙周炎相关单核苷酸多态性检测用探针与引物,其特征在于,所述荧光基团为Cy3。
5.如权利要求2所述慢性牙周炎相关单核苷酸多态性检测用探针与引物,其特征在于,所述慢性牙周炎相关单核苷酸多态性检测用探针与引物还包括rs2891168野生型Zip探针、rs2891168突变型Zip探针、rs1800796野生型Zip探针及rs1800796突变型Zip探针,且各Zip探针的序列互不相同。
6.如权利要求5所述慢性牙周炎相关单核苷酸多态性检测用探针与引物,其特征在于,所述rs2891168野生型Zip探针、rs2891168突变型Zip探针、rs1800796野生型Zip探针及rs1800796突变型Zip探针的核苷酸序列选自SEQ ID NO:11-SEQ ID NO:14。
7.如权利要求6所述慢性牙周炎相关单核苷酸多态性检测用探针与引物,其特征在于,所述rs2891168野生型Zip探针的核苷酸序列为SEQ ID NO:11,rs2891168突变型Zip探针的核苷酸序列为SEQ ID NO:12、rs1800796野生型Zip探针的核苷酸序列为SEQ ID NO:13,rs1800796突变型Zip探针的核苷酸序列为SEQ ID NO:14。
8.如权利要求5-7任一所述慢性牙周炎相关单核苷酸多态性检测用探针与引物,其特征在于,所述rs28911685’端野生型探针、rs28911685’端突变型探针、rs18007965’端野生型探针及rs18007965’端突变型探针的末端均连接有cZip寡核苷酸片段,所述rs28911685’端野生型探针、rs28911685’端突变型探针、rs18007965’端野生型探针及rs18007965’端突变型探针的末端连接的cZip寡核苷酸片段的序列分别与所述rs2891168野生型Zip探针、rs2891168突变型Zip探针、rs1800796野生型Zip探针及rs1800796突变型Zip探针的序列相互补。
9.如权利要求8所述慢性牙周炎相关单核苷酸多态性检测用探针与引物,其特征在于,所述cZip寡核苷酸片段连接于5’端野生型探针及5’端突变型探针的5’端。
10.如权利要求1-9任一权利要求所述的探针与引物的用途,为用于制备慢性牙周炎相关单核苷酸多态性检测用试剂盒。
11.如权利要求10所述的用途,其特征在于,所述慢性牙周炎相关单核苷酸多态性检测用试剂盒为中国汉族人群慢性牙周炎相关单核苷酸多态性检测用试剂盒。
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