[发明专利]一种利用单双链复合体解析真菌菌群结构的方法有效
| 申请号： | 201310110305.3 | 申请日： | 2013-04-01 |
| 公开（公告）号： | CN103276056A | 公开（公告）日： | 2013-09-04 |
| 发明（设计）人： | 倪莉;黄志清;吕晓丹 | 申请（专利权）人： | 福州大学 |
| 主分类号： | C12Q1/68 | 分类号： | C12Q1/68;C12Q1/04 |
| 代理公司： | 福州元创专利商标代理有限公司 35100 | 代理人： | 蔡学俊 |
| 地址： | 350108 福建省福州市*** | 国省代码： | 福建;35 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 一种 利用 单双链 复合体 解析 真菌 结构 方法 | ||
【权利要求书】：
1.一种利用单双链复合体解析真菌菌群结构的方法，其特征在于：所述方法的步骤如下：提取样品中微生物总基因组DNA；基于18S rDNA片段构建单双链复合体并进行DGGE或TGGE分析；割胶回收单双链复合体并将其扩增为完整双链；对扩增到的完整双链进行测序并将测定的序列提交到NCBI上利用Blast在GeneBank数据库中进行相似性搜索；最后根据相似性得分判断对应真菌的种属。
2.根据权利要求1所述的利用单双链复合体解析真菌菌群结构的方法，其特征在于：所述单双链复合体的制备步骤为：首先用磷酸化的引物扩增出大于1000bp的18S rDNA长双链片段；其次用Lambda核酸外切酶处理长双链片段，得到未被磷酸化的单链；最后以该单链为模板，采用单个引物进行一步延伸得到单双链复合体。
3.根据权利要求1所述的利用单双链复合体解析真菌菌群结构的方法，其特征在于：用于DGGE 或TGGE分析时，单双链复合体的双链区不超过500bp。
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