[发明专利]CYP4V2基因突变体及其应用无效
申请号: | 201310130824.6 | 申请日: | 2013-04-16 |
公开(公告)号: | CN103374575A | 公开(公告)日: | 2013-10-30 |
发明(设计)人: | 孟晓红;阴正勤;徐海伟;黎其友;李世迎;刘勇 | 申请(专利权)人: | 中国人民解放军第三军医大学第一附属医院 |
主分类号: | C12N15/12 | 分类号: | C12N15/12;C12Q1/68;C12Q1/02;C12M1/34;C07K14/47;G01N33/68 |
代理公司: | 北京海虹嘉诚知识产权代理有限公司 11129 | 代理人: | 谢殿武 |
地址: | 400038 重*** | 国省代码: | 重庆;85 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | cyp4v2 基因 突变体 及其 应用 | ||
1.一种分离的原发性结晶样视网膜变性疾病的CYP4V2新突变致病基因,其特征在于,所述突变致病基因的核酸样本与编码野生型CYP4V2蛋白的基因,如SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列相比,第219位碱基发生T>A的突变,所述突变致病基因的核酸样本指人工分离或合成的单链DNA、双链DNA、RNA、cDNA或DNA与RNA的聚合物。
2.一种分离的原发性结晶样视网膜变性疾病的CYP4V2新突变体多肽,其特征在于,其氨基酸序列与SEQ ID NO:2相比,具有p.F73L突变。
3.筛选易感原发性结晶样视网膜变性疾病的生物样品的方法,
包括以下步骤:
从所述生物样品提取核酸样本;
确定所述核酸样本的核酸序列;
所述核酸样本的核酸序列与SEQ ID NO:1相比,具有p.F73L突变是所述生物样品易感原发性结晶样视网膜变性疾病的指示。
4.根据权利要求3所述的方法,所述生物样品指人体血液、皮肤和/或皮下组织。
5.根据权利要求3或4所述的方法,所述核酸样本选自以下一种或多种:全基因组DNA、总RNA、mRNA、由RNA反转录所得的cDNA、由mRNA反转录所得的cDNA。
6.根据权利要求3所述的方法,确定所述核酸样本的核酸序列采用测序技术,包括构建核算测序文库,以及对所得到的核酸测序文库进行测序。
7.根据权利要求6所述的方法,所述构建核算测序文库包括采用CYP4V2外显子的特异性引物,对核酸样本进行PCR扩增;然后针对所得到的扩增产物,构建核酸测序文库。
8.根据权利要求7所述的方法,所述CYP4V2外显子的特异性引物序列如下:正向引物ACCTGGCTTCCTCTAACAGTAACA,反向引物TTTTTGTGCTGAAATGGCTGAA。
9.用于权利要求3~8任一所述筛选易感原发性结晶样视网膜变性疾病的生物样品的方法的系统,该系统包括:
核酸提取装置,所述核酸提取装置用于从所述生物样品提取核酸样本;
核酸序列确定装置,所述核酸序列确定装置与所述核酸提取装置相连,用于对所述核酸样本进行分析,以便确定所述核酸样本的核酸序列;
判断装置,所述判断装置与所述核酸序列确定装置相连,以便基于所述核酸样本的核酸序列与SEQ ID NO:1相比,是否具有p.F73L突变,判断所述生物样品是否易感原发性结晶样视网膜变性疾病。
10.根据权利要求9所述的系统,所述核酸序列确定装置还包括文库构建单元和测序单元。
11.根据权利要求10所述的系统,所述文库构建单元还包括PCR扩增模块。
12.根据权利要求11所述的系统,所述PCR扩增模块中设置有CYP4V2外显子特异性引物。
13.根据权利要求11所述的系统,所述CYP4V2外显子特异性引物的正向引物ACCTGGCTTCCTCTAACAGTAACA,反向引物TTTTTGTGCTGAAATGGCTGAA。
14.筛选易感原发性结晶样视网膜变性疾病的生物样品的试剂盒,包括:适于检测CYP4V2基因突变体的试剂,所述CYP4V2基因突变体是指其与SEQ ID NO:1相比,具有p.F73L突变。
15.根据权利要求14所述的试剂盒,所述检测CYP4V2基因突变体的试剂指检测CYP4V2突变编码基因的试剂。
16.根据权利要求15所述的试剂盒,所述检测CYP4V2突变编码基因的试剂是核酸探针。
17.根据权利要求15所述的试剂盒,所述检测CYP4V2基因突变体的试剂指检测CYP4V2突变体多肽的试剂。
18.根据权利要求15所述的试剂盒,所述检测CYP4V2基因突变体的试剂是特异性识别所述突变体位点的抗体。
19.筛选治疗或预防原发性结晶样视网膜变性疾病的药物的方法,包括:
将能够表达CYP4V2基因突变体的生物样品在存在候选试剂的情况下进行培养,其中所述CYP4V2基因突变体的核苷酸序列与SEQ ID NO:1相比,具有p.F73L突变;
同时将所述能够表达CYP4V2基因突变体的生物样品在不存在所述候选试剂的情况下进行培养;
确定所述能够表达CYP4V2基因突变体的生物样品在存在所述候选试剂和不存在所述候选试剂的情况下,细胞凋亡率的变化,其中存在所述候选试剂时,所述细胞凋亡率低于不存在所述候选试剂时的细胞凋亡率,是所述候选试剂作为治疗或预防原发性结晶样视网膜变性疾病的药物的指示。
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