[发明专利]一种提取银合欢叶片组织中总RNA的方法无效
申请号: | 201310134467.0 | 申请日: | 2013-04-18 |
公开(公告)号: | CN103232997A | 公开(公告)日: | 2013-08-07 |
发明(设计)人: | 邹冬梅;蒋昌顺;申建斌;吴成贡 | 申请(专利权)人: | 中国热带农业科学院分析测试中心 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 571101 *** | 国省代码: | 海南;66 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 提取 合欢 叶片 组织 rna 方法 | ||
技术领域
本发明属于生物基因技术领域,尤其涉及一种提取银合欢叶片组织中总RNA的方法。
背景技术
银合欢原产美洲,是一种重要的热带、亚热带木本豆科牧草和速生林树种,可以用于饲料、绿肥、燃料、林木及植物修复、水土保持、培养食用菌、保健和药用等,被联合国粮农组织的饲料专家誉为干旱地区的“ 蛋白质仓库”和“奇迹树” 。我国于1957年开始进行银合欢引种栽培研究,并选育“热研1号银合欢” 。目前,银合欢异木虱已成为影响银合欢种植和利用的最主要害虫。银合欢抗异木虱育种已成为急待解决的问题,然而,作为热带豆科木本牧草的银合欢育种时间长,特别是仅凭表现型选择亲本具有不确定性。应用分子标记辅助育种,可以合理筛选亲本、加速育种进程。
从生物组织中提取高质量的总RNA对于分析基因的表达和调控、基因克隆及其功能鉴定、分子标记辅助育种等具有重要意义。不同生物组织,特别是高等植物,常常由于富含多酚氧化物、多糖、蛋白质等,使得其总RNA提取十分困难。银合欢植物叶片中粗蛋白质含量为22%~29%、含羞草素2%~5%,其总RNA提取更加困难。本发明人查阅了大量的文献,均未发现银合欢叶片总RNA的提取报道。
发明内容
本发明提供了一种提取银合欢叶片组织中总RNA的方法,旨在解决目前无法从银合欢叶片提取总RNA的问题。
本发明的目的在于提供一种提取银合欢叶片组织中总RNA的方法,该方法包括以下步骤:
步骤一,将十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)提取液充分摇匀,取15mL提取液于50mL离心管中,并在65℃水浴中预热;
步骤二,取2.0~3.0g银合欢叶片在液氮中磨成细粉末,转入盛有预热的十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)提取液的离心管中,并向离心管中加入0.8mL的β-巯基乙醇、0.9~1.0g的交联聚乙烯基吡咯烷酮(PVPP)粉末,旋涡混匀10min;
步骤三,在65℃下对离心管水浴20min,每5min上下振荡离心管1次;
步骤四,加入15mL配比为24∶1的氯仿与异戊醇混合液,旋涡混匀10min,冰浴5min;
步骤五,加冰冷的5mol/L、pH为4.8的醋酸钾(KAc)7mL,轻轻摇动离心管,使上面的液体混匀,冰浴30min;
步骤六,在4℃、18000r/min条件下离心15min,将上清液转入另一支50mL的离 心管中;
步骤七,向盛有上清液的离心管中加入等体积的配比为25∶24∶1的酚、氯仿、异戊醇混合液,旋涡混匀10min;
步骤八,在4℃、12000r/min条件下,离心10min,将上清液转入另一支50mL的离 心管中;
步骤九,加入等体积的配比为24∶1的氯仿与异戊醇混合液,旋涡混匀5min;
步骤十,在4℃、12000r/min条件下离心10min,将上清液转入另一支50mL的离心管中,加入0.3mL的β-巯基乙醇,再加入相当于上清液体积1/3的8mol/L的LiCl溶液,在-30℃下放置8h;
步骤十一,将离心管置于冰上解冻,在4℃、18000r/min条件下离心10min,弃上清液;
步骤十二,将沉淀用1mL75%的乙醇冲洗,转入1.5mL离心管中,在4℃、15000r/m条件下离心15min,弃上清液;
步骤十三,用0.8mL75%的乙醇洗涤沉淀,在4℃、13000r/min条件下离心5min,弃上清液;
步骤十四,将试管置于超净工作台上,并倒放在灭菌滤纸上,凉干5~10min;
步骤十五,加入50μL经1g/L焦碳酸二乙酯(DEPC)处理过的去离子双蒸水,将沉淀溶解后置-80℃保存备用。
进一步,该方法所用到的塑料离心管、移液抢头均用1g/L的焦碳酸二乙酯(DEPC)水溶液浸泡过夜,然后高温高压灭菌,烘干备用;研钵及金属药匙用锡箔纸包好,并在180℃烘箱中烘烤8h。
进一步,采用紫外分光光度计分别测定样品在260nm、280n h处的OD值,通过计算OD260/OD280的比值可对RNA质量进行检测。
进一步,纯净的RNA样品OD260/OD280的比值应在1.7-2.0之间,否则表明样品中有蛋白质或酚试剂的污染;OD260/OD230的比值大于2.0则表明样品中有小分子、盐和DNA的污染;
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