[发明专利]基于DNA自组装的非酶SNP检测方法有效
申请号: | 201310145787.6 | 申请日: | 2013-04-24 |
公开(公告)号: | CN103290111A | 公开(公告)日: | 2013-09-11 |
发明(设计)人: | 曾令文;吴薇;陈俊华 | 申请(专利权)人: | 中国科学院广州生物医药与健康研究院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 广州嘉权专利商标事务所有限公司 44205 | 代理人: | 方振昌 |
地址: | 510530 广东*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 dna 组装 snp 检测 方法 | ||
1.基于DNA自组装的非酶检测SNP 的方法,包括如下步骤:
1)设计分离捕获探针CP、单链MP、探针AP1和AP2,其中:
CP和MP可分别和目标序列的5’端和3’端互补为双链,在形成的双链中,CP和MP之间存在单链缺刻,该单链缺刻左侧或右侧的核苷酸与目标序列的SNP位点互补;
CP的一个末端连接有分离标记;
自组装AP1的5’端和3’端可分别和AP2的3’端和5’端互补,自组装形成双链DNA,AP1和AP2的5’端和3’端中至少部分序列可与MP的一端互补为双链;
2)将CP、MP、核酸连接酶和样本加入反应液中,混匀,反应完全;
3)将反应液中生成的双链DNA解链为单链DNA;
4)将连接有分离标记的单链DNA分离,清洗去除其他游离DNA链;
5)将清洗后的带分离标记的单链DNA、AP1、AP2加入反应液,反应完全以形成自组装双链;
6)将连接有分离标记的DNA链分离,清洗去除其他游离DNA链;
7)通过检测清洗后的DNA链中双链DNA的量,确定SNP的量。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:CP和MP的长度独立为15~30bp。
3.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于:AP1和和AP2的长度独立为20~50 bp。
4.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于:分离标记为亲合基团、固相载体。
5.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于:核酸连接酶选自 T4 DNA连接酶、E.coli DNA连接酶、Tsc DNA连接酶。
6.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于:将清洗后的DNA链与特异性嵌入双链DNA中的荧光染料反应,之后检测其荧光值确定双链DNA的量。
7.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于:通过加热之后急冷将双链DNA解链为单链DNA。
8.实现权利要求1~7任意一项权利要求所述方法的检测试剂盒。
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