[发明专利]基于DNA自组装的非酶SNP检测方法有效

专利信息
申请号: 201310145787.6 申请日: 2013-04-24
公开(公告)号: CN103290111A 公开(公告)日: 2013-09-11
发明(设计)人: 曾令文;吴薇;陈俊华 申请(专利权)人: 中国科学院广州生物医药与健康研究院
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 广州嘉权专利商标事务所有限公司 44205 代理人: 方振昌
地址: 510530 广东*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 基于 dna 组装 snp 检测 方法
【权利要求书】:

1.基于DNA自组装的非酶检测SNP 的方法,包括如下步骤:

1)设计分离捕获探针CP、单链MP、探针AP1和AP2,其中:

CP和MP可分别和目标序列的5’端和3’端互补为双链,在形成的双链中,CP和MP之间存在单链缺刻,该单链缺刻左侧或右侧的核苷酸与目标序列的SNP位点互补;

CP的一个末端连接有分离标记;

自组装AP1的5’端和3’端可分别和AP2的3’端和5’端互补,自组装形成双链DNA,AP1和AP2的5’端和3’端中至少部分序列可与MP的一端互补为双链;

2)将CP、MP、核酸连接酶和样本加入反应液中,混匀,反应完全;

3)将反应液中生成的双链DNA解链为单链DNA;

4)将连接有分离标记的单链DNA分离,清洗去除其他游离DNA链;

5)将清洗后的带分离标记的单链DNA、AP1、AP2加入反应液,反应完全以形成自组装双链;

6)将连接有分离标记的DNA链分离,清洗去除其他游离DNA链;

7)通过检测清洗后的DNA链中双链DNA的量,确定SNP的量。

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:CP和MP的长度独立为15~30bp。

3.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于:AP1和和AP2的长度独立为20~50 bp。

4.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于:分离标记为亲合基团、固相载体。

5.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于:核酸连接酶选自 T4 DNA连接酶、E.coli DNA连接酶、Tsc DNA连接酶。

6.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于:将清洗后的DNA链与特异性嵌入双链DNA中的荧光染料反应,之后检测其荧光值确定双链DNA的量。

7.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于:通过加热之后急冷将双链DNA解链为单链DNA。

8.实现权利要求1~7任意一项权利要求所述方法的检测试剂盒。

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