[发明专利]检测沙粒病毒科病毒的简并引物及RT-PCR检测方法有效

专利信息
申请号: 201310146457.9 申请日: 2013-04-25
公开(公告)号: CN103224999A 公开(公告)日: 2013-07-31
发明(设计)人: 胡群;马思杰;邹春颖;童淑梅 申请(专利权)人: 中华人民共和国大榭出入境检验检疫局
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 宁波奥圣专利代理事务所(普通合伙) 33226 代理人: 程晓明
地址: 315812 浙江省*** 国省代码: 浙江;33
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摘要:
搜索关键词: 检测 沙粒 病毒科 病毒 引物 rt pcr 方法
【权利要求书】:

1.检测沙粒病毒科病毒的简并引物,其特征在于该简并引物的核苷酸序列如下:上游引物:CATGTATGAT TGATGGAGGA AATatgytng arwc,下游引物:GATCATTTGG TGGTCCTTCA atrtcnancc a,其中引物中r可以是g或a,y可以是c或t/u,w可以是a或t, n可以是g或a或c或t/u或其它。

2.利用权利要求1所述的简并引物检测沙粒病毒科病毒的RT-PCR检测方法,其特征在于步骤如下:

 a、RNA提取:用RNA提取试剂盒提取病毒的RNA,得到RNA,具体提取方法依说明书进行; 

b、RNA逆转录:用RNA逆转录试剂盒对上述RNA进行RNA逆转录,得到PCR模板,具体逆转录方法依说明书进行;

c、PCR反应: 25μLPCR反应体系为10×PCR 缓冲液 2.5μL、浓度为25mM的MgCl2溶液1.5μL、浓度为10mM的dNTP液0.5μL、浓度为5U/μL的Taq酶液 0.5μL、浓度为25μM的上游引物溶液1μL、浓度为25μM的下游引物溶液1μL,上述PCR模板2μL,余量为灭菌去离子水;反应条件为:94℃预变性5min,94℃变性30s,55℃退火30s,72℃ 延伸1min,45个循环,72℃延伸7min,4℃保存PCR产物,上游引物溶液含有核苷酸序列为CATGTATGATTGATGGAGGAAATatgytngarwc的引物,下游引物溶液含有核苷酸序列为GATCATTTGGTGGTCCTTCAatrtcnancca的引物; 

d、琼脂糖凝胶电泳:将上述PCR产物用重量百分浓度1~1.5%的琼脂糖凝胶电泳检测目标条带,电泳电压100v,电泳时间30min,将电泳结果用凝胶成像系统分析,若结果出现408~429bp大小片段的条带,则为沙粒病毒科病毒。

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