[发明专利]用于检测CLCN1基因突变的方法、试剂盒及特异性引物有效
申请号: | 201310148494.3 | 申请日: | 2011-05-19 |
公开(公告)号: | CN103205503A | 公开(公告)日: | 2013-07-17 |
发明(设计)人: | 魏晓明;王金明 | 申请(专利权)人: | 深圳华大基因科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 | 代理人: | 李志东 |
地址: | 518083 广东省深圳市盐田*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 检测 clcn1 基因突变 方法 试剂盒 特异性 引物 | ||
1.一种非诊断目的检测CLCN1基因的编码区及内含子剪切位点突变的方法,其包括以下步骤:
(1)使用特异性扩增引物对通过PCR扩增待测样本的CLCN1基因,从而获得PCR扩增产物;
(2)采用所述特异性扩增引物对中的正向引物将步骤(1)中的扩增产物进行测序扩增,从而获得测序扩增产物;
(3)对步骤(2)中获得的测序扩增产物进行测序,并将测序峰图与数据库中的CLCN1基因参考序列进行对比,从而确定基因的突变位点。
2.权利要求1的方法,其中在步骤(1)和步骤(2)之间包括纯化PCR扩增产物的步骤,优选地,所述纯化方法为通过凝胶电泳和millipore纯化板进行纯化。
3.权利要求1的方法,其中在步骤(2)和步骤(3)之间还包括纯化所述测序扩增产物的步骤,优选地,所述纯化方法为通过EDTA和无水乙醇进行纯化。
4.权利要求1-3任一项的方法,其中在所述步骤(3)中测序方法为Sanger法或第二代测序法。
5.权利要求1-3任一项的方法,其中所述PCR扩增引物对的核苷酸序列是SEQ ID NO:1和16、SEQ ID NO:2和17、SEQ ID NO:3和18、SEQ ID NO:4和19、SEQ ID NO:5和20、SEQ ID NO:6和21、SEQ ID NO:7和22、SEQ ID NO:8和23、SEQ ID NO:9和24、SEQ ID NO:10和25、SEQ ID NO:11和26、SEQ ID NO:12和27、SEQ ID NO:13和28、SEQ ID NO:14和29、SEQ ID NO:15和30中的一对或多对,并且/或者所述测序扩增引物的核苷酸序列是SEQ ID NO:1-15中的一个或多个。
6.权利要求1-3任一项的方法,其中所述样品是血样,优选是分离自哺乳动物,特别是人的血样。
7.用于扩增CLCN1基因的特异性引物,其序列是SEQ ID NO:1-30中的任选一项。
8.权利要求7的特异性引物用于非诊断目的检测CLCN1基因突变位点的用途。
9.用于检测CLCN1基因突变位点的试剂盒,其包含用于扩增CLCN1基因的扩增引物,其核苷酸序列为SEQ ID NO:1和16、SEQ ID NO:2和17、SEQ ID NO:3和18、SEQ ID NO:4和19、SEQ ID NO:5和20、SEQ ID NO:6和21、SEQ ID NO:7和22、SEQ ID NO:8和23、SEQ ID NO:9和24、SEQ ID NO:10和25、SEQ ID NO:11和26、SEQ ID NO:12和27、SEQ ID NO:13和28、SEQ ID NO:14和29、SEQ ID NO:15和30中的一对或多对;和/或用于测序扩增的引物,其核苷酸序列为SEQ ID NO:1-15中的一个或多个,任选地,所述试剂盒还包括用于PCR扩增反应的酶和试剂,和/或用于测序扩增反应的酶和试剂,和/或用于提取血液DNA的试剂。
10.权利要求9的试剂盒用于非诊断目的检测CLCN1基因突变的用途。
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