[发明专利]一种分析真菌发酵过程中蛋白表达的方法有效
申请号: | 201310150061.1 | 申请日: | 2013-04-26 |
公开(公告)号: | CN103233060A | 公开(公告)日: | 2013-08-07 |
发明(设计)人: | 王春玲;赵国忠;王聪;侯丽华 | 申请(专利权)人: | 天津科技大学 |
主分类号: | C12Q1/37 | 分类号: | C12Q1/37 |
代理公司: | 天津盛理知识产权代理有限公司 12209 | 代理人: | 王来佳 |
地址: | 300457 天津市滨*** | 国省代码: | 天津;12 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 分析 真菌 发酵 过程 蛋白 表达 方法 | ||
1.一种分析真菌发酵过程中蛋白表达的方法,其特征在于:步骤如下:
⑴等电聚焦:收集发酵过程中菌丝体,PBS缓冲液洗涤3次,加入液氮研磨至粉末状,加入适量裂解液和50μg/ml DNase I、50 μg/ml RNase,混匀,冰浴15分钟,冰浴超声2分钟,14000 rpm,4度离心30分钟取上清,从冰箱中取出美国Bio-Rad公司的pH 4-7的IPG预制胶条,用溶胀缓冲液将胶条泡胀12小时;将胶条取出放入聚焦槽内,加入矿物油至没过上样杯,并用上样缓冲液稀释至170μl,对好正、负极,盖上盖子,MultiphorII电泳系统进行等电聚焦;
⑵平衡:聚焦结束的胶条先将胶条放入平衡缓冲液I水平振荡15分钟,再将胶条转入平衡缓冲液II水平振荡15分钟;
⑶第二向SDS-PAGE电泳:第二次平衡结束后,将胶条从样品盘中移出,放到已配好的12%的SDS-PAGE凝胶上端,并将marker放到凝胶的一端,再用0.5%的琼脂糖将胶条和marker封严,不能产生气泡,并将胶板固定于电泳槽内,加入电泳缓冲液,接通电源,15mA/胶恒流电泳15分钟,然后250v恒压电泳,待溴酚蓝达到底部边缘时即可停止电泳,电泳结束后,撬开两层玻璃,取出凝胶,将凝胶放入装有染色液的水平盘内振荡过夜进行染色,染色后,将凝胶浸于脱色液中,水平摇床振荡脱色;
⑷蛋白点的胶内酶解:①凝胶平铺于染色盘上,切下用于质谱检测的蛋白点,用50 μL去离子水将其吹入96孔PCR板的小孔中,吸出去离子水后加入50 μL脱色液;
②在50℃条件下振荡15 分钟,将脱色液吸出,重复一次,直至胶块完全呈无色状;
③加50 μL去离子水,50℃振荡15 分钟,洗去残留的脱色液和胶块中的离子;
④加30 μL乙腈,静置5-10 分钟,胶块变为白色后吸出乙腈,室温静置20 分钟,使乙腈挥发;
⑤在胶块上面加6-12 μL的酶解液,使酶解液没过胶块,封好PCR板,37℃振荡过夜酶解;
⑸MALDI-TOF 4700 Proteome Analyser质谱仪鉴定蛋白
①把质谱样品板洗干净抛光,然后用异丙醇去极性后晾干,备用;
②在质谱样品板四周边缘六个孔上都点上ABI公司校准液,在中间点样孔处点上0.3 μL酶解液后再点上0.3 μL质谱自带基质溶液自然混合,晾干;
③冷风吹去样品板上的灰尘杂质,放入质谱仪测定;
④美国ABI公司的GPS 3.5软件对质谱数据进行分析,米曲霉蛋白质数据库检索。
2.根据权利要求1所述的分析真菌发酵过程中蛋白表达的方法,其特征在于:所述裂解液成分为:8M尿素,2M硫脲,0.5% g/%ml,CHAPS,2% g/%ml美国Bio-Rad公司pH4-7两性电解质,1wt%DTT,1mM PMSF。
3.根据权利要求1所述的分析真菌发酵过程中蛋白表达的方法,其特征在于:所述溶胀缓冲液的成分为wt%:8M尿素,2M硫脲,0.5% CHAPS,0.52%美国Bio-Rad公司pH4-7两性电解质,0.02%溴酚蓝,1%DTT。
4.根据权利要求1所述的分析真菌发酵过程中蛋白表达的方法,其特征在于:所述的等点聚焦程序为:
。
5.根据权利要求1所述的分析真菌发酵过程中蛋白表达的方法,其特征在于:所述的上样缓冲液成分为wt%:8 mL 0.5 M Tris pH 6.8,6.4 mL甘油,12.8 mL 10% SDS,3.2 mL巯基乙醇,1.6 mL 0.05%溴酚蓝,超纯水32 mL。
6.根据权利要求1所述的分析真菌发酵过程中蛋白表达的方法,其特征在于:所述平衡缓冲液I成分为wt%:50mM Tris-HCl pH6.8,6M尿素,30%甘油,2% SDS,2%DTT,0.02%溴酚蓝;
所述平衡缓冲液II成分为wt%:50mM Tris-HCl pH6.8 ,6M尿素,30%甘油,2% SDS,2.5%IAA,0.02%溴酚蓝。
7.根据权利要求1所述的分析真菌发酵过程中蛋白表达的方法,其特征在于:所述染色液成分为wt%:10%硫酸铵,10%磷酸,0.12%G250,20%甲醇;所述脱色液配置方法为:3%冰醋酸溶液。
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