[发明专利]一种鉴定发酵酸面团中真菌菌相组成的方法有效
申请号: | 201310152748.9 | 申请日: | 2013-04-27 |
公开(公告)号: | CN103224986A | 公开(公告)日: | 2013-07-31 |
发明(设计)人: | 何国庆;张国华;柯乐芹;杨浣漪;刘同杰;朱立颖;王欣 | 申请(专利权)人: | 浙江大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04 |
代理公司: | 杭州天勤知识产权代理有限公司 33224 | 代理人: | 胡红娟 |
地址: | 310027 浙*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 鉴定 发酵 面团 真菌 组成 方法 | ||
1.一种鉴定发酵酸面团中真菌菌相组成的方法,包括:
(1)将发酵酸面团用淀粉酶酶解,得到酶解物;
(2)从酶解物中提取真菌总基因组DNA;
(3)以提取的真菌总基因组DNA为模板,利用带有GC夹子的真菌通用引物ITS5.8S与28S-1-GC进行第一轮PCR扩增;
(4)以第一轮PCR扩增后得到的阳性产物为模板,利用真菌通用引物ITS5.8S与28S-1进行第二轮PCR扩增;
(5)对第一轮PCR扩增和第二轮PCR扩增的产物进行分析,确定发酵酸面团中真菌菌相组成。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(1)中,所述的淀粉酶为α-淀粉酶。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(1)中,所述的发酵酸面团与淀粉酶的重量比为0.5:1-1:1。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(1)中,所述的酶解温度为60-65℃,时间为20-30min。
5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,提取真菌总基因组DNA后,将DNA的浓度调整为45-55ng/uL,再进行第一轮PCR扩增。
6.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(3)中,所述的第一轮PCR为降落PCR。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,降落PCR的反应条件:95℃预变性5min,然后在95℃变性30s,60℃引物复性1min,72℃引物延伸2min,循环20次,每循环一次,复性温度降低0.5℃;之后,95℃变性30s,50℃复性30s,72℃延伸2min,循环5次后72℃终延伸10min。
8.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(4)中,第二轮PCR的反应条件为:95℃预变性5min,然后在95℃变性30s,50℃引物复性30s,72℃引物延伸2min,循环4次,72℃终延伸10min。
9.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(5)中,所述的分析包括如下步骤:合并第一轮PCR扩增和第二轮PCR扩增的产物并纯化,然后进行变性梯度凝胶电泳分离,将得到的扩增条带进行染色、纯化、克隆测序,之后与标准菌序列比对,判定真菌种类。
10.根据权利要求9所述的方法,其特征在于,所述的变性梯度凝胶电泳的变性梯度为35%-65%,电泳电压为48-52V,电泳时间为12-13h。
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