[发明专利]一种快速检测黄牛SIRT1基因SNP的RFLP方法有效
申请号: | 201310169313.5 | 申请日: | 2013-05-06 |
公开(公告)号: | CN103290113A | 公开(公告)日: | 2013-09-11 |
发明(设计)人: | 陈宏;李明勋;孙晓梅;蓝贤勇 | 申请(专利权)人: | 西北农林科技大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 712100 *** | 国省代码: | 陕西;61 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 快速 检测 黄牛 sirt1 基因 snp rflp 方法 | ||
1.一种快速检测黄牛SIRT1基因启动子区SNP的RFLP方法,其特征在于:以黄牛血液基因组DNA为模板,以引物对P为引物,PCR扩增SIRT1基因启动子,再用限制性内切酶SmaI进行酶切PCR扩增产物,对酶切产物进行琼脂糖凝胶电泳检测,根据电泳结果鉴定黄牛SIRT1基因启动子区的单核苷酸多态性。
2.如权利要求1所述的检测黄牛SIRT1基因SNP的RFLP方法,其特征在于,所述的引物对P为:
上游引物F:5′-GTATAGTCCACGGGGTTACAG-3′,
下游引物R:5′-CCAAACTTGTCTTTCAGAGTC-3′。
3.如权利要求1所述的检测黄牛SIRT1基因SNP的RFLP方法,其中所述PCR扩增的反应程序为:94℃预变性5min;94℃变性30s,60℃退火30s,72℃延伸30s,33个循环;72℃延伸10min。
4.如权利要求1所述的检测黄牛SIRT1基因启动子区SNP的RFLP方法,其特征在于,所述的琼脂糖凝胶的质量浓度为3.0%。
5.如权利要求1所述的检测黄牛SIRT1基因启动子区SNP的RFLP方法,其特征在于:所述的SNP位点为C/G单核苷酸多态性,位于SIRT1基因转录起始位点-274位。
6.如权利要求1所述的检测黄牛SIRT1基因启动子区SNP的RFLP方法,其特征在于,SmaI酶切3.0%琼脂糖凝胶电泳检测后,电泳条带表现为:CC基因型表现为273bp,CG基因型表现为273bp、235bp和38bp,GG基因型表现为235bp和38bp。
7.权利要求1-6中任意一项权利要求所述的方法在作为辅助选择黄牛分子育种、从而加快良种选育速度中的应用。
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