[发明专利]病毒性出血性败血症病毒的RT-PCR检测试剂盒及其制备方法有效
申请号: | 201310172449.1 | 申请日: | 2013-05-10 |
公开(公告)号: | CN103215388A | 公开(公告)日: | 2013-07-24 |
发明(设计)人: | 陈新华;胡国海;敖敬群;母尹楠 | 申请(专利权)人: | 国家海洋局第三海洋研究所 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/68;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 厦门南强之路专利事务所(普通合伙) 35200 | 代理人: | 马应森 |
地址: | 361005 福*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 病毒性 血性 败血症 病毒 rt pcr 检测 试剂盒 及其 制备 方法 | ||
1.可特异性检测病毒性出血性败血症病毒的引物,其特征在于所述引物为:
VHSN-F:其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示;
VHSN-F:其核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。
2.病毒性出血性败血症病毒的RT-PCR检测试剂盒,其特征在于设有盒体、操作说明书和检测试剂;操作说明书和检测试剂设在盒体内,所述检测试剂包括裂解液、吸附液、洗涤液、DEPC处理水、反转录反应液、VHSV-PCR反应液、阳性对照和阴性对照。
3.如权利要求2所述病毒性出血性败血症病毒的RT-PCR检测试剂盒的制备方法,其特征在于包括以下步骤:
1)制备盒体;
2)配制检测试剂:
裂解液为:5mol/L盐酸胍,0.1mol/L EDTA,去离子水定容至1L,pH为8.0;
吸附液为:将5g玻璃粉放在25~30mL水中悬浮,然后再加入等体积的硝酸反应,最后重新加水悬浮即可;
洗涤液为:0.1mol/L氯化钠,1mmol/L EDTA,10mmol/L Tris-HCl,去离子水定容至1L,pH为7.5,再加入等体积的无水乙醇;
DEPC处理水:往超纯水中加入DEPC至终浓度为0.1%,振荡2h后,高温高压灭菌2次;
反转录反应液:每6μL反转录反应液含有1μL50mM VHSN-R引物;1μL dNTP混合物,每种dNTP浓度为10mM;2μL5×Primescript缓冲液;0.25μL RNase抑制剂;0.25μL逆转录酶,购自中国大连宝生物公司;0.3μL甘油;1.2μL DEPC处理水;
VHSV-PCR反应液:每18μL VHSV-PCR反应液含有1μL10mM VHSN-F引物;1μL10mMVHSN-F引物;1μL dNTP混合物,每种dNTP浓度为2.5mM;0.25μL Taq DNA聚合酶;2μL10×PCR缓冲液;1.5μL甘油;11.25μL双蒸水;
阴性对照:DEPC处理水;
阳性对照:将体外转录得到的VHSV核蛋白基因RNA片段稀释到104拷贝/μL所得溶液;
3)将操作说明书、裂解液、吸附液、洗涤液、DEPC处理水、反转录反应液、VHSV-PCR反应液、阳性对照和阴性对照置入盒体内,即得病毒性出血性败血症病毒的RT-PCR检测试剂盒。
4.如权利要求3所述病毒性出血性败血症病毒的RT-PCR检测试剂盒的制备方法,其特征在于在步骤2)中,所述阳性对照的制备方法如下:
(1)引物设计,具体方法为:
根据已获得的VHSV核蛋白基因序列,设计以下两条用于构建体外转录VHSV核蛋白基因RNA片段重组质粒pSP-VHSV的引物VHSV-long-F和VHSV-long-R,分别携带HindⅢ和BamHⅠ酶切位点:
VHSV-long-F:其核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示;
VHSV-long-R:其核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示;
(2)含有检测目的片段重组质粒pSP-VHSV的构建和作为阳性对照的RNA片段的制备,具体步骤为:
a)pSP-VHSV重组质粒的构建
使用VHSV-long-R作为反转录引物,将病毒RNA样品作为模板,经过反转录PCR反应,获得了目的片段,然后将获得的逆转录产物作为模板进行PCR扩增,将PCR产物回收后用HindⅢ和BamHⅠ内切酶做双酶切,再使用E.Z.N.A.TM Cycle Pure试剂盒(OMEGA,USA)回收酶切产物,然后将酶切产物连接到pSP64poly(A)(Promega,USA)载体上,转化至感受态E.coliDH5α中,筛选阳性克隆并测序验证;
b)体外转录获得作为阳性对照的RNA片段
提取构建好的pSP-VHSV质粒,EcoRI线性化后回收质粒,再用Promega体外转录试剂盒体外转录获得小RNA片段,用1.2%琼脂糖凝胶电泳和分光光度计检测RNA质量和浓度;根据RNA分子量确定单位体积RNA分子数,按10倍梯度稀释,分别稀释为1×106到1×101拷贝/μL,获得浓度梯度的阳性RNA片段。
5.如权利要求3所述病毒性出血性败血症病毒的RT-PCR检测试剂盒的制备方法,其特征在于在步骤2)中,所述硝酸的浓度为68%。
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