[发明专利]鹰嘴豆壳二孢叶枯病环介导等温扩增快速检测方法有效
申请号: | 201310186323.X | 申请日: | 2013-05-20 |
公开(公告)号: | CN103215375A | 公开(公告)日: | 2013-07-24 |
发明(设计)人: | 马德英;马丽娟;羌松 | 申请(专利权)人: | 新疆农业大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04;C12R1/645 |
代理公司: | 乌鲁木齐中科新兴专利事务所 65106 | 代理人: | 李静 |
地址: | 830052 新疆维*** | 国省代码: | 新疆;65 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 鹰嘴豆 壳二孢叶枯病环介导 等温 扩增 快速 检测 方法 | ||
1.一种鹰嘴豆壳二孢叶枯病环介导等温扩增快速检测方法,其特征在于按下列步骤进行:
a、待检样品或真菌的DNA提取:
采用常规真菌DNA提取方法提取待检样品核酸,其中提取样品DNA的OD260/OD280为1.6-2.0,浓度为10-100ng/μL;
b、进行鹰嘴豆壳二孢叶枯病真菌的环介导等温扩增反应:
在装有22μL环介导等温扩增反应液的反应管中加入2μL待检样品模板DNA和1μL Bst DNA聚合酶,于恒温65℃扩增反应30-60min,将温度调到80℃终止反应,3-5min后取出待检;
c、显色检测:在每个反应管中加入1μL显色剂,直接用肉眼观察颜色变化,反应液颜色变为绿色,即为待检样品中含有或为鹰嘴豆壳二孢叶枯病真菌。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于步骤b中环介导等温扩增反应液是由10×Thermopol反应缓冲液、1.0-1.4mmol/L脱氧核酸三磷酸基质、4-8mmol/L硫酸镁、0.8-1.6μmol/L上游内引物FIP、0.8-1.6μmol/L下游内引物BIP、0.2-0.3μmol/L上游外引物F3、0.2-0.3μmol/L下游外引物B3、0.2-0.8μmol/L上游环引物LF和0.2-0.8μmol/L下游环引物LB组成,其中:
上游外引物F3:5’-CTTGGTATTCCATGGGGCAT-3’;
下游外引物B3:5’-ACTTTTGGACGTCGTCGTTAT-3’;
上游内引物FIP:5’-GAGGCGAGACAAACACCCAACA-GCCTGTTCGAGCGTCATT-3’;
下游外引物BIP:5’-CGCCTTAAAACAATTGGCAGCCG-GAGTGCAAAGCGCGAGAT-3’;
上游环引物LF:5’-CCAAGCAAAGCTTGAAGGTACA-3’;
下游环引物LB:5’-GCGTATTGATTTCGGAGCGCAGT-3’。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于步骤b环介导等温扩增反应液中10×Thermopol反应缓冲液中含有200mmol pH8.8的三羟基甲基氨基甲烷-盐酸、100mmol/L氯化钾、100mmol/L硫酸铵、20mmol/L硫酸镁和1%曲拉通X-100。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于步骤b环介导等温扩增反应液中的脱氧核酸三磷酸基质由dUTP、dATP、dGTP和dCTP四种脱氧核糖核酸组成,其中四种脱氧核糖核酸的质量比为dUTP∶dATP∶dGTP∶dCTP=2∶1∶1∶1。
5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于步骤b中Bst DNA聚合酶为8U/μL。
6.根据权利要求1所述的方法,其特征在于步骤c中显色剂为10%的荧光染料SYBR GREEN I。
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