[发明专利]鹰嘴豆壳二孢叶枯病环介导等温扩增快速检测方法有效

专利信息
申请号: 201310186323.X 申请日: 2013-05-20
公开(公告)号: CN103215375A 公开(公告)日: 2013-07-24
发明(设计)人: 马德英;马丽娟;羌松 申请(专利权)人: 新疆农业大学
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12Q1/04;C12R1/645
代理公司: 乌鲁木齐中科新兴专利事务所 65106 代理人: 李静
地址: 830052 新疆维*** 国省代码: 新疆;65
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摘要:
搜索关键词: 鹰嘴豆 壳二孢叶枯病环介导 等温 扩增 快速 检测 方法
【权利要求书】:

1.一种鹰嘴豆壳二孢叶枯病环介导等温扩增快速检测方法,其特征在于按下列步骤进行:

a、待检样品或真菌的DNA提取:

采用常规真菌DNA提取方法提取待检样品核酸,其中提取样品DNA的OD260/OD280为1.6-2.0,浓度为10-100ng/μL;

b、进行鹰嘴豆壳二孢叶枯病真菌的环介导等温扩增反应:

在装有22μL环介导等温扩增反应液的反应管中加入2μL待检样品模板DNA和1μL Bst DNA聚合酶,于恒温65℃扩增反应30-60min,将温度调到80℃终止反应,3-5min后取出待检;

c、显色检测:在每个反应管中加入1μL显色剂,直接用肉眼观察颜色变化,反应液颜色变为绿色,即为待检样品中含有或为鹰嘴豆壳二孢叶枯病真菌。

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于步骤b中环介导等温扩增反应液是由10×Thermopol反应缓冲液、1.0-1.4mmol/L脱氧核酸三磷酸基质、4-8mmol/L硫酸镁、0.8-1.6μmol/L上游内引物FIP、0.8-1.6μmol/L下游内引物BIP、0.2-0.3μmol/L上游外引物F3、0.2-0.3μmol/L下游外引物B3、0.2-0.8μmol/L上游环引物LF和0.2-0.8μmol/L下游环引物LB组成,其中:

上游外引物F3:5’-CTTGGTATTCCATGGGGCAT-3’;

下游外引物B3:5’-ACTTTTGGACGTCGTCGTTAT-3’;

上游内引物FIP:5’-GAGGCGAGACAAACACCCAACA-GCCTGTTCGAGCGTCATT-3’;

下游外引物BIP:5’-CGCCTTAAAACAATTGGCAGCCG-GAGTGCAAAGCGCGAGAT-3’;

上游环引物LF:5’-CCAAGCAAAGCTTGAAGGTACA-3’;

下游环引物LB:5’-GCGTATTGATTTCGGAGCGCAGT-3’。

3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于步骤b环介导等温扩增反应液中10×Thermopol反应缓冲液中含有200mmol pH8.8的三羟基甲基氨基甲烷-盐酸、100mmol/L氯化钾、100mmol/L硫酸铵、20mmol/L硫酸镁和1%曲拉通X-100。

4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于步骤b环介导等温扩增反应液中的脱氧核酸三磷酸基质由dUTP、dATP、dGTP和dCTP四种脱氧核糖核酸组成,其中四种脱氧核糖核酸的质量比为dUTP∶dATP∶dGTP∶dCTP=2∶1∶1∶1。

5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于步骤b中Bst DNA聚合酶为8U/μL。

6.根据权利要求1所述的方法,其特征在于步骤c中显色剂为10%的荧光染料SYBR GREEN I。

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